More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3354 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  100 
 
 		 285 aa  558  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  96.84 
 
 		 285 aa  526  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  80.92 
 
 		 285 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  79.15 
 
 		 285 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  77.66 
 
 		 282 aa  436  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  80.14 
 
 		 282 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  77.66 
 
 		 282 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  77.66 
 
 		 282 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  75.62 
 
 		 285 aa  417  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  75.62 
 
 		 285 aa  417  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  75.62 
 
 		 285 aa  417  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  75.62 
 
 		 285 aa  417  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  75.62 
 
 		 285 aa  417  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  75.62 
 
 		 285 aa  417  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  74.91 
 
 		 285 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  75.27 
 
 		 285 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  74.2 
 
 		 285 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  74.2 
 
 		 285 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  74.2 
 
 		 285 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  74.2 
 
 		 285 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  74.2 
 
 		 285 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  74.11 
 
 		 285 aa  404  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  74.6 
 
 		 249 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  56.69 
 
 		 284 aa  305  8.000000000000001e-82  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  47.75 
 
 		 283 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  48.75 
 
 		 268 aa  229  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  45.7 
 
 		 287 aa  228  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  48.75 
 
 		 271 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  44.37 
 
 		 280 aa  225  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  49.1 
 
 		 271 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  46.34 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  44.29 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  46.43 
 
 		 271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17120  phosphatidate cytidylyltransferase  46.26 
 
 		 271 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  48.04 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  45.39 
 
 		 285 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  43.93 
 
 		 285 aa  208  7e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  45.52 
 
 		 285 aa  208  7e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  45.52 
 
 		 285 aa  208  9e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  44.41 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  44.13 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  41.03 
 
 		 287 aa  206  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  47.35 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  41.28 
 
 		 285 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  44.49 
 
 		 256 aa  203  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2422  phosphatidate cytidylyltransferase  44.56 
 
 		 279 aa  203  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.522142  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  46.26 
 
 		 271 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  46.26 
 
 		 271 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  42.14 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  46.62 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  41.84 
 
 		 285 aa  200  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3048  phosphatidate cytidylyltransferase  46.62 
 
 		 271 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.43758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2897  phosphatidate cytidylyltransferase  44.17 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00110713  normal  0.164322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  45.04 
 
 		 285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000132658  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  42.35 
 
 		 285 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01378  phosphatidate cytidylyltransferase  43.06 
 
 		 287 aa  192  8e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102006  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 		 274 aa  188  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  45.02 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1455  phosphatidate cytidylyltransferase  44.17 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000205389  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1486  phosphatidate cytidylyltransferase  43.82 
 
 		 290 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00292599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2630  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 		 261 aa  178  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000515592  normal  0.523786 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  43.37 
 
 		 271 aa  178  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  39.36 
 
 		 267 aa  178  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0568  phosphatidate cytidylyltransferase  43.17 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  42.03 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  38.16 
 
 		 268 aa  159  7e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  38.16 
 
 		 272 aa  159  7e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  39.73 
 
 		 276 aa  158  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0572  phosphatidate cytidylyltransferase  40.14 
 
 		 328 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22414  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  38.79 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0325  phosphatidate cytidylyltransferase  38.08 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  46.52 
 
 		 269 aa  143  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 270 aa  143  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  57.14 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  44.39 
 
 		 269 aa  142  7e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  35.71 
 
 		 272 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0813  phosphatidate cytidylyltransferase  37.46 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1461  phosphatidate cytidylyltransferase  41.22 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.152404  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  36.33 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  37.37 
 
 		 276 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  36.12 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  36.8 
 
 		 276 aa  132  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  37.46 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  37.46 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2580  phosphatidate cytidylyltransferase  37.33 
 
 		 284 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2604  phosphatidate cytidylyltransferase  36.77 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2690  phosphatidate cytidylyltransferase  37.33 
 
 		 282 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.515203  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  45.04 
 
 		 260 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1876  phosphatidate cytidylyltransferase  35.69 
 
 		 273 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  32.74 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  48.09 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  37.16 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  34.66 
 
 		 279 aa  122  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1993  phosphatidate cytidylyltransferase  36.39 
 
 		 281 aa  122  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  35.66 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 		 264 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  33.1 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  36.14 
 
 		 275 aa  122  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>