172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0034 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03892  predicted transporter  63.06 
 
 		 543 aa  645    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3977  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  63.06 
 
 		 543 aa  645    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0145  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  82.25 
 
 		 552 aa  907    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610668  normal  0.131446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0118  Na/Pi cotransporter family protein  84.1 
 
 		 550 aa  882    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0069  Na+/Pi-cotransporter:Na/Pi cotransporter II-related  83.91 
 
 		 550 aa  897    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0034  Na/Pi cotransporter II-like  100 
 
 		 552 aa  1100    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148674  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4601  sodium-dependent inorganic phosphate  63.06 
 
 		 543 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4402  sodium-dependent inorganic phosphate  63.06 
 
 		 543 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433029  normal  0.437823 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72230  hypothetical protein  69.12 
 
 		 582 aa  738    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.785925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4527  sodium-dependent inorganic phosphate  63.06 
 
 		 543 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4010  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  63.06 
 
 		 543 aa  645    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0189192 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3770  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  63.75 
 
 		 548 aa  659    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4441  sodium-dependent inorganic phosphate  63.06 
 
 		 543 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5082  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  81.52 
 
 		 552 aa  903    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0387022 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03852  hypothetical protein  63.06 
 
 		 543 aa  645    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0223  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  63.06 
 
 		 543 aa  654    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4443  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  74.03 
 
 		 546 aa  771    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0163  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  82.61 
 
 		 552 aa  912    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5490  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  63.25 
 
 		 543 aa  646    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3948  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  63.57 
 
 		 548 aa  660    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00173095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6270  hypothetical protein  69.49 
 
 		 582 aa  741    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4524  sodium-dependent inorganic phosphate  63.06 
 
 		 543 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0767506  normal  0.405258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4473  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  63.06 
 
 		 543 aa  645    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4256  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  63.06 
 
 		 543 aa  645    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.471943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4564  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  63.06 
 
 		 543 aa  645    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4483  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  63.59 
 
 		 549 aa  679    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4514  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  63.06 
 
 		 543 aa  644    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0161  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  82.07 
 
 		 552 aa  907    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0371  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  62.11 
 
 		 548 aa  624  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01780  Na/Pi cotransporter II protein  65.73 
 
 		 568 aa  622  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0461  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  59.14 
 
 		 548 aa  599  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0751  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  60.49 
 
 		 570 aa  597  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0476826  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0218  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  57.22 
 
 		 562 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4205  Na+/phosphate symporter  58.7 
 
 		 565 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0511  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  58.27 
 
 		 561 aa  568  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.791872  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0365  Na/Pi cotransporter II-related  52.53 
 
 		 563 aa  558  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0312  Na/Pi cotransporter II-related  55.53 
 
 		 558 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3231  Na/Pi-cotransporter II-related protein  47.45 
 
 		 552 aa  488  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2737  Na/Pi-cotransporter II-related protein  46.57 
 
 		 556 aa  487  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751665  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3461  Na/Pi-cotransporter II-related protein  46.77 
 
 		 576 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3401  Na/Pi-cotransporter II-related protein  46.75 
 
 		 556 aa  487  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5386  Na/Pi-cotransporter II-related protein  45.79 
 
 		 577 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.626198  normal  0.600286 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1260  Na/Pi-cotransporter II-related protein  48.1 
 
 		 553 aa  472  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170885  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1104  Na/Pi-cotransporter II-related protein  48.58 
 
 		 559 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3851  Na/Pi cotransporter II-related  47.92 
 
 		 553 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1430  Na/Pi cotransporter II-related  44.99 
 
 		 548 aa  435  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2073  Na/Pi cotransporter II-related  40 
 
 		 563 aa  391  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3921  putative Na+/phosphate transporter  38.03 
 
 		 565 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0455  Na/Pi-cotransporter II-related protein  39.81 
 
 		 565 aa  351  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4873  Na+cotransporter  34.77 
 
 		 557 aa  320  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00339774  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4758  Na/Pi-cotransporter II-related protein  36.52 
 
 		 601 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554336  normal  0.516218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1871  Na/Pi cotransporter II-related  33.46 
 
 		 548 aa  312  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860374  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  35.14 
 
 		 548 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4223  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.79 
 
 		 562 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9037  hypothetical protein  35.33 
 
 		 561 aa  302  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1481  Na/Pi-cotransporter family protein  34.07 
 
 		 558 aa  299  8e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1437  Na/Pi-cotransporter family protein  33.88 
 
 		 558 aa  296  7e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0141  Na+/Pi-cotransporter  32.96 
 
 		 556 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1685  Na+ cotransporter  33.58 
 
 		 560 aa  293  7e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3965  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  36.53 
 
 		 547 aa  289  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.162548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1792  Na/Pi-cotransporter II-related protein  35.96 
 
 		 553 aa  287  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3286  hypothetical protein  38.95 
 
 		 561 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.969266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0855  Na+/Pi-cotransporter  33.27 
 
 		 548 aa  273  9e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2784  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  34.64 
 
 		 548 aa  272  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.407322 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4023  Na+/Pi-cotransporter  39.04 
 
 		 561 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3048  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  34.27 
 
 		 548 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7452  putative Na+/phosphate symporter  33.15 
 
 		 578 aa  263  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337065  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3291  putative Na+/phosphate symporter  39.23 
 
 		 564 aa  258  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  31.47 
 
 		 535 aa  235  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63750  hypothetical protein  35.88 
 
 		 555 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5541  hypothetical protein  36.47 
 
 		 555 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0969  Na+/Pi-cotransporter family protein  30.66 
 
 		 562 aa  230  4e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0614993  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0816  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  32.71 
 
 		 542 aa  227  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.568995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.81 
 
 		 567 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.91 
 
 		 563 aa  202  9e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.1 
 
 		 566 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000511336  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  24.21 
 
 		 537 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.62 
 
 		 558 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.09 
 
 		 556 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190084  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  23.65 
 
 		 537 aa  193  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.95 
 
 		 551 aa  179  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000107719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.91 
 
 		 643 aa  178  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.62 
 
 		 541 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.57 
 
 		 541 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0948  Na/Pi-cotransporter family protein  24.29 
 
 		 551 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000188119  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1501  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.18 
 
 		 539 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1672  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.02 
 
 		 565 aa  174  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0057  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.3 
 
 		 549 aa  173  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0512585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  23.95 
 
 		 551 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  23.57 
 
 		 551 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  23.57 
 
 		 551 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  23.57 
 
 		 551 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.8 
 
 		 536 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013552  decreased coverage  0.0000000000000784363 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  23.76 
 
 		 544 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000242556  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.57 
 
 		 541 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0840  Na/Pi-cotransporter family protein  23.95 
 
 		 551 aa  170  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0001183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  23.38 
 
 		 551 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000104541  decreased coverage  0.00000000000000521204 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2438  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.27 
 
 		 636 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0683  sodium-dependent phosphate transporter  23.38 
 
 		 551 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000253455  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.95 
 
 		 541 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>