69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0156 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  100 
 
 
531 aa  1047    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  38.55 
 
 
516 aa  339  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  37.96 
 
 
516 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  38.16 
 
 
516 aa  336  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  37.96 
 
 
516 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  37.38 
 
 
516 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  30.75 
 
 
536 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  41.46 
 
 
618 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  35.07 
 
 
727 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  29.84 
 
 
531 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  34.69 
 
 
532 aa  83.2  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  31.87 
 
 
546 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
513 aa  79.7  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  29.03 
 
 
616 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  32.03 
 
 
544 aa  77  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2650  membrane protein-like  33.33 
 
 
593 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20544  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  27.59 
 
 
534 aa  71.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  30.36 
 
 
526 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  23.4 
 
 
507 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  32.09 
 
 
547 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  31.67 
 
 
658 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  32.81 
 
 
588 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
510 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  30.26 
 
 
528 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  29.74 
 
 
528 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  33.73 
 
 
492 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4896  hypothetical protein  28.83 
 
 
638 aa  64.7  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303518  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  30 
 
 
533 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  29.94 
 
 
533 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0152  hypothetical protein  29.68 
 
 
592 aa  62  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  26.72 
 
 
529 aa  62  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  28.36 
 
 
557 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  25.69 
 
 
517 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4315  hypothetical protein  29.13 
 
 
558 aa  60.5  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248191  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  30.38 
 
 
558 aa  60.1  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  26.52 
 
 
569 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5173  membrane protein-like protein  29.29 
 
 
486 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174477  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  27.27 
 
 
618 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25171  hypothetical protein  27.92 
 
 
506 aa  57  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  29.07 
 
 
729 aa  57  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  28.93 
 
 
546 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  28.93 
 
 
546 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  29.05 
 
 
605 aa  57  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2971  membrane-like protein  28.08 
 
 
544 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0765391 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0343  hypothetical protein  22.41 
 
 
470 aa  56.6  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.533347  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1177  beta-lactamase domain-containing protein  61.54 
 
 
98 aa  55.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0468  hypothetical protein  32.32 
 
 
526 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0677417  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  26.25 
 
 
726 aa  53.9  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  25.74 
 
 
535 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4444  hypothetical protein  29.04 
 
 
526 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  34.55 
 
 
592 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  34.55 
 
 
592 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2778  hypothetical protein  29.84 
 
 
513 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  29.59 
 
 
704 aa  50.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0213  hypothetical protein  29.38 
 
 
479 aa  50.1  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1642  hypothetical protein  35.06 
 
 
557 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3705  hypothetical protein  38.69 
 
 
508 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1616  hypothetical protein  35.06 
 
 
557 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2984  hypothetical protein  24.6 
 
 
543 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000954014  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0777  hypothetical protein  24.43 
 
 
564 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0133192  hitchhiker  0.00177112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  37.72 
 
 
1146 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  29.2 
 
 
563 aa  48.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4086  hypothetical protein  35.62 
 
 
494 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00423288  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  34.07 
 
 
1163 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8450  membrane protein-like protein  34.72 
 
 
506 aa  47  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11651  transmembrane protein  29.33 
 
 
565 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2543  membrane protein-like protein  33.58 
 
 
607 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379723  normal  0.0161261 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
483 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1555  membrane protein-like protein  32.32 
 
 
363 aa  43.5  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.914032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>