More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4332 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4332  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
238 aa  478  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.236556  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  94.54 
 
 
238 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  67.23 
 
 
232 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  56.38 
 
 
239 aa  251  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  56.38 
 
 
239 aa  251  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2288  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.52 
 
 
255 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.018697  decreased coverage  0.0000321635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2482  TonB system transport protein ExbB  59.52 
 
 
242 aa  245  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378751  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0219  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.82 
 
 
241 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.748984  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0270  biopolymer transport protein ExbB, putative  59.62 
 
 
235 aa  241  9e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.62 
 
 
235 aa  241  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.26 
 
 
239 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21700  ExbB proton channel  59.72 
 
 
236 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.798679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08070  ExbB proton channel  59.72 
 
 
236 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0296  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.8 
 
 
239 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0686936 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21820  ExbB proton channel  60.68 
 
 
236 aa  238  8e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.61 
 
 
234 aa  235  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.9 
 
 
244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.89 
 
 
240 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.47 
 
 
230 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0673  TonB system transport protein ExbB  50.5 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649257  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.48 
 
 
238 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
238 aa  174  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
238 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  46.04 
 
 
218 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.256552  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0669  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.05 
 
 
218 aa  149  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1755  biopolymer transport ExbB protein  40.7 
 
 
307 aa  145  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.449833 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.35 
 
 
301 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.876301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0877  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 
249 aa  142  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0394331  normal  0.0815705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1021  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 
249 aa  142  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00477503  normal  0.0346927 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1120  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.82 
 
 
286 aa  142  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.5 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0712  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.5 
 
 
250 aa  139  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0154333 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1048  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.13 
 
 
254 aa  138  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0010  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.98 
 
 
254 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.686858  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2590  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.46 
 
 
250 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000318132 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.2 
 
 
246 aa  136  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0010  biopolymer transport ExbB protein  37.98 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3312  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.89 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0814  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.82 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03475  biopolymer transport ExbB protein  39.81 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.62 
 
 
253 aa  135  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.4 
 
 
223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0009  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.65 
 
 
253 aa  134  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486785 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.89 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1115  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.81 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.955363  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3141  biopolymer transport transmembrane protein, MotA/TolQ/ExbB like  38.81 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346915  normal  0.0492826 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2407  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.89 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18242  normal  0.658816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.8 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.71 
 
 
239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00179933  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.7 
 
 
224 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.9 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3382  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.7 
 
 
238 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129068 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.8 
 
 
243 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1946  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.81 
 
 
243 aa  131  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  38.24 
 
 
227 aa  131  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.73 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.36409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.39 
 
 
242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0695018  hitchhiker  0.0010528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3519  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.3 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1806  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.59 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.5 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4623  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.69 
 
 
240 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89868  hitchhiker  0.000034158 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  38.31 
 
 
224 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  35.27 
 
 
257 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.27 
 
 
247 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  35.27 
 
 
257 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5007  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.36 
 
 
304 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1793  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.71 
 
 
242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.73 
 
 
301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471993  normal  0.437872 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  38.31 
 
 
224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.82 
 
 
355 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.899093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.81 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4497  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.12 
 
 
242 aa  128  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6362  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.73 
 
 
303 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413769  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3719  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.69 
 
 
247 aa  128  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.561641  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1716  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.73 
 
 
303 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.71 
 
 
242 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.63 
 
 
225 aa  129  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  37.93 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4695  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.27 
 
 
303 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4355  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.3 
 
 
262 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.11 
 
 
243 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  36 
 
 
245 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.56 
 
 
311 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.73 
 
 
301 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2999  biopolymer transport transmembrane protein, ExbB/TolQ  36.6 
 
 
301 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  37.76 
 
 
223 aa  125  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  38.31 
 
 
225 aa  125  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1077  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.12 
 
 
243 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 
246 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.07 
 
 
268 aa  125  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0688  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.29 
 
 
307 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.12 
 
 
243 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.12 
 
 
243 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0618  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36 
 
 
242 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948348  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5878  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.62 
 
 
244 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2224  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.62 
 
 
244 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.62 
 
 
244 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1566  Tol-Pal system, TolQ  42.53 
 
 
263 aa  123  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000967145 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.5 
 
 
233 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371376  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0521  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36 
 
 
242 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>