238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0333 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  81.3 
 
 		 511 aa  828    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  63.09 
 
 		 514 aa  676    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  63.28 
 
 		 514 aa  677    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  63.09 
 
 		 514 aa  676    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  86.84 
 
 		 511 aa  902    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  62.82 
 
 		 514 aa  679    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  63.09 
 
 		 514 aa  676    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4391  phosphoglyceromutase  62.77 
 
 		 520 aa  665    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  63.21 
 
 		 514 aa  681    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  85.04 
 
 		 510 aa  905    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  63.09 
 
 		 514 aa  676    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  63.01 
 
 		 514 aa  672    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  85.04 
 
 		 529 aa  907    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  61.19 
 
 		 509 aa  636    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  62.11 
 
 		 514 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  61.79 
 
 		 515 aa  661    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3050  phosphoglyceromutase  62.57 
 
 		 516 aa  657    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.583924  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 508 aa  1041    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  62.18 
 
 		 514 aa  663    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  80.71 
 
 		 511 aa  824    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  63.8 
 
 		 514 aa  679    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  86.05 
 
 		 511 aa  899    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  61.91 
 
 		 514 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  62.82 
 
 		 514 aa  680    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  63.01 
 
 		 514 aa  679    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  62.11 
 
 		 514 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  62.11 
 
 		 514 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  63.44 
 
 		 510 aa  659    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  63.41 
 
 		 514 aa  678    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  61.91 
 
 		 514 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  83.83 
 
 		 510 aa  852    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  62.38 
 
 		 510 aa  651    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  63.09 
 
 		 514 aa  676    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0494  phosphoglyceromutase  61.33 
 
 		 516 aa  657    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  63.21 
 
 		 514 aa  693    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2738  phosphoglyceromutase  61.98 
 
 		 510 aa  647    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000279445  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  64.64 
 
 		 511 aa  694    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  63.28 
 
 		 514 aa  678    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  63.21 
 
 		 514 aa  679    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  63.21 
 
 		 514 aa  679    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4021  phosphoglyceromutase  62.25 
 
 		 513 aa  664    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  82.23 
 
 		 515 aa  835    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  86.64 
 
 		 511 aa  900    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  63.21 
 
 		 514 aa  679    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  81.48 
 
 		 515 aa  854    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  63.09 
 
 		 514 aa  676    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  64.51 
 
 		 513 aa  686    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3211  phosphoglyceromutase  62.6 
 
 		 509 aa  665    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  62.5 
 
 		 519 aa  654    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  61.79 
 
 		 515 aa  661    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  61.79 
 
 		 515 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  63.09 
 
 		 514 aa  676    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  85.46 
 
 		 511 aa  867    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  63.01 
 
 		 514 aa  681    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  63.48 
 
 		 514 aa  674    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  63.67 
 
 		 514 aa  685    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  63.41 
 
 		 514 aa  684    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  60.35 
 
 		 525 aa  624  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0031  phosphoglyceromutase  57.59 
 
 		 517 aa  618  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0673  phosphoglyceromutase  59.54 
 
 		 552 aa  617  1e-175  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  58.43 
 
 		 519 aa  610  1e-173  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  58.43 
 
 		 519 aa  609  1e-173  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1431  phosphoglyceromutase  58.8 
 
 		 530 aa  607  9.999999999999999e-173  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  57.91 
 
 		 513 aa  600  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  57.28 
 
 		 517 aa  599  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0701  phosphoglyceromutase  58.65 
 
 		 552 aa  593  1e-168  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  55.01 
 
 		 512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0526  phosphoglyceromutase  57.56 
 
 		 509 aa  579  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.594564  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0684  phosphoglyceromutase  57.56 
 
 		 509 aa  579  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113328 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  56.66 
 
 		 505 aa  579  1e-164  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  54 
 
 		 517 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  52.58 
 
 		 525 aa  571  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  53.73 
 
 		 521 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  54.53 
 
 		 511 aa  561  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  53.79 
 
 		 518 aa  561  1e-158  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  54.01 
 
 		 512 aa  561  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  52.99 
 
 		 514 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  53.42 
 
 		 512 aa  557  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  54.9 
 
 		 513 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  55.69 
 
 		 510 aa  555  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  54.31 
 
 		 512 aa  555  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  54.78 
 
 		 514 aa  555  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0563  phosphoglyceromutase  52.59 
 
 		 514 aa  552  1e-156  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  55.88 
 
 		 512 aa  552  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  55.38 
 
 		 512 aa  554  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  53.52 
 
 		 516 aa  552  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  53.05 
 
 		 514 aa  553  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  54.6 
 
 		 512 aa  549  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  53.12 
 
 		 516 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  54.9 
 
 		 509 aa  548  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  53.83 
 
 		 509 aa  545  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  53.83 
 
 		 509 aa  545  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  53.83 
 
 		 509 aa  545  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  53.12 
 
 		 516 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  53.62 
 
 		 512 aa  545  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  53.71 
 
 		 518 aa  547  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  53.83 
 
 		 509 aa  545  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  52.52 
 
 		 516 aa  545  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  54.03 
 
 		 509 aa  547  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  53.83 
 
 		 509 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>