222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4607 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  50.52 
 
 		 672 aa  703    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  50.52 
 
 		 672 aa  703    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  90.76 
 
 		 671 aa  1251    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  50.52 
 
 		 672 aa  703    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0269291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  54.07 
 
 		 665 aa  737    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  59.49 
 
 		 673 aa  824    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  50.52 
 
 		 672 aa  703    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  100 
 
 		 671 aa  1377    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  50.37 
 
 		 672 aa  703    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  59.49 
 
 		 673 aa  824    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  59.49 
 
 		 673 aa  824    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  50.52 
 
 		 672 aa  702    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  50.37 
 
 		 672 aa  700    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  46.3 
 
 		 724 aa  524  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4483  polysaccharide deacetylase  45.38 
 
 		 695 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367373  normal  0.863016 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3514  polysaccharide deacetylase  45.21 
 
 		 697 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000898006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3420  polysaccharide deacetylase  44.9 
 
 		 698 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  44.62 
 
 		 712 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  44.62 
 
 		 712 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4263  polysaccharide deacetylase  44.69 
 
 		 697 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4103  polysaccharide deacetylase  44.69 
 
 		 697 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.871871  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3997  polysaccharide deacetylase  44.58 
 
 		 697 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695216  normal  0.336374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1941  polysaccharide deacetylase  44.11 
 
 		 697 aa  497  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  43.3 
 
 		 640 aa  484  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  41.82 
 
 		 659 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  42.05 
 
 		 660 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  41.89 
 
 		 659 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0136  hemin storage protein  41.23 
 
 		 684 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.84788  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  38.43 
 
 		 673 aa  436  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  38.7 
 
 		 624 aa  435  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  39.37 
 
 		 628 aa  424  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  25.64 
 
 		 298 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  28.16 
 
 		 373 aa  107  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 		 319 aa  101  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 		 278 aa  99.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  25.4 
 
 		 306 aa  97.4  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  25.4 
 
 		 306 aa  97.4  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2105  polysaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 296 aa  95.1  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0828766  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  30.29 
 
 		 615 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  30.29 
 
 		 615 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.79 
 
 		 237 aa  92.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  28.46 
 
 		 279 aa  90.9  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  36.3 
 
 		 627 aa  87.8  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  27.76 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0711  xylanase/chitin deacetylase  25 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.485406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  26.23 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5025  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 548 aa  81.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  26.23 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  26.23 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  26.97 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  26.23 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4730  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 548 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  26.61 
 
 		 354 aa  80.5  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  24.07 
 
 		 319 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  34.07 
 
 		 645 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  24.41 
 
 		 282 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  26.77 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  24.57 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  22 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  25.73 
 
 		 256 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  22.18 
 
 		 271 aa  77  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4642  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.921462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  22.44 
 
 		 336 aa  76.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  25.19 
 
 		 357 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  26.86 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6214  polysaccharide deacetylase  26.38 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  23.74 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  21.97 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  26.74 
 
 		 264 aa  73.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  28.15 
 
 		 255 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0846  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 		 280 aa  72.4  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0340  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  25.6 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0441347  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  23.31 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  26.97 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  23.17 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  22.22 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  22.22 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 		 1015 aa  71.2  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  24.81 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  24.81 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  22.34 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  22.75 
 
 		 256 aa  70.5  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  28.51 
 
 		 316 aa  70.1  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  25.54 
 
 		 278 aa  69.3  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  25.54 
 
 		 256 aa  69.3  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  26.22 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  26.22 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  26.22 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  26.22 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  27.71 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.24 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  22.83 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  20.9 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 284 aa  67  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  25.86 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.52 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 272 aa  67  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  24.91 
 
 		 284 aa  67  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  26.79 
 
 		 409 aa  67  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  25.19 
 
 		 274 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>