47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0342 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0342  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  337  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4141  hypothetical protein  62.42 
 
 		 188 aa  186  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4819  hypothetical protein  56.25 
 
 		 193 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0356  hypothetical protein  55.35 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5856  hypothetical protein  56.67 
 
 		 173 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.480656  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67640  hypothetical protein  55.33 
 
 		 173 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45870  hypothetical protein  51.97 
 
 		 169 aa  147  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3260  hypothetical protein  40.65 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67650  hypothetical protein  39.33 
 
 		 190 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5857  hypothetical protein  38.16 
 
 		 190 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  35.85 
 
 		 178 aa  90.9  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0341  hypothetical protein  33.53 
 
 		 207 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  31.76 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  31.76 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  34.19 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  32.9 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  34.19 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  34.84 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4142  hypothetical protein  33.77 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45880  hypothetical protein  32.28 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4470  hypothetical protein  31.41 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3559  hypothetical protein  35.26 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0768  hypothetical protein  29.01 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0260  hypothetical protein  31.21 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.454469  hitchhiker  0.00000127449 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  32.32 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4820  hypothetical protein  32.5 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0259  hypothetical protein  31.21 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4649  hypothetical protein  28.86 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.851642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0355  hypothetical protein  32.26 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0244  hypothetical protein  32.4 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3762  hypothetical protein  29.88 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  35.03 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  26.8 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3456  hypothetical protein  33.95 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0467663  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0399  hypothetical protein  29.24 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3486  hypothetical protein  25.3 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.160248 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  28.9 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0322  hypothetical protein  31.72 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2650  hypothetical protein  29.34 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3928  hypothetical protein  27.21 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  26.23 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0014  hypothetical protein  28.48 
 
 		 175 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.997944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1026  hypothetical protein  20.75 
 
 		 184 aa  41.6  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1247  M23/37 family peptidase  39.68 
 
 		 297 aa  41.6  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3301  hypothetical protein  39.66 
 
 		 145 aa  40.8  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2289  putative transmembrane protein  51.52 
 
 		 173 aa  40.8  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>