43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0096 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0096  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0041  hypothetical protein  73.42 
 
 		 77 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0151  hypothetical protein  69.62 
 
 		 77 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0105  hypothetical protein  63.29 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000414235 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0090  hypothetical protein  63.29 
 
 		 98 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0105  hypothetical protein  63.29 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0108  hypothetical protein  64.94 
 
 		 76 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72225  hitchhiker  0.00358532 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4456  hypothetical protein  57.14 
 
 		 76 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00720  hypothetical protein  56.41 
 
 		 77 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0060  hypothetical protein  56.41 
 
 		 77 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00480  hypothetical protein  55.84 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01140  hypothetical protein  55.13 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.147153  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0041  hypothetical protein  54.55 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0038  hypothetical protein  49.35 
 
 		 74 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0154  hypothetical protein  48.05 
 
 		 74 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0105  hypothetical protein  46.75 
 
 		 73 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0099  hypothetical protein  46.75 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0087  hypothetical protein  41.56 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0102  hypothetical protein  41.56 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0102  hypothetical protein  41.56 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000505882 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1926  hypothetical protein  37.5 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1611  hypothetical protein  40.98 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1670  hypothetical protein  40.98 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1602  putative outer membrane protein  40.98 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.985432 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1672  putative outer membrane protein  40.98 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.147833  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1839  putative outer membrane protein  40.98 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.549082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3604  hypothetical protein  33.78 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.476197  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2124  hypothetical protein  30.16 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3978  protein of unknown function DUF1161  37.88 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.234117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2295  hypothetical protein  36.21 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000298038 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01545  hypothetical protein  36.21 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2057  protein of unknown function DUF1161  36.21 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.927614  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1772  hypothetical protein  36.21 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1614  hypothetical protein  36.21 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2044  hypothetical protein  36.21 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1793  hypothetical protein  36.21 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1659  hypothetical protein  36.21 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01555  hypothetical protein  36.21 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.41179  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2047  hypothetical protein  34.25 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.58796  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2348  protein of unknown function DUF1161  37.1 
 
 		 99 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0734587  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1978  hypothetical protein  32.84 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1866  putative lipoprotein  32.84 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.380587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2287  hypothetical protein  36.36 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.581358  normal  0.963067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>