49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4602 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4602  protein of unknown function DUF799  100 
 
 
219 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4281  hypothetical protein  95.89 
 
 
219 aa  430  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4223  protein of unknown function DUF799  77.98 
 
 
219 aa  357  6e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4014  protein of unknown function DUF799  79.36 
 
 
219 aa  341  5e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.741538  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1339  putative lipoprotein  70.05 
 
 
218 aa  315  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1451  hypothetical protein  70.05 
 
 
218 aa  315  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2721  putative lipoprotein  70.05 
 
 
218 aa  315  5e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1388  hypothetical protein  63.76 
 
 
219 aa  272  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1455  hypothetical protein  62.24 
 
 
225 aa  262  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01774  lipoprotein  59.28 
 
 
223 aa  261  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0155892  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0050  putative lipoprotein  59.36 
 
 
221 aa  261  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1252  lipoprotein, putative  62.04 
 
 
220 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3560  hypothetical protein  57.84 
 
 
221 aa  254  8e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2761  protein of unknown function DUF799  58.54 
 
 
224 aa  252  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.936694  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3429  hypothetical protein  56.4 
 
 
224 aa  250  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2389  hypothetical protein  56.88 
 
 
224 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3003  hypothetical protein  56.88 
 
 
224 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3022  hypothetical protein  56.88 
 
 
224 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2997  hypothetical protein  56.42 
 
 
224 aa  247  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657321  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5337  hypothetical protein  54.63 
 
 
219 aa  241  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232153  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5409  hypothetical protein  57.49 
 
 
220 aa  240  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2912  hypothetical protein  57.21 
 
 
221 aa  238  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21812  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2889  putative lipoprotein  60 
 
 
228 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3968  putative lipoprotein  60 
 
 
224 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3887  putative lipoprotein  60 
 
 
224 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.488572  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0107  putative lipoprotein  60 
 
 
228 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123438  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3465  putative lipoprotein  60 
 
 
224 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3084  putative lipoprotein  60 
 
 
224 aa  234  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1653  putative lipoprotein  60 
 
 
224 aa  234  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3204  putative lipoprotein  56.65 
 
 
224 aa  228  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00590  putative lipoprotein  60.95 
 
 
169 aa  207  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.592522  normal  0.156495 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1129  lipoprotein  45.24 
 
 
225 aa  177  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0269959  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0882  glycosyltransferase  47.44 
 
 
223 aa  175  4e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1495  lipoprotein  41.1 
 
 
224 aa  166  4e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.196072  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0423  protein of unknown function DUF799  39.07 
 
 
224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0394  putative lipoprotein  39.07 
 
 
231 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0422  protein of unknown function DUF799  38.41 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05523  hypothetical protein  35.91 
 
 
214 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4671  hypothetical protein  34.71 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195271  normal  0.101554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4118  hypothetical protein  29.91 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1766  hypothetical protein  33.81 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12485  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3789  hypothetical protein  33.94 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00728655  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2498  putative lipoprotein  26.97 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3264  lipoprotein, putative  34.09 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3169  lipoprotein, putative  28.12 
 
 
191 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3071  putative lipoprotein  27.34 
 
 
195 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1196  hypothetical protein  21.74 
 
 
449 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00854603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1992  hypothetical protein  23.53 
 
 
196 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1833  putative lipoprotein  29.08 
 
 
190 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>