More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3440 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  100 
 
 
256 aa  530  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  92.58 
 
 
257 aa  495  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  71.48 
 
 
256 aa  374  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  63.89 
 
 
256 aa  337  9e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  63.89 
 
 
256 aa  337  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  63.49 
 
 
256 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  63.49 
 
 
256 aa  335  5e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  62.3 
 
 
256 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  57.48 
 
 
255 aa  314  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  59.13 
 
 
256 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  59.13 
 
 
256 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  59.13 
 
 
256 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  59.13 
 
 
256 aa  311  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  58.73 
 
 
256 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  55.29 
 
 
255 aa  297  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  56.91 
 
 
253 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  57.14 
 
 
254 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  56.22 
 
 
254 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  72.58 
 
 
204 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  71.51 
 
 
212 aa  289  3e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  56.73 
 
 
254 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  55.82 
 
 
254 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  73.68 
 
 
173 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  54.25 
 
 
250 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  53.88 
 
 
261 aa  268  7e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  53.63 
 
 
251 aa  268  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  61.76 
 
 
207 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  61.76 
 
 
207 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  54.22 
 
 
250 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  52.63 
 
 
256 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  61.27 
 
 
207 aa  262  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  52.63 
 
 
250 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  51.42 
 
 
250 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  49.41 
 
 
258 aa  260  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  54.84 
 
 
251 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  54.84 
 
 
251 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  60.78 
 
 
207 aa  259  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  51.42 
 
 
250 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  52.23 
 
 
250 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  51.01 
 
 
250 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  51.01 
 
 
250 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  53.85 
 
 
250 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  59.8 
 
 
207 aa  256  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  51.82 
 
 
250 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  54.44 
 
 
251 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  54.03 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  54.03 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  54.03 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  54.03 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  50.4 
 
 
261 aa  251  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  49.8 
 
 
254 aa  247  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  49.8 
 
 
254 aa  247  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  48.22 
 
 
259 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  52.63 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  52.63 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  45.63 
 
 
264 aa  241  9e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  49.01 
 
 
259 aa  240  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  51.79 
 
 
258 aa  239  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  49.41 
 
 
259 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  46.47 
 
 
256 aa  238  9e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  58.79 
 
 
187 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0249  Methyltransferase type 11  46.56 
 
 
260 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220437  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  49.21 
 
 
261 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2361  methyltransferase type 11  45.63 
 
 
254 aa  215  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  31.2 
 
 
261 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.33 
 
 
258 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  30.8 
 
 
261 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.33 
 
 
258 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.8 
 
 
261 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  31.87 
 
 
273 aa  141  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.4 
 
 
261 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.47 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  31.2 
 
 
264 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.8 
 
 
261 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.8 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.97 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  34.1 
 
 
253 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  31 
 
 
259 aa  96.7  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  39.5 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3752  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.51014  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
1002 aa  81.6  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  43.4 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  25.24 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  29.74 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  34.42 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
1000 aa  79  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.21 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.88 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.03 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  41.28 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.67 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.33 
 
 
280 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  35.78 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.75 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  32.09 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  30.54 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.14 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.14 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>