More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3997 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
92 aa  189  8e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  8.77043e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
92 aa  189  8e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  5.35385e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3803  30S ribosomal protein S19  98.91 
 
 
92 aa  188  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0236671  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3747  30S ribosomal protein S19  98.91 
 
 
92 aa  188  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  2.35293e-05  hitchhiker  0.0041638 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  97.83 
 
 
92 aa  188  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.09471e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3632  30S ribosomal protein S19  98.91 
 
 
92 aa  188  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0252438  normal  0.32239 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3705  30S ribosomal protein S19  98.91 
 
 
92 aa  188  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000796045  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3632  30S ribosomal protein S19  98.91 
 
 
92 aa  188  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.63304e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  97.83 
 
 
92 aa  188  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.43627e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  97.83 
 
 
92 aa  188  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.35387e-09  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3740  30S ribosomal protein S19  98.91 
 
 
92 aa  188  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.322308  normal  0.0163084 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  92.39 
 
 
92 aa  179  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  92.39 
 
 
92 aa  179  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  3.20584e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  90.22 
 
 
92 aa  178  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.52177e-06  unclonable  4.39739e-11 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  90.22 
 
 
92 aa  178  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  1.51604e-08 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  90.22 
 
 
92 aa  178  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.85402e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  90.22 
 
 
92 aa  178  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.2398e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  90.22 
 
 
92 aa  178  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.86112e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  90.22 
 
 
92 aa  178  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  90.22 
 
 
92 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  5.00624e-06  unclonable  5.33461e-12 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  90.22 
 
 
92 aa  178  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.08032e-09  hitchhiker  1.25391e-09 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  90.22 
 
 
92 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.47318e-05  unclonable  8.36266e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  90.22 
 
 
92 aa  178  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  90.22 
 
 
92 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.56834e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  90.22 
 
 
92 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.60903e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  90.22 
 
 
92 aa  178  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.19443e-05  unclonable  1.54128e-11 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  89.13 
 
 
92 aa  177  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  7.28304e-05  decreased coverage  4.75067e-05 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  90.22 
 
 
92 aa  177  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.02796e-06  unclonable  7.23515e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  89.13 
 
 
92 aa  177  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  8.19027e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  91.21 
 
 
91 aa  177  5e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  2.91736e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0332  ribosomal protein S19  89.01 
 
 
92 aa  175  2e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.203927  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0324  30S ribosomal protein S19  89.13 
 
 
92 aa  174  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0470216  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0327  30S ribosomal protein S19  98.8 
 
 
92 aa  173  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  9.96601e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0409  30S ribosomal protein S19  98.8 
 
 
92 aa  173  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00176498  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03167  30S ribosomal protein S19  98.8 
 
 
92 aa  172  1e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00168585  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3701  30S ribosomal protein S19  98.8 
 
 
92 aa  172  1e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.04541e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03118  hypothetical protein  98.8 
 
 
92 aa  172  1e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00218529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0397  30S ribosomal protein S19  98.8 
 
 
92 aa  172  1e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  5.62623e-05  hitchhiker  0.000267032 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3611  30S ribosomal protein S19  98.8 
 
 
92 aa  172  1e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.98162e-05  normal  0.0138376 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0397  ribosomal protein S19  98.8 
 
 
92 aa  172  1e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.39806e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3799  30S ribosomal protein S19  98.8 
 
 
92 aa  172  1e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.35619e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3510  30S ribosomal protein S19  98.8 
 
 
92 aa  172  1e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.24405e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4639  30S ribosomal protein S19  98.8 
 
 
92 aa  172  1e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0583942  normal  0.0837365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0473  ribosomal protein S19  89.01 
 
 
91 aa  171  3e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  6.07565e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0869  30S ribosomal protein S19  87.91 
 
 
91 aa  171  3e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3520  ribosomal protein S19  85.87 
 
 
92 aa  170  7e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000623119  hitchhiker  8.6131e-07 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0425  SSU ribosomal protein S19P  85.71 
 
 
91 aa  166  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0443512  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  83.52 
 
 
91 aa  166  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  2.53887e-05  unclonable  3.38266e-12 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  81.32 
 
 
91 aa  165  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  7.24937e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2170  30S ribosomal protein S19  91.57 
 
 
92 aa  163  7e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.3951e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06290  30S ribosomal protein S19  82.42 
 
 
91 aa  162  2e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336646  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0841  30S ribosomal protein S19  82.42 
 
 
91 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08890  30S ribosomal protein S19  82.42 
 
 
91 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0458  30S ribosomal protein S19  81.32 
 
 
91 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  1.66272e-07 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0488  30S ribosomal protein S19  81.32 
 
 
91 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124891  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0491  30S ribosomal protein S19  81.32 
 
 
91 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  2.57867e-06  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4745  30S ribosomal protein S19  81.32 
 
 
91 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00116021  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0630  ribosomal protein S19  80.22 
 
 
91 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000445779  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3905  30S ribosomal protein S19  80.22 
 
 
91 aa  157  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296371  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4544  30S ribosomal protein S19  79.12 
 
 
91 aa  156  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5075  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  2.15365e-07  normal  0.273051 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0430  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  154  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  3.77773e-09  decreased coverage  5.32224e-06 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  154  5e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  1.16532e-07 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  154  5e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  4.3477e-06  hitchhiker  6.13779e-06 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0964  30S ribosomal protein S19  76.92 
 
 
91 aa  153  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279744  hitchhiker  1.11628e-06 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  2.18247e-06  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  2.95141e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  6.94495e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  4.90611e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  4.42981e-11  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  8.04319e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  4.90482e-09  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  4.07777e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  2.07611e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  4.03295e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  9.27803e-08  hitchhiker  1.50693e-11 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  2.65315e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  4.53521e-06  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  74.73 
 
 
91 aa  152  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  1.95023e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
91 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  5.48079e-06  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  74.44 
 
 
90 aa  150  8e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0493  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
91 aa  149  9e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  2.16881e-07  hitchhiker  0.00346795 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0488  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
91 aa  149  9e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  4.0228e-07  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  73.91 
 
 
93 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.03026e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3439  30S ribosomal protein S19  76.92 
 
 
91 aa  149  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00121291  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  76.92 
 
 
91 aa  148  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  5.05191e-06  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0283  SSU ribosomal protein S19P  75.82 
 
 
91 aa  148  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.9413e-08  hitchhiker  1.61799e-06 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  76.92 
 
 
91 aa  147  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  73.33 
 
 
90 aa  147  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3313  30S ribosomal protein S19  76.92 
 
 
91 aa  147  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  7.16821e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  75.82 
 
 
91 aa  147  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.22685e-06 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0462  SSU ribosomal protein S19P  73.33 
 
 
90 aa  147  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
91 aa  146  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  7.61945e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0395  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 
91 aa  146  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00895016  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 
91 aa  146  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  4.77876e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 
92 aa  145  1e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>