More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0478 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
300 aa  619  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  71.23 
 
 
294 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  67.71 
 
 
294 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  67.71 
 
 
294 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  67.36 
 
 
296 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  33.79 
 
 
299 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  33.79 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 
294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51220  glycosyl transferase  32.88 
 
 
330 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00120111  hitchhiker  0.000215045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.98 
 
 
294 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 
283 aa  146  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  36.55 
 
 
309 aa  119  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 
727 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
337 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 
335 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 
235 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
1035 aa  106  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
342 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
322 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
289 aa  105  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 
313 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
268 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
338 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1508  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 
350 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142825  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
349 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
334 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
352 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1200  glycosyl transferase family 2  28.98 
 
 
319 aa  102  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0281003  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.3 
 
 
341 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
363 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
581 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
325 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 
597 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 
330 aa  99.8  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.67 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  29.67 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.67 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 
384 aa  97.4  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.48 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00201  glycosyl transferase  28.28 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 
1177 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
320 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 
353 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
333 aa  97.1  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.35 
 
 
326 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.57 
 
 
466 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 
313 aa  96.7  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
336 aa  95.9  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.2 
 
 
266 aa  95.9  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.81 
 
 
312 aa  95.5  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.68 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 
573 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
777 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 
544 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.15 
 
 
266 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 
374 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
1177 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
361 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
331 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2241  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
301 aa  92.8  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
306 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.58 
 
 
377 aa  92.4  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 
235 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 
327 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
292 aa  92.4  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.13 
 
 
367 aa  92.4  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 
398 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
347 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 
318 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
321 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 
334 aa  92  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
390 aa  91.3  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 
338 aa  90.9  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  37.4 
 
 
367 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.86 
 
 
326 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
332 aa  89.4  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
380 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
358 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 
321 aa  89.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.86 
 
 
326 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
291 aa  89  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
347 aa  89  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  32.78 
 
 
760 aa  89  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
326 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.73 
 
 
324 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  25.79 
 
 
272 aa  87.8  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.35 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 
344 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
303 aa  87  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
331 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
365 aa  86.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 
773 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1700  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
318 aa  86.3  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  28.49 
 
 
332 aa  85.9  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>