More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_R0085 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_r00001  16S ribosomal RNA  95.1 
 
 		 1542 bp  2432    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.01898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00006  16S ribosomal RNA  95.24 
 
 		 1542 bp  2420    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0446208  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00010  16S ribosomal RNA  95.56 
 
 		 1542 bp  2460    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00367496  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00011  16S ribosomal RNA  95.24 
 
 		 1542 bp  2420    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0360816  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00014  16S ribosomal RNA  95.43 
 
 		 1542 bp  2472    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0514001  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00017  16S ribosomal RNA  95.43 
 
 		 1542 bp  2472    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0241491  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00020  16S ribosomal RNA  95.24 
 
 		 1542 bp  2420    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0003  16S ribosomal RNA  94.91 
 
 		 1530 bp  2409    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000874227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0027  16S ribosomal RNA  94.98 
 
 		 1530 bp  2389    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0078  16S ribosomal RNA  95.3 
 
 		 1530 bp  2442    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571707  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0090  16S ribosomal RNA  95.17 
 
 		 1530 bp  2426    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000103004  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0098  16S ribosomal RNA  95.17 
 
 		 1530 bp  2426    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000143523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0103  16S ribosomal RNA  95.1 
 
 		 1530 bp  2418    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00308735  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0113  16S ribosomal RNA  95.04 
 
 		 1530 bp  2424    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000562425  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r001  16S ribosomal RNA  89.81 
 
 		 1529 bp  1766    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r004  16S ribosomal RNA  89.81 
 
 		 1529 bp  1766    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r012  16S ribosomal RNA  89.81 
 
 		 1529 bp  1766    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r018  16S ribosomal RNA  89.81 
 
 		 1529 bp  1766    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r021  16S ribosomal RNA  89.81 
 
 		 1529 bp  1766    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r024  16S ribosomal RNA  89.81 
 
 		 1529 bp  1766    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r027  16S ribosomal RNA  89.81 
 
 		 1529 bp  1766    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0001  16S ribosomal RNA  89.82 
 
 		 1535 bp  1770    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000282718  hitchhiker  0.000910883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0007  16S ribosomal RNA  90.41 
 
 		 1535 bp  1842    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150491  normal  0.406366 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0016  16S ribosomal RNA  90.54 
 
 		 1535 bp  1857    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201681  hitchhiker  0.0000000136741 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0071  16S ribosomal RNA  90.61 
 
 		 1535 bp  1865    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00148247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0123  16S ribosomal RNA  90.54 
 
 		 1535 bp  1857    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0163335  normal  0.34966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0132  16S ribosomal RNA  90.54 
 
 		 1535 bp  1857    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0261242  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0136  16S ribosomal RNA  90.35 
 
 		 1535 bp  1834    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000885648  hitchhiker  0.000140032 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0140  16S ribosomal RNA  90.54 
 
 		 1535 bp  1857    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00248839  normal  0.547637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0143  16S ribosomal RNA  90.54 
 
 		 1535 bp  1857    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000577207  normal  0.0309772 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0001  16S ribosomal RNA  90.34 
 
 		 1535 bp  1848    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00134291  hitchhiker  0.00347665 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0007  16S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 1535 bp  1850    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0064778  normal  0.0127919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0016  16S ribosomal RNA  90.8 
 
 		 1535 bp  1889    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00459376  normal  0.131368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0020  16S ribosomal RNA  90.41 
 
 		 1535 bp  1842    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000189863  hitchhiker  0.00241785 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0026  16S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 1535 bp  1794    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0396739  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0071  16S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 1535 bp  1850    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00107251  normal  0.159667 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0123  16S ribosomal RNA  90.67 
 
 		 1535 bp  1873    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00322133  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0141  16S ribosomal RNA  90.61 
 
 		 1535 bp  1865    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00125257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0144  16S ribosomal RNA  89.89 
 
 		 1535 bp  1778    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0816172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0001  16S ribosomal RNA  89.95 
 
 		 1535 bp  1800    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0004  16S ribosomal RNA  89.88 
 
 		 1535 bp  1792    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000248814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0013  16S ribosomal RNA  89.95 
 
 		 1535 bp  1800    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0027  16S ribosomal RNA  89.95 
 
 		 1535 bp  1800    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000222685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0030  16S ribosomal RNA  89.95 
 
 		 1535 bp  1800    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000656968  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0061  16S ribosomal RNA  89.95 
 
 		 1535 bp  1800    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000486947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0121  16S ribosomal RNA  89.95 
 
 		 1535 bp  1800    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000475957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0128  16S ribosomal RNA  89.95 
 
 		 1535 bp  1800    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000157224  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0133  16S ribosomal RNA  89.95 
 
 		 1535 bp  1800    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000510938  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0001  16S ribosomal RNA  90.54 
 
 		 1555 bp  1857    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112036  hitchhiker  0.0000014858 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0007  16S ribosomal RNA  90.35 
 
 		 1555 bp  1834    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0012678  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0016  16S ribosomal RNA  90.67 
 
