More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3856 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  77.23 
 
 		 437 aa  663    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  77.96 
 
 		 445 aa  651    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  77.28 
 
 		 435 aa  671    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  95.73 
 
 		 445 aa  813    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 445 aa  891    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  75.29 
 
 		 462 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  75.06 
 
 		 459 aa  627  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  74.59 
 
 		 466 aa  626  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  73.62 
 
 		 433 aa  593  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  69.17 
 
 		 429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  66.9 
 
 		 429 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  67.38 
 
 		 429 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  68.45 
 
 		 429 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  66.75 
 
 		 438 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  65.79 
 
 		 445 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  66.26 
 
 		 429 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  65.56 
 
 		 432 aa  554  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  66.02 
 
 		 438 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  64.11 
 
 		 435 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  59.82 
 
 		 448 aa  533  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  65.47 
 
 		 436 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  63.66 
 
 		 466 aa  527  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  63.53 
 
 		 436 aa  524  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  59.29 
 
 		 476 aa  521  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  59.29 
 
 		 476 aa  521  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  59.76 
 
 		 487 aa  520  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  63.1 
 
 		 436 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  62.2 
 
 		 433 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  62.44 
 
 		 433 aa  511  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  61.32 
 
 		 435 aa  508  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  61.43 
 
 		 436 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  61.2 
 
 		 436 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  63.08 
 
 		 436 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  63.73 
 
 		 430 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  61.56 
 
 		 461 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  62.56 
 
 		 465 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  63.73 
 
 		 430 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  63.73 
 
 		 430 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  63.73 
 
 		 430 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  63.73 
 
 		 430 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  61.32 
 
 		 458 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  61.32 
 
 		 458 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  58.21 
 
 		 435 aa  496  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  59.9 
 
 		 442 aa  490  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  59.26 
 
 		 447 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  59.62 
 
 		 442 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  57.49 
 
 		 441 aa  465  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  59.38 
 
 		 442 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  52.83 
 
 		 437 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00802  prop transport protein  57.44 
 
 		 387 aa  421  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0278837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1612  major facilitator family transporter  51.81 
 
 		 438 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3768  major facilitator transporter  49.77 
 
 		 438 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  51.9 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4767  general substrate transporter  52.02 
 
 		 450 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3530  major facilitator transporter  51.06 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0147  putative transporter, major facilitator superfamily  47.52 
 
 		 436 aa  365  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4206  major facilitator family transporter  51.3 
 
 		 441 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0248  major facilitator superfamily protein  46.74 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0300  major facilitator superfamily protein  46.48 
 
 		 436 aa  363  3e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  46.48 
 
 		 436 aa  363  3e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3778  major facilitator transporter  51.06 
 
 		 441 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0539  major facilitator superfamily protein  45.31 
 
 		 432 aa  354  2e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.956103  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0089  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  44.76 
 
 		 429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.964688  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1647  major facilitator transporter  51.54 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  42.75 
 
 		 431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  39.1 
 
 		 443 aa  296  4e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  38.88 
 
 		 438 aa  293  4e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1000  CjaB protein  38.33 
 
 		 415 aa  285  9e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1063  transport protein CjaB  38.44 
 
 		 415 aa  274  3e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0790  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0694  major facilitator family transporter CjaB  38.08 
 
 		 407 aa  258  1e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0796  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 433 aa  256  7e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  36.02 
 
 		 483 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  36.14 
 
 		 444 aa  239  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  34.83 
 
 		 485 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  35.07 
 
 		 485 aa  237  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  34.83 
 
 		 485 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  34.83 
 
 		 485 aa  237  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  34.83 
 
 		 485 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  34.83 
 
 		 485 aa  236  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  34.83 
 
 		 485 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  34.6 
 
 		 485 aa  236  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  34.6 
 
 		 485 aa  236  9e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 		 443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  33.65 
 
 		 482 aa  233  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1733  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 435 aa  229  6e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.32022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 443 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5767  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0903  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.27 
 
 		 443 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760701  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 461 aa  226  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0593  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  32.58 
 
 		 438 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 447 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1522  major facilitator superfamily metabolite (proline/betaine)/H(+) symporter  36.3 
 
 		 438 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00301403  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  35.48 
 
 		 434 aa  223  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 445 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 438 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  34.34 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 438 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.32 
 
 		 433 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>