More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4397 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  55.68 
 
 
612 aa  669    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  57.43 
 
 
625 aa  684    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  55.85 
 
 
623 aa  669    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  55.72 
 
 
627 aa  661    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.59 
 
 
626 aa  692    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  56.34 
 
 
623 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  57.59 
 
 
625 aa  688    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0974  putative dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  52.21 
 
 
662 aa  644    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0802762  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  55.68 
 
 
612 aa  669    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0237  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  52.27 
 
 
673 aa  651    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  85.64 
 
 
640 aa  1057    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  55.63 
 
 
629 aa  672    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  57.26 
 
 
629 aa  661    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  57.24 
 
 
623 aa  681    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  83.25 
 
 
624 aa  1062    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  56.18 
 
 
623 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  56.18 
 
 
629 aa  671    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  54.99 
 
 
637 aa  647    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.06 
 
 
633 aa  696    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  56.18 
 
 
623 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  57.52 
 
 
633 aa  689    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  100 
 
 
623 aa  1273    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  56.01 
 
 
623 aa  669    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1112  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.25 
 
 
662 aa  654    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663685  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  56.93 
 
 
623 aa  690    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  56.84 
 
 
632 aa  677    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  57.83 
 
 
625 aa  679    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  56.01 
 
 
623 aa  671    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1361  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  52.27 
 
 
673 aa  651    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  55.02 
 
 
643 aa  653    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  55.77 
 
 
649 aa  673    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  55.28 
 
 
632 aa  666    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  55.41 
 
 
619 aa  658    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  55.71 
 
 
640 aa  685    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  56.34 
 
 
623 aa  670    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  54.75 
 
 
611 aa  650    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  55.7 
 
 
619 aa  647    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  55.95 
 
 
629 aa  682    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  57.75 
 
 
630 aa  674    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  57.57 
 
 
633 aa  691    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  56.18 
 
 
623 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  57.91 
 
 
634 aa  682    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  56.49 
 
 
640 aa  686    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  57.91 
 
 
634 aa  682    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  56.01 
 
 
623 aa  669    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  97.91 
 
 
623 aa  1246    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.33 
 
 
633 aa  692    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  56.18 
 
 
623 aa  672    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.5 
 
 
633 aa  680    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  56.34 
 
 
623 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  57.91 
 
 
634 aa  682    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1854  ATPase components of various ABC-type transport systems, contain duplicated ATPase  53.29 
 
 
664 aa  656    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  53.37 
 
 
619 aa  649    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  54.81 
 
 
631 aa  661    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  53.12 
 
 
609 aa  633  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  54.15 
 
 
611 aa  632  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  52.98 
 
 
611 aa  630  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  54.33 
 
 
611 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  51.82 
 
 
610 aa  626  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  53.12 
 
 
615 aa  625  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  51.62 
 
 
612 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.98 
 
 
611 aa  622  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8310  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.22 
 
 
620 aa  616  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  51.4 
 
 
601 aa  616  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.82 
 
 
617 aa  618  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  51.91 
 
 
597 aa  614  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2614  ABC transporter related  54 
 
 
595 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  52.48 
 
 
613 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  49.59 
 
 
606 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  52.03 
 
 
613 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  52.32 
 
 
609 aa  591  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.74 
 
 
610 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  50.08 
 
 
593 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  50.16 
 
 
592 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  49.91 
 
 
599 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  47.99 
 
 
620 aa  554  1e-156  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  46.21 
 
 
609 aa  551  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  48.26 
 
 
588 aa  549  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  49.1 
 
 
586 aa  547  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  48.93 
 
 
592 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  49.09 
 
 
592 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  50.18 
 
 
562 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.33 
 
 
596 aa  533  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  49.12 
 
 
568 aa  530  1e-149  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  45.2 
 
 
627 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.03 
 
 
619 aa  525  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  44.37 
 
 
617 aa  525  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  47.13 
 
 
578 aa  522  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  47.5 
 
 
583 aa  521  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  48.63 
 
 
586 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  45.45 
 
 
617 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3129  ABC transporter related  46.73 
 
 
582 aa  510  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  47.83 
 
 
571 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  44.87 
 
 
624 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  49.55 
 
 
545 aa  499  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0950  ABC transporter related  46.3 
 
 
571 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.331965  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  47.56 
 
 
576 aa  501  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  46.33 
 
 
563 aa  496  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.89 
 
 
599 aa  496  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2773  ABC transporter, ATPase subunit  47.24 
 
 
558 aa  498  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>