198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0052 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 213 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  80.29 
 
 		 210 aa  357  9e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  79.33 
 
 		 210 aa  354  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  79.23 
 
 		 214 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  78.74 
 
 		 214 aa  344  5e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  78.47 
 
 		 211 aa  341  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  77.4 
 
 		 210 aa  340  9e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  71.43 
 
 		 211 aa  320  8e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  70.95 
 
 		 211 aa  318  5e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  66.99 
 
 		 216 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  58.88 
 
 		 214 aa  263  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  43.65 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  41.71 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  40.38 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  44.68 
 
 		 212 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  44.68 
 
 		 212 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  44.68 
 
 		 212 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  44.68 
 
 		 212 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  44.68 
 
 		 212 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  44.68 
 
 		 212 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  44.68 
 
 		 212 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  43.09 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1975  DSBA oxidoreductase  40.69 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  45.18 
 
 		 213 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  45.18 
 
 		 213 aa  164  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  44.58 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.7 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  41.08 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.46 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  46 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  46 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  40.59 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  46 
 
 		 212 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 212 aa  158  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  40.11 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  43.75 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  42.77 
 
 		 275 aa  149  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1684  DSBA oxidoreductase  41.67 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04434  thiol:disulfide interchange protein  42.69 
 
 		 271 aa  147  9e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0775  DSBA oxidoreductase  39.33 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  38.94 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  38.21 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4488  DSBA oxidoreductase  35.94 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  35.21 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  37.3 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0671  DSBA oxidoreductase  37.29 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  38.82 
 
 		 260 aa  141  7e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0334  DSBA oxidoreductase  37.85 
 
 		 216 aa  141  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0345  DSBA oxidoreductase  37.85 
 
 		 216 aa  141  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  38.76 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  37.36 
 
 		 293 aa  137  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0416  DSBA oxidoreductase  36.72 
 
 		 218 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  33.52 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4247  putative thiol-disulfide interchange protein  38.2 
 
 		 212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0575  DSBA oxidoreductase  35.91 
 
 		 223 aa  134  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0186  DSBA oxidoreductase  35.96 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  37.65 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  33.81 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  35.12 
 
 		 214 aa  132  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  38.32 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  36.99 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  35.07 
 
 		 206 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  35.52 
 
 		 216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  35.07 
 
 		 206 aa  128  8.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  34.15 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  34.95 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  37.65 
 
 		 233 aa  125  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  38.55 
 
 		 218 aa  125  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0779  thiol:disulfide interchange protein  36.07 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0722  DSBA oxidoreductase  35.76 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0692  DSBA oxidoreductase  35.52 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.487009  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0435  DSBA oxidoreductase  35 
 
 		 218 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  31.01 
 
 		 204 aa  104  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  32.84 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  31.01 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  29.24 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0557  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.7 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.85 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0524  DSBA oxidoreductase  33.55 
 
 		 201 aa  95.5  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716965 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 		 203 aa  91.7  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 		 203 aa  91.7  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  30.53 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  29.81 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.95 
 
 		 214 aa  84.7  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  26.4 
 
 		 207 aa  85.1  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  30.36 
 
 		 203 aa  84.7  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.26 
 
 		 204 aa  84.7  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  28.83 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>