More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0042 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  90.38 
 
 		 442 aa  755    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  74.47 
 
 		 436 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  74.47 
 
 		 436 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  89.16 
 
 		 443 aa  810    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  74.47 
 
 		 436 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  74.47 
 
 		 436 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3834  glutamate/aspartate:proton symporter  74.09 
 
 		 438 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.918484  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  90.52 
 
 		 443 aa  819    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  75.41 
 
 		 438 aa  645    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  100 
 
 		 443 aa  880    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3946  glutamate/aspartate:proton symporter  74.09 
 
 		 438 aa  635    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0155  glutamate/aspartate:proton symporter  87.58 
 
 		 442 aa  735    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0153  glutamate/aspartate:proton symporter  87.81 
 
 		 442 aa  737    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  89.56 
 
 		 444 aa  784    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  89.33 
 
 		 444 aa  782    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  73.06 
 
 		 443 aa  648    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5090  glutamate/aspartate:proton symporter  88.94 
 
 		 442 aa  744    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  74.47 
 
 		 436 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  75.65 
 
 		 438 aa  645    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3920  glutamate/aspartate:proton symporter  73.86 
 
 		 438 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  74 
 
 		 437 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  74 
 
 		 437 aa  628  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2704  sodium:dicarboxylate symporter  74.94 
 
 		 438 aa  628  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  74 
 
 		 437 aa  629  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  74 
 
 		 437 aa  629  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  74 
 
 		 437 aa  629  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  74 
 
 		 437 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  73.5 
 
 		 438 aa  628  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  74 
 
 		 437 aa  629  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  74 
 
 		 437 aa  629  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  74 
 
 		 437 aa  629  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0277  glutamate/aspartate:proton symporter  74.47 
 
 		 437 aa  617  1e-176  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  62.06 
 
 		 422 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  64.69 
 
 		 423 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  63.47 
 
 		 423 aa  535  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  63.93 
 
 		 423 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  63.68 
 
 		 424 aa  535  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  63.23 
 
 		 423 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  64.15 
 
 		 424 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  63 
 
 		 423 aa  531  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  63.23 
 
 		 423 aa  532  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  63.23 
 
 		 423 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6252  sodium:dicarboxylate symporter  59.62 
 
 		 442 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  63.68 
 
 		 424 aa  533  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6468  sodium:dicarboxylate symporter  59.62 
 
 		 442 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955844  normal  0.0248013 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5604  sodium:dicarboxylate symporter  59.86 
 
 		 442 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5968  sodium:dicarboxylate symporter  59.86 
 
 		 442 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431964  hitchhiker  0.00472549 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2469  sodium:dicarboxylate symporter  63.68 
 
 		 421 aa  524  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0756  proton/sodium-glutamate symporter  60.85 
 
 		 421 aa  495  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0642378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  55.27 
 
 		 423 aa  490  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  54.33 
 
 		 423 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  54.57 
 
 		 423 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  54.57 
 
 		 423 aa  486  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  54.8 
 
 		 423 aa  487  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  54.57 
 
 		 423 aa  485  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  54.57 
 
 		 423 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  54.33 
 
 		 423 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  54.8 
 
 		 423 aa  487  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2071  sodium:dicarboxylate symporter  63.27 
 
 		 431 aa  486  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.840626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0742  proton/sodium-glutamate symport protein  62.24 
 
 		 421 aa  481  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000616985  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2416  sodium:dicarboxylate symporter  54.26 
 
 		 438 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  51.15 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1976  proton/sodium-glutamate symport protein  51.64 
 
 		 426 aa  427  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.809578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2408  sodium:dicarboxylate symporter  54.71 
 
 		 425 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.557751  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2455  sodium:dicarboxylate symporter  54.71 
 
 		 425 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2242  Sodium:dicarboxylate symporter  49.39 
 
 		 419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3346  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.16 
 
 		 438 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00211585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3294  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.16 
 
 		 420 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0209332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3697  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.98 
 
 		 420 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0331766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3597  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.16 
 
 		 420 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021811 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1620  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.11 
 
 		 420 aa  354  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000559641  hitchhiker  0.000636022 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3380  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.13 
 
 		 420 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1379  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.88 
 
 		 420 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0517  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.6 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.946656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2244  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.67 
 
 		 413 aa  348  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0602805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3604  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.63 
 
 		 420 aa  346  4e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3612  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.63 
 
 		 420 aa  346  4e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000454164  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  43.91 
 
 		 454 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1341  proton/glutamate symporter protein, C-terminus  67.93 
 
 		 238 aa  342  8e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000340093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1855  sodium:dicarboxylate symporter  42.07 
 
 		 414 aa  338  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  42.63 
 
 		 449 aa  332  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  43.86 
 
 		 447 aa  330  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.34 
 
 		 448 aa  328  9e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  41.76 
 
 		 442 aa  327  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  39.67 
 
 		 439 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  41.24 
 
 		 449 aa  325  7e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  41.13 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  41.13 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  41.13 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.27 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.82 
 
 		 436 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.44 
 
 		 447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  42.89 
 
 		 460 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  41.69 
 
 		 447 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  41.69 
 
 		 447 aa  320  5e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.55 
 
 		 451 aa  319  6e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.65 
 
 		 450 aa  319  7e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1364  sodium:dicarboxylate symporter  41.19 
 
 		 438 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.52 
 
 		 449 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>