More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0277 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 143 aa  298  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  82.27 
 
 		 143 aa  246  7e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  76.3 
 
 		 147 aa  223  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  74.65 
 
 		 147 aa  221  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  65.03 
 
 		 143 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  60.14 
 
 		 149 aa  187  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  64.44 
 
 		 150 aa  184  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  61.15 
 
 		 150 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  59.15 
 
 		 175 aa  181  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  59.71 
 
 		 148 aa  181  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  58.33 
 
 		 144 aa  180  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  57.75 
 
 		 203 aa  177  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  57.86 
 
 		 153 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  62.77 
 
 		 142 aa  177  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  58.09 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  57.14 
 
 		 153 aa  174  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  59.85 
 
 		 181 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  59.85 
 
 		 149 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  59.85 
 
 		 149 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  59.85 
 
 		 181 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  59.85 
 
 		 149 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  59.85 
 
 		 149 aa  174  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  56.03 
 
 		 153 aa  172  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  56.94 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  54.17 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  56.43 
 
 		 145 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  55.64 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  56.43 
 
 		 145 aa  170  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  56.43 
 
 		 145 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  56.43 
 
 		 145 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  56.43 
 
 		 145 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  57.97 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  55.32 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  60.61 
 
 		 153 aa  168  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  54.29 
 
 		 153 aa  169  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  54.61 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  54.61 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  55.32 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  55.73 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  58.21 
 
 		 188 aa  167  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  55 
 
 		 145 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  55.71 
 
 		 147 aa  167  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  52.86 
 
 		 164 aa  165  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  54.79 
 
 		 147 aa  163  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  56.43 
 
 		 145 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  55.47 
 
 		 137 aa  163  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  55.56 
 
 		 160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  55.71 
 
 		 163 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  57.46 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  52.48 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  52.67 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  53.42 
 
 		 150 aa  157  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  54.35 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  53.15 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  57.14 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  51.13 
 
 		 138 aa  153  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  51.88 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  58.41 
 
 		 125 aa  147  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  45.65 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  47.92 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  46.38 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  45.65 
 
 		 146 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  44.93 
 
 		 146 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  48.94 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  48.23 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  44.78 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  44.78 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  44.78 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  44.83 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  41.72 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  42.03 
 
 		 149 aa  117  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  40 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  31.69 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  39.22 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  32.77 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  32.59 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  30.5 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  34.29 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  31.91 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 		 287 aa  71.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  31.85 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  32.61 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  28.37 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  29.27 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  30.89 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.45 
 
 		 285 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  30.6 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  25.18 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>