 		 1555 bp  1873    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251895  hitchhiker  0.00000000270434 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0069  16S ribosomal RNA  90.41 
 
 		 1555 bp  1842    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00426901  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0120  16S ribosomal RNA  90.41 
 
 		 1555 bp  1842    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0520691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0130  16S ribosomal RNA  90.28 
 
 		 1555 bp  1826    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0100831  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0136  16S ribosomal RNA  90.28 
 
 		 1555 bp  1826    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000629377  hitchhiker  0.000146985 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0140  16S ribosomal RNA  90.54 
 
 		 1555 bp  1857    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0143  16S ribosomal RNA  90.41 
 
 		 1555 bp  1842    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.328707  normal  0.910288 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0001  16S ribosomal RNA  89.96 
 
 		 1537 bp  1798    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00518638  normal  0.485409 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0004  16S ribosomal RNA  90.1 
 
 		 1537 bp  1800    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000279849  hitchhiker  0.00471183 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0014  16S ribosomal RNA  90.03 
 
 		 1537 bp  1792    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000324534  normal  0.0910098 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0019  16S ribosomal RNA  90.1 
 
 		 1537 bp  1800    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000962307  normal  0.557456 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0022  16S ribosomal RNA  90.1 
 
 		 1537 bp  1800    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00001194  unclonable  0.0000109151 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0050  16S ribosomal RNA  90.1 
 
 		 1537 bp  1800    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0125127  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0112  16S ribosomal RNA  90.17 
 
 		 1537 bp  1804    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000370609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0132  16S ribosomal RNA  90.03 
 
 		 1537 bp  1792    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000703057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0001  16S ribosomal RNA  89.97 
 
 		 1537 bp  1784    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000407555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0008  16S ribosomal RNA  90.1 
 
 		 1537 bp  1800    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000302643  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0022  16S ribosomal RNA  89.9 
 
 		 1537 bp  1780    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000152089  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0073  16S ribosomal RNA  90.1 
 
 		 1537 bp  1800    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000705466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0121  16S ribosomal RNA  89.9 
 
 		 1537 bp  1780    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0129  16S ribosomal RNA  89.9 
 
 		 1537 bp  1780    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000475348  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0138  16S ribosomal RNA  90.1 
 
 		 1537 bp  1800    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000622632  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0142  16S ribosomal RNA  89.97 
 
 		 1537 bp  1784    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000521528  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0007  16S ribosomal RNA  96.34 
 
 		 1545 bp  2567    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010889  decreased coverage  0.00540958 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0019  16S ribosomal RNA  96.54 
 
 		 1545 bp  2591    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000981314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0068  16S ribosomal RNA  96.34 
 
 		 1545 bp  2567    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000738133  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0088  16S ribosomal RNA  96.34 
 
 		 1545 bp  2567    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00544276  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0093  16S ribosomal RNA  96.34 
 
 		 1545 bp  2567    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0247267  decreased coverage  0.00226048 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0104  16S ribosomal RNA  96.34 
 
 		 1545 bp  2567    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000542682  decreased coverage  0.0046973 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0108  16S ribosomal RNA  96.6 
 
 		 1545 bp  2599    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0133586  normal  0.0202407 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0001  16S ribosomal RNA  89.82 
 
 		 1555 bp  1770    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000995354  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0068  16S ribosomal RNA  89.69 
 
 		 1555 bp  1768    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000082841  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0115  16S ribosomal RNA  89.82 
 
 		 1555 bp  1770    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0123  16S ribosomal RNA  89.76 
 
 		 1555 bp  1762    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0112353  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0241  16S ribosomal RNA  91.51 
 
 		 1536 bp  2004    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000165146  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2076  16S ribosomal RNA  91.64 
 
 		 1535 bp  2020    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000346352  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2332  16S ribosomal RNA  91.57 
 
 		 1535 bp  2012    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0176289  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2338  16S ribosomal RNA  91.44 
 
 		 1535 bp  1996    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000750964  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2460  16S ribosomal RNA  91.44 
 
 		 1535 bp  1996    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000585775  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2540  16S ribosomal RNA  91.51 
 
 		 1536 bp  2004    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000260054  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2706  16S ribosomal RNA  91.64 
 
 		 1536 bp  2020    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000399166  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2799  16S ribosomal RNA  91.44 
 
 		 1536 bp  1996    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000312291  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0001  16S ribosomal RNA  89.97 
 
 		 1537 bp  1770    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018503  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0006  16S ribosomal RNA  90.04 
 
 		 1537 bp  1778    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000817728  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0015  16S ribosomal RNA  90.1 
 
 		 1537 bp  1800    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00010598  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0019  16S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 1537 bp  1782    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000102694  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0027  16S ribosomal RNA  89.9 
 
 		 1537 bp  1790    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000499346  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0033  16S ribosomal RNA  89.97 
 
 		 1537 bp  1784    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.48131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0082  16S ribosomal RNA  89.97 
 
 		 1537 bp  1784    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000820075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0137  16S ribosomal RNA  89.97 
 
 		 1537 bp  1784    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00224733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>