More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4149 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02166  sn-glycerol-3-phosphate transporter  90.4 
 
 
452 aa  839    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02125  hypothetical protein  90.4 
 
 
452 aa  839    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2380  sn-glycerol-3-phosphate transporter  90.4 
 
 
452 aa  839    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1419  glycerol-3-phosphate transporter  90.4 
 
 
452 aa  838    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2537  sn-glycerol-3-phosphate transporter  90.4 
 
 
452 aa  839    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2511  sn-glycerol-3-phosphate transporter  91.91 
 
 
452 aa  845    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5238  glycerol-3-phosphate transporter  71.3 
 
 
449 aa  667    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0305  sn-glycerol-3-phosphate transporter  71.3 
 
 
449 aa  666    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  69.73 
 
 
446 aa  665    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4149  sn-glycerol-3-phosphate transporter  100 
 
 
449 aa  913    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000087639  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5451  sn-glycerol-3-phosphate transporter  69.7 
 
 
449 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00923139 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2622  sn-glycerol-3-phosphate transporter  90.4 
 
 
452 aa  839    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2523  sn-glycerol-3-phosphate transporter  91.91 
 
 
452 aa  845    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3958  sn-glycerol-3-phosphate transporter  97.55 
 
 
449 aa  900    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00220837  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2468  sn-glycerol-3-phosphate transporter  91.91 
 
 
452 aa  845    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0862405 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  91.98 
 
 
449 aa  860    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000543007  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3377  sn-glycerol-3-phosphate transporter  90.4 
 
 
452 aa  838    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0247  sn-glycerol-3-phosphate transporter  89.53 
 
 
450 aa  847    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0274937  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  92.15 
 
 
451 aa  820    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.140488  normal  0.0295712 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0225  sn-glycerol-3-phosphate transporter  91.96 
 
 
450 aa  808    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  71.33 
 
 
448 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2627  sn-glycerol-3-phosphate transporter  91.91 
 
 
452 aa  845    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.588856 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1411  sn-glycerol-3-phosphate transporter  90.4 
 
 
452 aa  838    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2419  sn-glycerol-3-phosphate transporter  91.91 
 
 
452 aa  845    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1713  sn-glycerol-3-phosphate transporter  68.07 
 
 
483 aa  649    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5978  sn-glycerol-3-phosphate transporter  72.64 
 
 
448 aa  648    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2392  sn-glycerol-3-phosphate transporter  90.4 
 
 
452 aa  838    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2804  sn-glycerol-3-phosphate transporter  91.52 
 
 
450 aa  833    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal  0.676266 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0001  sn-glycerol-3-phosphate transporter  70.89 
 
 
452 aa  658    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000530916  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03311  sn-glycerol-3-phosphate transporter  69.04 
 
 
455 aa  633  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002677  glycerol-3-phosphate transporter  69.44 
 
 
454 aa  627  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  66.52 
 
 
457 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0511  glycerol 3-phosphate transporter  60.46 
 
 
481 aa  592  1e-168  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000061877  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  60.04 
 
 
449 aa  556  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000367094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0628  glycerol-3-phosphate transporter  62.12 
 
 
449 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000215527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0572  glycerol-3-phosphate transporter  62.12 
 
 
449 aa  554  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00224555  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0571  glycerol-3-phosphate transporter  61.89 
 
 
449 aa  551  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00198632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0692  glycerol-3-phosphate transporter  60.76 
 
 
449 aa  553  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0661  glycerol-3-phosphate transporter  62.12 
 
 
449 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00772133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0575  glycerol-3-phosphate transporter  60.31 
 
 
449 aa  551  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0718  glycerol-3-phosphate transporter  61.89 
 
 
449 aa  552  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000170433 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4646  glycerol-3-phosphate transporter  60.99 
 
 
449 aa  554  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000791973  unclonable  8.6547e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0729  glycerol-3-phosphate transporter  60.63 
 
 
449 aa  551  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0790  glycerol-3-phosphate transporter  60.63 
 
 
449 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000864698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2870  glycerol-3-phosphate transporter  57.56 
 
 
445 aa  545  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2060  glycerol-3-phosphate transporter  55.53 
 
 
452 aa  511  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  54.67 
 
 
448 aa  506  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0395  glycerol-3-phosphate transporter  56.46 
 
 
452 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0536129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0385  glycerol-3-phosphate transporter  56.46 
 
 
452 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000112087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  43.33 
 
 
445 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  43.33 
 
 
445 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3790  phosphoglycerate transporter  43.15 
 
 
446 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4940  glycerol-3-phosphate transporter  42.44 
 
 
444 aa  361  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4955  glycerol-3-phosphate transporter  42.15 
 
 
444 aa  358  9e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5109  phosphoglycerate transporter family protein  42.16 
 
 
444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5500  phosphoglycerate transporter family protein  42.16 
 
 
444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5381  phosphoglycerate transporter family protein  41.78 
 
 
444 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5349  phosphoglycerate transporter family protein  41.94 
 
 
444 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5573  phosphoglycerate transporter family protein  41.56 
 
 
444 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5375  phosphoglycerate transporter family protein  42.16 
 
 
444 aa  355  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5429  phosphoglycerate transporter family protein  42.16 
 
 
444 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5051  phosphoglycerate transporter  41.11 
 
 
444 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1436  glycerol-3-phosphate transporter, putative  37.56 
 
 
457 aa  300  3e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000217705  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  36.49 
 
 
446 aa  300  4e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2629  phosphoglycerate transport: transporter  36.52 
 
 
463 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2653  phosphoglycerate transport: transporter  36.52 
 
 
463 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132768 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2540  phosphoglycerate transport: transporter  36.52 
 
 
463 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2759  phosphoglycerate transporter  36.52 
 
 
463 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2588  phosphoglycerate transport: transporter  36.52 
 
 
463 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  40.33 
 
 
456 aa  295  1e-78  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  36.73 
 
 
443 aa  276  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  37.33 
 
 
439 aa  275  9e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.47751 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  37.1 
 
 
439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  37.1 
 
 
439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  37.1 
 
 
439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.113676 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  37.1 
 
 
439 aa  273  7e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  37.1 
 
 
439 aa  273  7e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  37.1 
 
 
439 aa  273  7e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  37.1 
 
 
439 aa  273  7e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4175  regulatory protein UhpC  36.87 
 
 
439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  37.2 
 
 
455 aa  269  5.9999999999999995e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  37.2 
 
 
455 aa  266  5e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4078  regulatory protein UhpC  36.49 
 
 
443 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0083  regulatory protein UhpC  36.49 
 
 
443 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.644662  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4130  regulatory protein UhpC  36.43 
 
 
453 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.543128  normal  0.246836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4014  regulatory protein UhpC  35.79 
 
 
442 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3998  regulatory protein UhpC  35.57 
 
 
442 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4177  regulatory protein UhpC  35.57 
 
 
442 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4119  regulatory protein UhpC  35.57 
 
 
442 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3502  regulatory protein UhpC  35.44 
 
 
447 aa  256  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0029  regulatory protein UhpC  36.92 
 
 
442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4069  regulatory protein UhpC  35.57 
 
 
442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 
446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 
441 aa  242  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1684  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 
422 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.597788  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0624  regulatory protein UhpC  33.57 
 
 
436 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 
437 aa  223  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  32.21 
 
 
433 aa  222  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0573  glycerol-3-phosphatase transporter  29.49 
 
 
459 aa  220  5e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.167538  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2389  regulatory protein UhpC  33.42 
 
 
440 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.365654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>