152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4190 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4190  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 358 aa  740    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.99 
 
 		 339 aa  348  7e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.3 
 
 		 367 aa  332  5e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.02 
 
 		 367 aa  327  3e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3025  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.6 
 
 		 362 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0651  hypothetical protein  36.6 
 
 		 362 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3044  hypothetical protein  36.6 
 
 		 362 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00567  predicted oxidoreductase  36.93 
 
 		 362 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00556  hypothetical protein  36.93 
 
 		 362 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730411  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0685  hypothetical protein  36.6 
 
 		 362 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0620  hypothetical protein  36.96 
 
 		 362 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0502  hypothetical protein  36.27 
 
 		 362 aa  160  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0655  hypothetical protein  37.58 
 
 		 362 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0620  hypothetical protein  36.27 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0714  hypothetical protein  37.58 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0760  hypothetical protein  37.58 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0641  hypothetical protein  37.58 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.41 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  34.72 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  34.72 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  32.8 
 
 		 367 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652154 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  32.8 
 
 		 367 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 		 367 aa  153  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  32.8 
 
 		 367 aa  153  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  32.8 
 
 		 367 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  32.8 
 
 		 367 aa  153  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  32.8 
 
 		 367 aa  153  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  32.8 
 
 		 367 aa  153  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  32.8 
 
 		 367 aa  153  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  34.38 
 
 		 367 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  34.38 
 
 		 367 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  34.38 
 
 		 367 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 385 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  34.03 
 
 		 367 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1134  hypothetical protein  37.64 
 
 		 362 aa  146  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.99 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.47 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 		 373 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.61 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  28.57 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  30.13 
 
 		 366 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  29.63 
 
 		 369 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  29.63 
 
 		 369 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  29.63 
 
 		 369 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2422  hypothetical protein  35.74 
 
 		 363 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3080  hypothetical protein  35.74 
 
 		 363 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2519  hypothetical protein  35.74 
 
 		 363 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113395  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  29.63 
 
 		 369 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  34.78 
 
 		 364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  34.78 
 
 		 364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 		 384 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.59 
 
 		 373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.76 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  32.83 
 
 		 359 aa  133  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5962  iron-containing alcohol dehydrogenase  31 
 
 		 365 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.05 
 
 		 364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2371  hypothetical protein  37.55 
 
 		 362 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0772  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.81 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.277229  normal  0.0195639 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.62 
 
 		 360 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  30.03 
 
 		 362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  30.75 
 
 		 365 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  30.56 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  27.15 
 
 		 367 aa  125  8.000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1663  hypothetical protein  35.58 
 
 		 362 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0224162  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.07 
 
 		 364 aa  125  9e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.04 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  30.7 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  25.49 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 		 374 aa  124  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  30.38 
 
 		 364 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.25 
 
 		 385 aa  122  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.58 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  29.75 
 
 		 360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  33.33 
 
 		 417 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  26.8 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1650  glycerol dehydrogenase  27.78 
 
 		 359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3356  glycerol dehydrogenase  28.33 
 
 		 371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0985  glycerol dehydrogenase  28.06 
 
 		 371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1007  glycerol dehydrogenase  28.06 
 
 		 371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1019  glycerol dehydrogenase  28.06 
 
 		 371 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.556711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  27.83 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2945  glycerol dehydrogenase  28.06 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2414  hypothetical protein  34.2 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0051  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.74 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00126649  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11931  putative glycerol dehydrogenase  33.09 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.273319  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.79 
 
 		 378 aa  113  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.06 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  27.61 
 
 		 379 aa  113  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  27.86 
 
 		 398 aa  112  8.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27210  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  31.18 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  28.67 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11941  putative glycerol dehydrogenase  29.36 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1934  hypothetical protein  34.09 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2314  hypothetical protein  38.89 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0458376  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1626  putative glycerol dehydrogenase  36.73 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.234673  normal  0.71595 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1098  putative glycerol dehydrogenase  32.59 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5662  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.8 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0661  glycerol dehydrogenase family protein  32.48 
 
 		 372 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14931  putative glycerol dehydrogenase  32.48 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>