More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4129 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03277  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic, FAD/NAD(P)-binding  75.4 
 
 		 501 aa  754    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0288  FAD dependent oxidoreductase  75.4 
 
 		 501 aa  754    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4000  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  81.16 
 
 		 504 aa  802    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3706  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  75.6 
 
 		 501 aa  755    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3808  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  75.2 
 
 		 501 aa  752    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.389691  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4734  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  75.4 
 
 		 501 aa  753    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3793  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  75 
 
 		 502 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.3143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3902  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  75.4 
 
 		 501 aa  752    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0228  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  82.6 
 
 		 499 aa  845    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.279587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4642  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  82.11 
 
 		 502 aa  803    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0288  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  80.16 
 
 		 499 aa  780    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3932  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  98 
 
 		 500 aa  1012    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4129  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  100 
 
 		 500 aa  1030    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199856  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3835  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  76.42 
 
 		 502 aa  735    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0230057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3727  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  75 
 
 		 502 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3718  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  75 
 
 		 502 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3834  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  74.65 
 
 		 502 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.867048 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3896  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  74.65 
 
 		 502 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.758553 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4123  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  80.96 
 
 		 504 aa  801    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.469076 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3623  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  75.4 
 
 		 501 aa  754    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0152  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  81.16 
 
 		 504 aa  802    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03229  hypothetical protein  75.4 
 
 		 501 aa  754    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0288  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  75.4 
 
 		 501 aa  754    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  57.94 
 
 		 495 aa  595  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3348  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.86 
 
 		 509 aa  567  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03315  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.72 
 
 		 519 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002673  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.61 
 
 		 502 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4534  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  56.9 
 
 		 512 aa  561  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.443601  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.96 
 
 		 515 aa  554  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  56.24 
 
 		 512 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4170  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.84 
 
 		 512 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.631546  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1559  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  57.2 
 
 		 547 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2106  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  57.09 
 
 		 501 aa  541  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17930  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  57.2 
 
 		 512 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0601  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  56.9 
 
 		 512 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.3 
 
 		 509 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.889292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45730  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.94 
 
 		 510 aa  528  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4339  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.21 
 
 		 508 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.50517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1073  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.46 
 
 		 514 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00244  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  53.36 
 
 		 512 aa  526  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.887264  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1114  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.25 
 
 		 512 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.778652 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1827  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  53.67 
 
 		 513 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.17112  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.6 
 
 		 502 aa  504  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50 
 
 		 502 aa  502  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50 
 
 		 502 aa  500  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.71 
 
 		 514 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2179  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.21 
 
 		 510 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2156  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.89 
 
 		 517 aa  481  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2980  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.63 
 
 		 525 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0420  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.33 
 
 		 511 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.738036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3233  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.64 
 
 		 502 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.700391  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.41 
 
 		 557 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.63 
 
 		 525 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0082196  normal  0.374558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1591  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.4 
 
 		 509 aa  475  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0800392  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2574  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.14 
 
 		 495 aa  475  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.8 
 
 		 516 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5335  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.62 
 
 		 504 aa  472  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2903  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.68 
 
 		 503 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2990  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.67 
 
 		 524 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1361  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.96 
 
 		 516 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0639  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.28 
 
 		 509 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1090  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.97 
 
 		 514 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5324  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50 
 
 		 503 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575956  normal  0.50041 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.51 
 
 		 503 aa  468  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3045  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.02 
 
 		 525 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.399591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3320  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.27 
 
 		 509 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435615  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6470  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.29 
 
 		 504 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.389192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4069  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.45 
 
 		 513 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.961718  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0620  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.96 
 
 		 507 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3733  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.01 
 
 		 500 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4217  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.57 
 
 		 513 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1143  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.09 
 
 		 500 aa  460  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106577  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5983  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.12 
 
 		 504 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1013  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.09 
 
 		 496 aa  459  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.537969  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4895  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.25 
 
 		 511 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.83 
 
 		 510 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0094  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.93 
 
 		 516 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2385  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.73 
 
 		 513 aa  456  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.462359  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1975  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.82 
 
 		 509 aa  455  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0740  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.61 
 
 		 510 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4792  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.43 
 
 		 505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.703258 
 
 
-
 
NC_004310  BR0200  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.57 
 
 		 503 aa  451  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2699  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.79 
 
 		 511 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0241  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.61 
 
 		 510 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.570878  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2453  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.61 
 
 		 510 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.453717  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.09 
 
 		 507 aa  450  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5259  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.02 
 
 		 505 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0600  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.39 
 
 		 510 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2372  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.61 
 
 		 510 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0726  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.61 
 
 		 510 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.125098  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0192  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.36 
 
 		 514 aa  451  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.09 
 
 		 507 aa  451  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2705  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.61 
 
 		 510 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859057  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2442  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.89 
 
 		 502 aa  447  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4393  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.29 
 
 		 527 aa  448  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.31 
 
 		 510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2808  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.85 
 
 		 509 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.711115 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2066  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.09 
 
 		 507 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2677  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.09 
 
 		 507 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435115  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2706  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.09 
 
 		 507 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76503  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>