More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3663 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 613 aa  1261    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  92.66 
 
 		 608 aa  1162    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  48.06 
 
 		 574 aa  524  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  42.47 
 
 		 560 aa  428  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  41.4 
 
 		 543 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  41.8 
 
 		 565 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  38.39 
 
 		 569 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  37.74 
 
 		 564 aa  362  1e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  37.34 
 
 		 573 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  35.65 
 
 		 576 aa  341  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  36.56 
 
 		 564 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  35.88 
 
 		 573 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  33.85 
 
 		 569 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  33.15 
 
 		 575 aa  273  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  31.77 
 
 		 596 aa  268  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  32.12 
 
 		 569 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  33.58 
 
 		 542 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3759  amidohydrolase 3  33.88 
 
 		 529 aa  263  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  32.5 
 
 		 544 aa  263  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  32.25 
 
 		 542 aa  253  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  31.81 
 
 		 616 aa  246  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  30.4 
 
 		 574 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  32.52 
 
 		 601 aa  243  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  29.29 
 
 		 585 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  29.82 
 
 		 541 aa  230  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  30.46 
 
 		 589 aa  226  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  32.37 
 
 		 545 aa  225  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  29.34 
 
 		 603 aa  222  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  31.11 
 
 		 535 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  32.09 
 
 		 583 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  32.09 
 
 		 583 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  30.02 
 
 		 580 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  30.57 
 
 		 537 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  27.83 
 
 		 580 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  30.16 
 
 		 553 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  30.64 
 
 		 532 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  30.09 
 
 		 580 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  30.7 
 
 		 606 aa  211  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  29.19 
 
 		 563 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  29.19 
 
 		 563 aa  210  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  29.95 
 
 		 556 aa  210  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  31.65 
 
 		 543 aa  210  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  31.18 
 
 		 564 aa  209  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  29.08 
 
 		 584 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  32.52 
 
 		 620 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  28.1 
 
 		 568 aa  208  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  30.56 
 
 		 576 aa  205  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  31.99 
 
 		 544 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  28.98 
 
 		 583 aa  200  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  29.62 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.44 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  29.98 
 
 		 530 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  29.68 
 
 		 543 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  29.05 
 
 		 560 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  28.98 
 
 		 583 aa  199  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  28.98 
 
 		 563 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  28.93 
 
 		 545 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  28.42 
 
 		 556 aa  191  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  29.04 
 
 		 553 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  31.37 
 
 		 548 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  31.37 
 
 		 548 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  31.37 
 
 		 548 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  30.52 
 
 		 579 aa  188  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  25.72 
 
 		 520 aa  187  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  30.86 
 
 		 538 aa  187  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  29.27 
 
 		 582 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  26.77 
 
 		 520 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.02 
 
 		 565 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.4 
 
 		 539 aa  183  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.35 
 
 		 583 aa  183  9.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  27.17 
 
 		 583 aa  180  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.88 
 
 		 544 aa  178  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  27.89 
 
 		 527 aa  178  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  28.26 
 
 		 557 aa  174  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  27.82 
 
 		 548 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  27.77 
 
 		 546 aa  171  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  27.35 
 
 		 565 aa  170  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  27.62 
 
 		 563 aa  170  8e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  27.09 
 
 		 549 aa  167  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  26.81 
 
 		 553 aa  167  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  26.78 
 
 		 546 aa  167  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  28.81 
 
 		 522 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.36 
 
 		 556 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  27.69 
 
 		 558 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  28.02 
 
 		 550 aa  165  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  27.94 
 
 		 550 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  26.09 
 
 		 550 aa  163  9e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  26.89 
 
 		 543 aa  163  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  27.58 
 
 		 537 aa  162  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  25.56 
 
 		 522 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  25.56 
 
 		 522 aa  161  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  26.25 
 
 		 522 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  26.68 
 
 		 564 aa  161  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  27.6 
 
 		 547 aa  161  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  26.95 
 
 		 538 aa  160  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  25.74 
 
 		 522 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  25.56 
 
 		 522 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  25.87 
 
 		 557 aa  160  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  25.74 
 
 		 522 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  25.74 
 
 		 522 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>