More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4079 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
729 aa  1484    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  54.65 
 
 
746 aa  729    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  94.66 
 
 
731 aa  1398    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  48.64 
 
 
744 aa  696    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  48.5 
 
 
754 aa  632  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  49.03 
 
 
768 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  47.9 
 
 
808 aa  611  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  43.46 
 
 
804 aa  529  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  43.77 
 
 
709 aa  531  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  44.81 
 
 
700 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  41.43 
 
 
804 aa  510  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  40.03 
 
 
804 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  39.31 
 
 
804 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  38.11 
 
 
771 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  37.43 
 
 
722 aa  439  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  39.53 
 
 
823 aa  435  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  39.34 
 
 
762 aa  427  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  38.99 
 
 
725 aa  424  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  39.01 
 
 
777 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  36.65 
 
 
730 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  37.25 
 
 
800 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  37.33 
 
 
802 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  37.15 
 
 
801 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  37.05 
 
 
801 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  36.18 
 
 
746 aa  405  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  37.76 
 
 
761 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  37.94 
 
 
758 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  36.06 
 
 
734 aa  401  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  37.67 
 
 
756 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  37.61 
 
 
749 aa  399  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  36.74 
 
 
805 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  37.91 
 
 
722 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  36.5 
 
 
737 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  36.55 
 
 
819 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  34.66 
 
 
728 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  37.44 
 
 
753 aa  392  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  36.64 
 
 
772 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  37.06 
 
 
764 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  36.64 
 
 
772 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  36.35 
 
 
726 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  35.14 
 
 
728 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  34.56 
 
 
712 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3084  TonB-dependent siderophore receptor  35.98 
 
 
764 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159276  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  32.98 
 
 
729 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  34.65 
 
 
809 aa  372  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  35.61 
 
 
753 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  35.86 
 
 
737 aa  372  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  34.55 
 
 
755 aa  368  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  35.26 
 
 
729 aa  362  1e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  33.93 
 
 
761 aa  360  5e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  34.64 
 
 
730 aa  353  5e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  34.45 
 
 
768 aa  347  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  34.45 
 
 
763 aa  347  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  34.01 
 
 
724 aa  343  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  34.26 
 
 
720 aa  343  8e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2669  putative ferric siderophore receptor protein precursor  34.96 
 
 
742 aa  340  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765579  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  32.67 
 
 
759 aa  340  8e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4403  TonB-dependent siderophore receptor  36.8 
 
 
773 aa  333  8e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.109366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2620  TonB-dependent siderophore receptor  35.25 
 
 
770 aa  327  5e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526793  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  35.7 
 
 
773 aa  325  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  35.47 
 
 
839 aa  320  7e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  35.32 
 
 
879 aa  319  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  35.47 
 
 
851 aa  318  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1058  TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 
728 aa  304  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0962342  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 
728 aa  251  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  29.07 
 
 
742 aa  228  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 
727 aa  221  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 
716 aa  217  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 
728 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  28.89 
 
 
705 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 
727 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 
726 aa  211  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 
718 aa  209  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  29.83 
 
 
743 aa  204  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 
743 aa  203  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 
702 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 
698 aa  201  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 
743 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 
743 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 
774 aa  200  7.999999999999999e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 
743 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1289  TonB-dependent receptor domain-containing protein  27.66 
 
 
727 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00967025  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 
702 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  29.47 
 
 
743 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 
811 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 
751 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 
811 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 
727 aa  189  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 
738 aa  187  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 
730 aa  187  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 
708 aa  186  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 
757 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 
707 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 
707 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 
707 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 
706 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 
715 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 
685 aa  174  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 
729 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 
710 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.550485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>