More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0060 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0060  zinc uptake regulation protein, putative  100 
 
 		 160 aa  326  8e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  84.38 
 
 		 161 aa  284  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  85 
 
 		 161 aa  284  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  83.75 
 
 		 161 aa  283  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  80.62 
 
 		 160 aa  275  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  80 
 
 		 160 aa  273  8e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  79.87 
 
 		 161 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  80.25 
 
 		 167 aa  261  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  80.25 
 
 		 167 aa  259  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  74.38 
 
 		 161 aa  253  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  83.58 
 
 		 135 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  57.86 
 
 		 163 aa  185  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  53.5 
 
 		 163 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  51.75 
 
 		 174 aa  169  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  52.67 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  49.68 
 
 		 162 aa  157  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  51.35 
 
 		 157 aa  157  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  46.79 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0313  ferric uptake regulator family protein  48.05 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3152  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  47.4 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.459101 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  48.3 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1911  ferric uptake regulator family protein  48.19 
 
 		 177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  50.68 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3615  ferric uptake regulator family protein  42.57 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0123339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  46.05 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  46.05 
 
 		 163 aa  133  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  42.5 
 
 		 164 aa  132  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2322  transctiptional regulator, putative  44.9 
 
 		 340 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.559268  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  47.83 
 
 		 163 aa  130  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3569  Zinc-uptake regulator, Zur  46.36 
 
 		 167 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  45.45 
 
 		 149 aa  130  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3252  ferric uptake regulator family protein  46.36 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0890854 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  45.39 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  45.33 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0691  transcriptional regulator, putative  46.21 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0867  FUR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  42.76 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 169 aa  128  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  47.55 
 
 		 218 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  47.55 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  42.11 
 
 		 169 aa  128  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1030  transcriptional regulator np20  44.83 
 
 		 266 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468809  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0184  ferric uptake regulator family protein  42.57 
 
 		 192 aa  127  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0654518  hitchhiker  0.00635481 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  40.62 
 
 		 177 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2461  FUR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 251 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0329  transcriptional regulator, putative  43.31 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0816853  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0075  FUR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0871  FUR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  40.62 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0627  FUR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1989  ferric uptake regulator family protein  46.21 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2599  ferric uptake regulator family protein  46.21 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2623  ferric uptake regulator family protein  46.21 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5930  ferric uptake regulator family protein  46.21 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1703  putative zinc uptake regulation protein  49.35 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.0208783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5586  ferric uptake regulator, Fur family  47.14 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0827067  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0247  ferric uptake regulator family protein  45.07 
 
 		 143 aa  122  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0718  ferric uptake regulator  48.23 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00407056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0698  ferric uptake regulator family protein  46.38 
 
 		 186 aa  120  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1888  ferric uptake regulator family protein  42.28 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0469325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  47.89 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0975  putative ferric uptake regulator, Fur family  45.58 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  41.45 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1172  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  45.27 
 
 		 197 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3179  ferric uptake regulator, Fur family protein  42.96 
 
 		 149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  39.6 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2336  ferric uptake regulator family protein  39.13 
 
 		 173 aa  117  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  39.6 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  40.13 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  40 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2033  FUR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.728485  normal  0.0108698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1045  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  44.59 
 
 		 197 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.806261  normal  0.0331742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  44.67 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  45.39 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0812  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  42.11 
 
 		 167 aa  114  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139641 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0255  ferric uptake regulator family protein  48 
 
 		 161 aa  113  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  40 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3248  transcriptional regulator, TrmB  46.83 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0836778  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0302  hypothetical protein  42.96 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0285  hypothetical protein  42.96 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0387  zinc uptake regulation protein  39.29 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183946  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1776  ferric uptake regulator family protein  40.69 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000166629 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3182  ferric uptake regulator family protein  40.27 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346814  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4894  ferric uptake regulator, Fur family  40.28 
 
 		 190 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.164543 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  39.42 
 
 		 169 aa  107  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  39.57 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  40.58 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  39.57 
 
 		 171 aa  104  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  41.3 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  41.3 
 
 		 172 aa  104  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  41.3 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3010  ferric uptake regulator family protein  38.52 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.184065 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  39.57 
 
 		 171 aa  103  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2788  putative zinc uptake regulation protein  37.5 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0412  zinc uptake regulation protein  40.85 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.338359  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5527  zinc uptake transcriptional repressor  39.86 
 
 		 171 aa  101  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.508187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0250  zinc uptake transcriptional repressor  41.73 
 
 		 186 aa  100  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4551  zinc uptake transcriptional repressor  39.13 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3947  ferric uptake regulator, Fur family  39.13 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4286  zinc uptake transcriptional repressor  39.13 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>