More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3901 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
250 aa  517  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  95.6 
 
 
250 aa  470  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  77.6 
 
 
250 aa  414  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  77.2 
 
 
250 aa  407  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  76.8 
 
 
250 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  76.8 
 
 
250 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  71.89 
 
 
252 aa  377  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  71.89 
 
 
252 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  68.27 
 
 
252 aa  368  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  68.67 
 
 
252 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  68.27 
 
 
252 aa  367  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  68.67 
 
 
252 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  68.67 
 
 
252 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  68.27 
 
 
252 aa  367  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  68.67 
 
 
252 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  67.87 
 
 
252 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  70.73 
 
 
252 aa  349  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  62.7 
 
 
253 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  62.7 
 
 
253 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  62.7 
 
 
253 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  62.7 
 
 
253 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  62.7 
 
 
253 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  62.4 
 
 
251 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  59.84 
 
 
254 aa  322  4e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  59.84 
 
 
254 aa  322  4e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  59.84 
 
 
254 aa  322  4e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  59.84 
 
 
254 aa  322  4e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  59.84 
 
 
254 aa  322  4e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  59.45 
 
 
262 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  59.45 
 
 
254 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  61.6 
 
 
254 aa  315  6e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  66.52 
 
 
252 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  64.68 
 
 
251 aa  310  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  61.57 
 
 
235 aa  308  6.999999999999999e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  64.53 
 
 
252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  64.53 
 
 
252 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  59.27 
 
 
250 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  63.32 
 
 
249 aa  290  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  58.17 
 
 
253 aa  268  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  60.87 
 
 
250 aa  265  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  57.37 
 
 
253 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  57.37 
 
 
253 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  55.78 
 
 
604 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  56.57 
 
 
253 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  56.18 
 
 
253 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  55.38 
 
 
253 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  60.26 
 
 
261 aa  251  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  54.98 
 
 
254 aa  249  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  43.9 
 
 
256 aa  199  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  44.26 
 
 
312 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  47.69 
 
 
275 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  35.18 
 
 
289 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  39.73 
 
 
290 aa  155  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  37.8 
 
 
269 aa  155  8e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  29.72 
 
 
267 aa  88.6  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  25.56 
 
 
270 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  25.56 
 
 
270 aa  86.3  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  28.11 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  30.12 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  28.4 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  30.12 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  28.11 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  27 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  27.02 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  28.2 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  25.3 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  29.77 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  27.84 
 
 
269 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  27.95 
 
 
269 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  27.84 
 
 
269 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  32.68 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  28.06 
 
 
424 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  29.39 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  33.16 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  29.39 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  27.31 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  27.45 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  28.12 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  25.61 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1773  putative metalloprotease  29.83 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.480116  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  27.6 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  28.68 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  26.94 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  30.6 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  25.79 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  30.6 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  29.51 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  27.24 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  28.64 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  25 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  26.24 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  26.12 
 
 
258 aa  72  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  31.06 
 
 
271 aa  72  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  27.17 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  27.4 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  28.27 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  29.67 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  25 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  26.24 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  29.67 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>