More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4509 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  100 
 
 
97 aa  198  2e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  60.61 
 
 
99 aa  129  2e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  61.62 
 
 
99 aa  125  1e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  59.6 
 
 
99 aa  122  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  57.58 
 
 
99 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  61.62 
 
 
99 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  58.59 
 
 
99 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  58.59 
 
 
99 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  58.59 
 
 
99 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  58.59 
 
 
99 aa  120  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  58.59 
 
 
99 aa  119  1e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  55.32 
 
 
123 aa  117  4e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  57.58 
 
 
99 aa  117  4e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  57.58 
 
 
99 aa  117  4e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  56.57 
 
 
99 aa  117  5e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  57.14 
 
 
100 aa  116  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  55.56 
 
 
99 aa  115  1e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  56.57 
 
 
99 aa  115  2e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  55.21 
 
 
103 aa  112  2e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  53.61 
 
 
98 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  54.08 
 
 
98 aa  107  4e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  53.12 
 
 
96 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  50 
 
 
94 aa  102  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  52.53 
 
 
99 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  53.12 
 
 
268 aa  100  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  51.52 
 
 
99 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  52.53 
 
 
104 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  46.94 
 
 
99 aa  99.4  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  50.5 
 
 
104 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  50.5 
 
 
104 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  50 
 
 
104 aa  99  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  58.23 
 
 
88 aa  97.8  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  48.98 
 
 
99 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  47.92 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  47.47 
 
 
106 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  48.42 
 
 
102 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  3.52883e-05 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2296  ferredoxin (2Fe-2S)  53.09 
 
 
112 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4258  ferredoxin (2Fe-2S)  46.94 
 
 
99 aa  80.1  1e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1874  (2Fe-2S) ferredoxin  40.4 
 
 
106 aa  79.3  2e-14  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3940  ferredoxin (2Fe-2S)  46.94 
 
 
99 aa  78.6  2e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0654  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  42.35 
 
 
351 aa  76.3  1e-13  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  37.11 
 
 
105 aa  75.9  2e-13  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1567  ferredoxin (2Fe-2S)  39.18 
 
 
98 aa  75.9  2e-13  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703067  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  43.21 
 
 
105 aa  76.3  2e-13  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  43.21 
 
 
105 aa  76.3  2e-13  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  41.18 
 
 
350 aa  72.4  2e-12  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  38.3 
 
 
105 aa  71.6  3e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1089  ferredoxin (2Fe-2S)  37.76 
 
 
111 aa  70.9  5e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10664  predicted protein  39.02 
 
 
93 aa  70.5  7e-12  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00108435  normal  0.864403 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3274  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  45.9 
 
 
358 aa  70.1  1e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60541  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2622  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  45.9 
 
 
358 aa  69.7  1e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.367598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2635  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.54 
 
 
358 aa  69.3  1e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.0570519 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2485  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  45.9 
 
 
358 aa  70.1  1e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  41.67 
 
 
89 aa  68.9  2e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  34.04 
 
 
104 aa  68.6  2e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  41.67 
 
 
101 aa  68.6  3e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  39.71 
 
 
366 aa  68.6  3e-11  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  35.35 
 
 
121 aa  68.2  3e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  36.47 
 
 
122 aa  68.2  4e-11  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1059  ferredoxin (2Fe-2S)  36.96 
 
 
106 aa  68.2  4e-11  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1088  ferredoxin (2Fe-2S)  38.71 
 
 
106 aa  67.8  4e-11  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3739  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  43.08 
 
 
358 aa  67.8  5e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184178  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4806  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.73 
 
 
358 aa  67.4  6e-11  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.234643 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  39.13 
 
 
356 aa  67.4  6e-11  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3256  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 
681 aa  67  9e-11  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400269  normal  0.0118767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  40.74 
 
 
122 aa  66.6  1e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  37 
 
 
122 aa  66.2  1e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  37 
 
 
122 aa  66.2  1e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  38.82 
 
 
122 aa  66.2  1e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  1.66855e-11  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4884  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer component  42.11 
 
 
339 aa  65.9  2e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.217527  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  34.02 
 
 
113 aa  65.5  2e-10  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.89 
 
 
351 aa  65.5  2e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  35.35 
 
 
108 aa  65.5  2e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  36.17 
 
 
107 aa  65.5  2e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  39.51 
 
 
108 aa  65.1  3e-10  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3076  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.44 
 
 
352 aa  65.1  3e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.163455 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1389  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.16 
 
 
881 aa  64.7  4e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0387303  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1405  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.16 
 
 
881 aa  64.7  4e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1371  oxidoreductase FAD-binding region  38.16 
 
 
881 aa  64.7  4e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651375  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  40.24 
 
 
111 aa  64.7  4e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0932  ferredoxin  36.99 
 
 
358 aa  64.3  5e-10  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1828  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.5 
 
 
362 aa  64.3  5e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488384  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  38.36 
 
 
379 aa  64.3  5e-10  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5350  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.79 
 
 
340 aa  64.3  5e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.213773 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  38.27 
 
 
122 aa  64.3  6e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0651  ferredoxin  38.81 
 
 
353 aa  64.3  6e-10  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1779  ferredoxin  39.51 
 
 
129 aa  63.9  7e-10  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4285  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.36 
 
 
362 aa  63.2  1e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481656  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1577  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.43 
 
 
356 aa  63.2  1e-09  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1479  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.43 
 
 
356 aa  63.2  1e-09  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2253  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.43 
 
 
356 aa  63.2  1e-09  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2263  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.43 
 
 
356 aa  63.2  1e-09  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.379907  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  36.99 
 
 
380 aa  63.5  1e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  36.99 
 
 
380 aa  63.5  1e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  36.99 
 
 
381 aa  63.5  1e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  35.29 
 
 
109 aa  63.2  1e-09  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  38.24 
 
 
343 aa  63.2  1e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  37.04 
 
 
129 aa  62  2e-09  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.5 
 
 
385 aa  62.4  2e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  36.99 
 
 
380 aa  62.8  2e-09  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>