118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4256 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4256  type VI secretion system effector, Hcp1 family  100 
 
 
172 aa  362  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0344  type VI secretion system effector, Hcp1 family  98.84 
 
 
172 aa  360  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1606  type VI secretion system effector, Hcp1 family  97.67 
 
 
172 aa  358  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2697  type VI secretion system effector, Hcp1 family  97.67 
 
 
172 aa  358  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0054  type VI secretion system effector, Hcp1 family  96.51 
 
 
172 aa  357  5e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3239  type VI secretion system effector, Hcp1 family  95.93 
 
 
172 aa  353  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0647  type VI secretion system effector, Hcp1 family  95.93 
 
 
172 aa  353  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0061  type VI secretion system effector, Hcp1 family  94.19 
 
 
172 aa  350  4e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0417  type VI secretion system effector, Hcp1 family  92.44 
 
 
172 aa  345  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1163  type VI secretion system effector, Hcp1 family  92.44 
 
 
172 aa  345  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1501  type VI secretion system effector, Hcp1 family  92.44 
 
 
172 aa  345  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2558  type VI secretion system effector, Hcp1 family  92.44 
 
 
172 aa  345  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2826  type VI secretion system effector, Hcp1 family  92.44 
 
 
172 aa  345  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0180  hypothetical protein  86.63 
 
 
172 aa  327  5.0000000000000004e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2514  Hcp1 family type VI secretion system effector  82.56 
 
 
172 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.908248  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0312  hypothetical protein  80.23 
 
 
172 aa  311  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3906  hypothetical protein  80.23 
 
 
172 aa  311  2.9999999999999996e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0385  Hcp1 family type VI secretion system effector  80.23 
 
 
172 aa  311  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0058  hypothetical protein  80.81 
 
 
172 aa  305  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0241  hypothetical protein  81.4 
 
 
172 aa  305  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0243  hypothetical protein  81.4 
 
 
172 aa  305  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0249  hypothetical protein  81.4 
 
 
172 aa  305  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1113  hcp  80.81 
 
 
172 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1233  hypothetical protein  80.81 
 
 
172 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.189483 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1025  hcp protein  77.91 
 
 
172 aa  294  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0116  hcp protein  77.33 
 
 
172 aa  294  5e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3233  Hcp1 family type VI secretion system effector  76.47 
 
 
171 aa  286  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1182  hypothetical protein  72.09 
 
 
172 aa  272  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1211  hypothetical protein  72.09 
 
 
172 aa  272  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1195  hypothetical protein  72.09 
 
 
172 aa  271  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2615  hcp protein  72.78 
 
 
171 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0191752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4082  hcp protein  72.78 
 
 
171 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000915297 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2118  hypothetical protein  72.94 
 
 
171 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1153  Hcp1 family type VI secretion system effector  71.6 
 
 
171 aa  267  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465729  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1188  secreted protein Hcp  62.28 
 
 
173 aa  228  3e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0533  type VI secretion system effector, Hcp1 family  98.15 
 
 
124 aa  226  9e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4487  hypothetical protein  59.88 
 
 
172 aa  225  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5435  secreted protein Hcp  59.41 
 
 
172 aa  220  9e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2328  hypothetical protein  58.82 
 
 
171 aa  220  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2045  hypothetical protein  58.24 
 
 
171 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03240  secreted protein Hcp  60 
 
 
172 aa  217  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000126332  hitchhiker  9.98491e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43070  secreted protein Hcp  60 
 
 
172 aa  217  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000428975  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44890  secreted protein Hcp  60 
 
 
172 aa  217  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00654526  normal  0.188551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69560  secreted protein Hcp  60 
 
 
172 aa  217  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00260129  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1247  secreted protein Hcp  59.41 
 
 
172 aa  216  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000449  Hcp protein  53.49 
 
 
172 aa  203  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000134513  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1357  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  52.33 
 
 
172 aa  198  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1202  secreted protein Hcp-1 (haemolysin co-regulated protein)  51.16 
 
 
173 aa  197  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_35  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  52.33 
 
 
172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05871  hypothetical protein  53.01 
 
 
166 aa  192  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2539  secreted protein Hcp  40 
 
 
171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0301409  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0868  hcp protein  35.5 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3174  hcp protein  34.32 
 
 
161 aa  123  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0280  hypothetical protein  34.91 
 
 
161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5212  hypothetical protein  36.31 
 
 
161 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1626  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.88 
 
 
161 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5261  hypothetical protein  32.53 
 
 
161 aa  103  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3506  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.93 
 
 
159 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3644  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.33 
 
 
159 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0619  hypothetical protein  31.93 
 
 
161 aa  101  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4078  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.94 
 
 
159 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2696  type VI secretion system effector, Hcp1 family  33.93 
 
 
159 aa  99.4  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0741  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.91 
 
 
155 aa  98.6  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.155948  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0441  type VI secretion system effector, Hcp1 family  33.95 
 
 
159 aa  97.1  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4049  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.33 
 
 
157 aa  96.3  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0731  hypothetical protein  32.87 
 
 
163 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2506  hypothetical protein  32.87 
 
 
163 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0803  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.87 
 
 
163 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0782  hypothetical protein  32.17 
 
 
163 aa  94.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2816  hypothetical protein  33.81 
 
 
161 aa  94  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3645  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.87 
 
 
161 aa  94  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265959  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3256  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.87 
 
 
167 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3128  hypothetical protein  31.47 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0171  hypothetical protein  32.17 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104194 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2981  hypothetical protein  32.17 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000297859 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0159  hypothetical protein  30.54 
 
 
161 aa  92.4  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354123  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1198  hypothetical protein  33.53 
 
 
159 aa  92  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141696  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2983  hypothetical protein  31.95 
 
 
159 aa  92  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0406  hypothetical protein  33.53 
 
 
159 aa  92  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191771  hitchhiker  0.0000230132 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1304  Hcp1 family type VI secretion system effector  33.53 
 
 
159 aa  92  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.543696  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3060  Hcp1 family type VI secretion system effector  31.95 
 
 
159 aa  92  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3977  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.34 
 
 
159 aa  91.3  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1885  hypothetical protein  31.95 
 
 
190 aa  90.9  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0109727  hitchhiker  0.0000606082 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0251  Hcp1 family type VI secretion system effector  33.33 
 
 
159 aa  90.9  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0013  secreted protein Hcp, potential oxidative stress protein  31.36 
 
 
172 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1788  hypothetical protein  29.52 
 
 
163 aa  87.8  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4027  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.74 
 
 
159 aa  86.7  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1346  hypothetical protein  30.95 
 
 
159 aa  85.9  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1459  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.95 
 
 
159 aa  85.9  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.303873  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0574  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.13 
 
 
182 aa  85.5  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.237126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0224  hypothetical protein  29.24 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.156413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0226  hypothetical protein  29.24 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2272  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.14 
 
 
159 aa  80.5  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0019  hypothetical protein  29.22 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.965697  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3004  hypothetical protein  32.58 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00118578  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1216  HNH endonuclease domain-containing protein  30.54 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.516867  normal  0.131262 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4093  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.74 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1588  hypothetical protein  26.9 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00504704  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3284  hcp  65.22 
 
 
66 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.360217  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1097  type VI secretion system effector, Hcp1 family  29.52 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>