159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0072 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 359 aa  711    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  72.81 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  71.64 
 
 		 359 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0124  cytochrome oxidase assembly  75.39 
 
 		 359 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190927  normal  0.0274429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0129  cytochrome oxidase assembly  69.25 
 
 		 357 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.96534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01360  hypothetical protein  74.18 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0187  hypothetical protein  74.18 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  71.14 
 
 		 345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00950  Cytochrome oxidase assembly protein  69.7 
 
 		 356 aa  345  7e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  58.88 
 
 		 368 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  46.25 
 
 		 394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  48.01 
 
 		 335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  47.4 
 
 		 335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  53.33 
 
 		 339 aa  269  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  48.46 
 
 		 325 aa  266  5e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  47.9 
 
 		 353 aa  263  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  47.63 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  46.6 
 
 		 325 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  47.58 
 
 		 330 aa  249  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  46.44 
 
 		 326 aa  249  5e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  44.24 
 
 		 339 aa  249  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  50 
 
 		 348 aa  246  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  47.78 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  45.62 
 
 		 339 aa  242  9e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  43.5 
 
 		 363 aa  232  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  47.02 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  47.02 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  43.66 
 
 		 363 aa  230  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  46.71 
 
 		 325 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  47.37 
 
 		 325 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  43.2 
 
 		 363 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  46.2 
 
 		 327 aa  229  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  51.95 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  46.79 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  43.39 
 
 		 369 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  44.28 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  52.44 
 
 		 361 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  44.28 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  44.28 
 
 		 370 aa  222  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  44.28 
 
 		 369 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  43.98 
 
 		 369 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  48.95 
 
 		 342 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  43.98 
 
 		 369 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  43.98 
 
 		 369 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  43.98 
 
 		 369 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  45.94 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  44.28 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  44.28 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  48.4 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  44.28 
 
 		 370 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  45.45 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0629  putative cytochrome oxidase assembly protein  36.81 
 
 		 387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3997  cytochrome oxidase assembly  43.03 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04027  cytochrome oxidase assembly protein  38.44 
 
 		 387 aa  212  9e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  43.98 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  46.39 
 
 		 369 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  43.5 
 
 		 370 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  43.98 
 
 		 370 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  36.29 
 
 		 387 aa  209  8e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3798  cytochrome oxidase assembly  42.73 
 
 		 352 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3871  cytochrome oxidase assembly  42.73 
 
 		 352 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  40.53 
 
 		 396 aa  203  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  40.53 
 
 		 399 aa  202  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  37.27 
 
 		 387 aa  202  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  42.09 
 
 		 367 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  40.06 
 
 		 376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  41.69 
 
 		 367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  40.92 
 
 		 383 aa  195  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  41.54 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  43.99 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4383  cytochrome oxidase assembly  41.59 
 
 		 406 aa  193  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04006  cytochrome oxidase assembly  43.59 
 
 		 354 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  39.5 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  41.32 
 
 		 404 aa  189  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2711  cytochrome oxidase assembly  39.04 
 
 		 375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318505  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  41.94 
 
 		 391 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  41.46 
 
 		 398 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  45.87 
 
 		 356 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  41.88 
 
 		 407 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  39.4 
 
 		 373 aa  172  9e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4065  cytochrome oxidase assembly  38.46 
 
 		 506 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.328508  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  35.67 
 
 		 671 aa  106  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  29.72 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  25.94 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  35.32 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  26.71 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  26.71 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  27.59 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  30.65 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  28.94 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  27.76 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  31.72 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  28.35 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  31.79 
 
 		 285 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  26.84 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  26.48 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  32.31 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  29.32 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>