20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0095 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0095  putative lipoprotein  100 
 
 
139 aa  287  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2584  lipoprotein  62.14 
 
 
140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.968594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0091  putative lipoprotein  53.24 
 
 
137 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00428998 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0106  hypothetical protein  52.52 
 
 
137 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0109  lipoprotein  51.8 
 
 
137 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.655067  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0106  lipoprotein  51.8 
 
 
137 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000139404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0150  lipoprotein, putative  50 
 
 
144 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0042  putative lipoprotein  50 
 
 
162 aa  133  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4454  hypothetical protein  47.11 
 
 
139 aa  121  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00730  hypothetical protein  52.1 
 
 
145 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01160  hypothetical protein  43.07 
 
 
139 aa  100  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0061  putative lipoprotein  51.26 
 
 
145 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.704152  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01170  hypothetical protein  42.86 
 
 
138 aa  100  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0094  putative lipoprotein  37.68 
 
 
140 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0107  lipoprotein  35.77 
 
 
137 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0110  lipoprotein  36.5 
 
 
137 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.604629  normal  0.0221205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0092  putative lipoprotein  33.58 
 
 
137 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0107  hypothetical protein  33.58 
 
 
137 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0062  putative lipoprotein  38.69 
 
 
138 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00740  putative lipoprotein  37.96 
 
 
138 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal 
 
 
-
 
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