More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0092 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  100 
 
 		 216 aa  443  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  83.57 
 
 		 224 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  81.86 
 
 		 216 aa  363  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  82.63 
 
 		 237 aa  362  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  80.93 
 
 		 224 aa  361  6e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  76.28 
 
 		 215 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  69.48 
 
 		 221 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  69.48 
 
 		 221 aa  305  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  45.58 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  45.58 
 
 		 221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  52.68 
 
 		 222 aa  211  7e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  47.44 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  47.89 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  47.22 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  47.22 
 
 		 221 aa  204  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  47.22 
 
 		 221 aa  204  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  46.05 
 
 		 221 aa  203  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  46.76 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  45.58 
 
 		 221 aa  201  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  48.61 
 
 		 220 aa  197  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1301  HAD superfamily hydrolase  46.15 
 
 		 217 aa  192  5e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.193279  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  47.18 
 
 		 218 aa  191  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1248  putative phosphatase  45.64 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0320167  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  47.21 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  40.95 
 
 		 219 aa  171  5e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.01 
 
 		 217 aa  168  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  39.62 
 
 		 291 aa  153  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  36.36 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.31 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  37.32 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.31 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  36.28 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.32 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.49 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  37.85 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.49 
 
 		 220 aa  132  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  36.79 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  36.79 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  36.79 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  37.11 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.15 
 
 		 220 aa  128  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.56 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.79 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0621452  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.86 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.21 
 
 		 238 aa  122  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  37.02 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2284  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.49 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  34.29 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  31.46 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1536  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.06 
 
 		 223 aa  118  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.344514  normal  0.620103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0568  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.45 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.939008  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.82 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3621  HAD family hydrolase  36.17 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  30.64 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3563  hydrolase  32.08 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0795  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.07 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.6 
 
 		 228 aa  98.6  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.71 
 
 		 216 aa  94.7  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0469  phosphatase  31.25 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.876662  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  33.49 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.9 
 
 		 230 aa  86.3  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.66 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1603  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.05 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.699082  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  28.24 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.19 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0500332 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  26.76 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  27.64 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.29 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  26.57 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  26.73 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  26.73 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  26.73 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  30.27 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5280  HAD family hydrolase  29.11 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  27.96 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  27.52 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  27.88 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.81 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  28.71 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  26.82 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  26.09 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1355  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.05 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2641  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.03 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  27.52 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.17 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  32.03 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  26.7 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  28.37 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  27.83 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  28.97 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  23.15 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.97 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  29.9 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  30.5 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  25.81 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>