120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4412 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4412  protein of unknown function UPF0157  100 
 
 
166 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4131  hypothetical protein  88.34 
 
 
166 aa  274  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2507  protein of unknown function UPF0157  55.97 
 
 
171 aa  186  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.309459  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2738  hypothetical protein  46.63 
 
 
176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0940497  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3138  hypothetical protein  46.84 
 
 
171 aa  163  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2758  hypothetical protein  47.8 
 
 
170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.459788  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0069  hypothetical protein  43.12 
 
 
319 aa  139  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0246  hypothetical protein  39.74 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.643536  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1699  glutamate-rich protein  42.95 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.492225  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0490  hypothetical protein  42.95 
 
 
176 aa  139  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000708419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3352  protein YqkA  39.1 
 
 
176 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1029  hypothetical protein  42.04 
 
 
174 aa  136  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3929  hypothetical protein  43.31 
 
 
174 aa  135  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.283485  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3840  hypothetical protein  42.68 
 
 
174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4208  hypothetical protein  42.04 
 
 
174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4122  hypothetical protein  42.68 
 
 
174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502842 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1409  hypothetical protein  42.77 
 
 
318 aa  134  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4007  hypothetical protein  42.68 
 
 
174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.298552  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1584  hypothetical protein  42.14 
 
 
318 aa  134  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4320  hypothetical protein  42.68 
 
 
174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4167  hypothetical protein  43.31 
 
 
174 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3854  hypothetical protein  42.68 
 
 
174 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0669413  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1708  hypothetical protein  42.61 
 
 
192 aa  131  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2797  hypothetical protein  41.4 
 
 
174 aa  130  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4231  hypothetical protein  41.4 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0157  hypothetical protein  43.95 
 
 
176 aa  128  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0096  protein of unknown function UPF0157  43.23 
 
 
157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2000  hypothetical protein  42.58 
 
 
193 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2831  hypothetical protein  36.81 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00971649  normal  0.206362 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1757  hypothetical protein  42.59 
 
 
178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.334844  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_184  hypothetical protein  37.58 
 
 
176 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.682808  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0605  protein of unknown function UPF0157  40.65 
 
 
185 aa  106  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63380  hypothetical protein  37.34 
 
 
242 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.903165  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2828  hypothetical protein  30.52 
 
 
169 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117917  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1290  protein of unknown function UPF0157  36.65 
 
 
375 aa  93.2  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3103  hypothetical protein  35.95 
 
 
171 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0343219  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1655  protein of unknown function UPF0157  39.63 
 
 
191 aa  92.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2807  hypothetical protein  30.52 
 
 
172 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.062321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2591  hypothetical protein  30.52 
 
 
169 aa  90.9  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2779  hypothetical protein  30.52 
 
 
169 aa  90.9  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0119576  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2349  protein of unknown function UPF0157  33.55 
 
 
220 aa  90.9  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2788  hypothetical protein  29.87 
 
 
169 aa  90.9  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2542  hypothetical protein  32.19 
 
 
169 aa  90.5  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2508  hypothetical protein  32.19 
 
 
169 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0412  protein of unknown function UPF0157  34.39 
 
 
196 aa  89  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2583  hypothetical protein  30.32 
 
 
169 aa  88.2  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137167  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0920  hypothetical protein  38.16 
 
 
169 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2809  protein of unknown function UPF0157  40 
 
 
406 aa  87.8  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25920  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  34.55 
 
 
402 aa  87.8  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2985  hypothetical protein  33.33 
 
 
181 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0439608 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2708  hypothetical protein  33.99 
 
 
171 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.95734  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2494  hypothetical protein  32.72 
 
 
172 aa  85.5  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.021339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2505  hypothetical protein  28.48 
 
 
169 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0204  protein of unknown function UPF0157  39.29 
 
 
178 aa  84.7  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2637  glutamate-rich protein GrpB  30.57 
 
 
167 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000727014 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3224  hypothetical protein  27.71 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2671  glutamate-rich protein GrpB  29.87 
 
 
169 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.267173  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1571  hypothetical protein  36.94 
 
 
365 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.332111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2849  hypothetical protein  30.43 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0276112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2428  hypothetical protein  29.94 
 
 
170 aa  82  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000686386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2663  hypothetical protein  29.94 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000853592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4110  protein of unknown function UPF0157  35.62 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2784  glutamate-rich protein GrpB  30.28 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0346281 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2465  hypothetical protein  29.94 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.884514  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2646  hypothetical protein  29.94 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1483  hypothetical protein  36.36 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2714  hypothetical protein  29.94 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2389  hypothetical protein  29.94 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00719854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2673  hypothetical protein  29.3 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00128043  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3062  hypothetical protein  34.38 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25790  hypothetical protein  31.65 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0322  protein of unknown function UPF0157  30.54 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169012  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0552  hypothetical protein  29.81 
 
 
347 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5520  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  36.88 
 
 
394 aa  74.7  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0641  protein of unknown function UPF0157  33.33 
 
 
347 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000199394  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3053  protein of unknown function UPF0157  34.18 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2990  protein of unknown function UPF0157  30.52 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377938  normal  0.0790959 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  31.06 
 
 
601 aa  73.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2329  hypothetical protein  26.75 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  normal  0.089639 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0759  protein of unknown function UPF0157  31.01 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2729  protein of unknown function UPF0157  31.17 
 
 
170 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2072  protein of unknown function UPF0157  35.56 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3004  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  33.78 
 
 
385 aa  70.9  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3050  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  33.78 
 
 
385 aa  70.9  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4039  protein of unknown function UPF0157  37.09 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3353  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  32.56 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657332  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3559  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  32.56 
 
 
410 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.470533 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02587  hypothetical protein  34.86 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2751  protein of unknown function UPF0157  33.77 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02640  hypothetical protein  30.34 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.451354  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2069  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  32.57 
 
 
430 aa  68.2  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00862257  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12290  hypothetical protein  35.76 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3533  hypothetical protein  24.39 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3312  hypothetical protein  25 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.488113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3572  hypothetical protein  25 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.770902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3527  hypothetical protein  25.15 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3031  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  32.08 
 
 
404 aa  64.3  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000100967  hitchhiker  0.00205688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3764  dephospho-CoA kinase  35 
 
 
395 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0117276  normal  0.0914469 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3326  protein of unknown function UPF0157  28.66 
 
 
211 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3512  hypothetical protein  25.15 
 
 
175 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>