244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4077 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_3900  periplasmic binding protein  91.71 
 
 
386 aa  736    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4077  periplasmic binding protein  100 
 
 
383 aa  793    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  54.91 
 
 
406 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  51.54 
 
 
377 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  53.47 
 
 
375 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  44.03 
 
 
375 aa  351  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  43.75 
 
 
375 aa  351  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  45.1 
 
 
373 aa  351  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  43.51 
 
 
373 aa  348  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  43.01 
 
 
378 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  42.47 
 
 
378 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  39.78 
 
 
383 aa  299  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  38.24 
 
 
377 aa  255  8e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  34.13 
 
 
381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  34.13 
 
 
389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  34.13 
 
 
389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  34.94 
 
 
383 aa  238  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1693  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  35.23 
 
 
370 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  33.71 
 
 
370 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  33.61 
 
 
371 aa  219  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1058  periplasmic binding protein  32.15 
 
 
370 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  33.24 
 
 
371 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  31.59 
 
 
380 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  30.68 
 
 
372 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0816  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.68 
 
 
366 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0154  hypothetical protein  30.68 
 
 
366 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000656293 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3035  periplasmic binding protein  30.14 
 
 
372 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0816  periplasmic binding protein  30.68 
 
 
366 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0919646  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  34.29 
 
 
401 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  31.82 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3000  periplasmic binding protein  33.7 
 
 
369 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.796809  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3531  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  32.98 
 
 
382 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826718  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1100  ABC transporter, substrate binding protein  29.32 
 
 
374 aa  194  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0595516  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0797  periplasmic binding protein  34.09 
 
 
367 aa  192  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0161104  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  31.53 
 
 
368 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  29.32 
 
 
375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000138231  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4137  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  32.1 
 
 
365 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  31.1 
 
 
427 aa  186  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0573  ABC transporter, substrate binding protein  29.55 
 
 
374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  30.25 
 
 
365 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  26.78 
 
 
384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  25.41 
 
 
394 aa  169  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  28.49 
 
 
360 aa  159  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  27 
 
 
365 aa  150  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  25.2 
 
 
407 aa  146  6e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  25 
 
 
364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  25.85 
 
 
429 aa  129  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  26.18 
 
 
368 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1774  periplasmic binding protein  25.6 
 
 
363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  22.44 
 
 
392 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2720  periplasmic binding protein  24.23 
 
 
363 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000254593  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2635  iron chelate ABC transporter periplasmic iron/siderophore-binding protein  24.23 
 
 
363 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.97529e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  26.48 
 
 
478 aa  98.2  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  25.27 
 
 
380 aa  97.1  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  24.57 
 
 
377 aa  93.6  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  26.59 
 
 
483 aa  92.8  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  24.29 
 
 
517 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  25.88 
 
 
366 aa  88.6  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  25.15 
 
 
402 aa  82.8  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  20.29 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  23.78 
 
 
409 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  22.89 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  21.68 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  22.22 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  28.9 
 
 
374 aa  77  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  26.04 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  22.8 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  22.82 
 
 
390 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  23.99 
 
 
356 aa  72.8  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  24.46 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  26.23 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  25.56 
 
 
688 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  25.6 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  26.87 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  21.91 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  23.84 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  25.86 
 
 
374 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  25.93 
 
 
689 aa  65.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  25.78 
 
 
373 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0278  periplasmic binding family protein  28.92 
 
 
331 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.429982  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0247  periplasmic binding protein  26.42 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.779854  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  22.37 
 
 
354 aa  64.7  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  25 
 
 
350 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  24.79 
 
 
349 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  22.83 
 
 
360 aa  63.9  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  23.95 
 
 
333 aa  63.5  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  24.73 
 
 
350 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  25 
 
 
350 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  26.55 
 
 
350 aa  62.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  24.35 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  24.79 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  22.41 
 
 
366 aa  62.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  22.19 
 
 
375 aa  62.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  23.2 
 
 
361 aa  62.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  21.56 
 
 
354 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.38 
 
 
349 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  23.14 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  24.06 
 
 
409 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  21.53 
 
 
370 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  23.61 
 
 
361 aa  61.2  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>