54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3759 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3759  Nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx-like protein  100 
 
 
270 aa  552  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3573  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  98.15 
 
 
286 aa  548  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.772906  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0629  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  76.75 
 
 
287 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0668  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  76.3 
 
 
287 aa  434  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3198  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  75.74 
 
 
294 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0134636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0482  nucleoside-specific channel-forming protein  75.74 
 
 
294 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0442  nucleoside-specific channel-forming protein  75.74 
 
 
294 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3222  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  75.74 
 
 
294 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0445  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  75.74 
 
 
294 aa  420  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0332  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  75.37 
 
 
294 aa  419  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.188825  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0493  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  75.74 
 
 
294 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.521942  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00363  hypothetical protein  75.74 
 
 
294 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.502644  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00359  nucleoside channel, receptor of phage T6 and colicin K  75.74 
 
 
294 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.527354  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0879  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  73.9 
 
 
294 aa  405  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2072  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  73.98 
 
 
293 aa  401  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0453  nucleoside-specific channel-forming protein tsx  74.53 
 
 
287 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0451  nucleoside-specific channel-forming protein tsx  74.53 
 
 
287 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0471  nucleoside-specific channel-forming protein tsx  74.53 
 
 
287 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0513  nucleoside-specific channel-forming protein tsx  74.53 
 
 
287 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0459  nucleoside-specific channel-forming protein tsx  74.53 
 
 
287 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4384  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  65.07 
 
 
286 aa  367  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.605519 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3858  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  52.03 
 
 
319 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.297258 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4122  nucleoside-specific channel-forming protein  52.4 
 
 
304 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3757  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  51.29 
 
 
319 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01770  putative nucleoside-binding outer membrane protein  36.33 
 
 
282 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0718  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0110  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  29.04 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002697  outer membrane protein OmpK  29.77 
 
 
272 aa  82  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.302081  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03287  hypothetical protein  30.15 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3550  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  28.1 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000115802  decreased coverage  0.000000668539 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1215  outer membrane protein OmpK, putative  27.05 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3379  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  28.02 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000573921  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1036  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  30.96 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000103481  unclonable  0.0000000000147865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1101  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  30.96 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000152935  unclonable  0.0000213544 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2823  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  30.38 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000597906  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2816  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  28.63 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000631711  unclonable  0.00000283394 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1040  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  30.38 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000125932  unclonable  0.0000000000727651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1139  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  30.38 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567301  unclonable  0.00000000000471998 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1024  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  28.69 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000282973  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1001  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  29.66 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000919402  n/a   
 
 
 
NC_009457  VC0395_A1893  nucleoside-specific channel-forming protein  29.1 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3228  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  28.52 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000169174  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3231  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  32.73 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000002039  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3367  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  32.54 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000101971  hitchhiker  0.00176833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3049  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  28.43 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000184608  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4508  hypothetical protein  25.31 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237235  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3073  hypothetical protein  27.27 
 
 
251 aa  49.7  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238375  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3679  hypothetical protein  25.99 
 
 
250 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0284056  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3504  hypothetical protein  25.99 
 
 
250 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000183633  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4131  hypothetical protein  25.55 
 
 
250 aa  45.4  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3851  hypothetical protein  24.44 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0452291  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0448  hypothetical protein  25.55 
 
 
250 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00784696  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02060  hypothetical protein  29.41 
 
 
278 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520939  normal  0.571612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0245  hypothetical protein  29.41 
 
 
278 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0489  hypothetical protein  23.77 
 
 
250 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000981799  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>