More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3075 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



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Replicon accession
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Product
% identity
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Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00536  copper/silver efflux system, membrane component  65.26 
 
 		 1047 aa  1429    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.756563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3054  heavy metal efflux pump, CzcA family  65.36 
 
 		 1047 aa  1430    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1483  CzcA family heavy metal efflux protein  55.37 
 
 		 1043 aa  1158    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  47.26 
 
 		 1045 aa  982    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  67.05 
 
 		 1070 aa  1439    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0332  CzcA family heavy metal RND efflux protein  66.96 
 
 		 1070 aa  1437    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.744474  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5387  CzcA family heavy metal RND efflux protein  66.35 
 
 		 1052 aa  1413    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.134582 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  35.07 
 
 		 1077 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0149  CzcA family heavy metal efflux protein  59.83 
 
 		 1049 aa  1301    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  35.16 
 
 		 1077 aa  651    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  57.57 
 
 		 1066 aa  1189    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  35.57 
 
 		 1070 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05405  cation efflux system transmembrane protein  68.69 
 
 		 1047 aa  1485    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2212  CzcA family heavy metal efflux protein  66.38 
 
 		 1049 aa  1417    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589008  normal  0.652924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3783  CzcA family heavy metal efflux protein  59.06 
 
 		 1045 aa  1297    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4858  cation efflux system protein CusA  58.89 
 
 		 1052 aa  1264    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2703  CzcA family heavy metal efflux protein  55.47 
 
 		 1059 aa  1159    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4598  CzcA family heavy metal efflux protein  58.96 
 
 		 1045 aa  1285    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0153  CzcA family heavy metal efflux protein  58.67 
 
 		 1045 aa  1271    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  36.18 
 
 		 1053 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3376  CzcA family heavy metal efflux protein  67.05 
 
 		 1070 aa  1439    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  34.97 
 
 		 1077 aa  645    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2361  chemiosmotic efflux system B protein A  48.12 
 
 		 1047 aa  1026    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0089  CzcA family heavy metal efflux protein  46.6 
 
 		 1048 aa  984    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1157  CzcA family heavy metal efflux protein  79.36 
 
 		 1038 aa  1697    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  35.86 
 
 		 1054 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3983  CzcA family heavy metal efflux protein  59.15 
 
 		 1045 aa  1291    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2238  CzcA family heavy metal RND efflux protein  67.05 
 
 		 1070 aa  1439    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0136  CzcA family heavy metal efflux protein  60.54 
 
 		 1040 aa  1281    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  55.99 
 
 		 1051 aa  1176    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  55.59 
 
 		 1044 aa  1144    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2437  CzcA family heavy metal efflux protein  45.56 
 
 		 1091 aa  972    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3856  CzcA family heavy metal efflux protein  59.44 
 
 		 1045 aa  1301    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2926  CzcA family heavy metal efflux protein  45.44 
 
 		 1046 aa  954    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.377794  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0061  RND family outer membrane copper/silver/drug transport protein  56.03 
 
 		 1069 aa  1187    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  34.85 
 
 		 1059 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1333  heavy metal efflux pump CzcA  67.72 
 
 		 1060 aa  1463    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0178  putative cation efflux system transmembrane protein  59.92 
 
 		 1056 aa  1277    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3131  heavy metal efflux pump CzcA  54.66 
 
 		 1058 aa  1119    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0514  CzcA family heavy metal efflux protein  67.02 
 
 		 1070 aa  1435    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564268  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  35.16 
 
 		 1077 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4513  CzcA family heavy metal efflux protein  69.85 
 
 		 1055 aa  1508    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5182  CzcA family heavy metal efflux protein  66.96 
 
 		 1068 aa  1450    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.669903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1390  CzcA family heavy metal efflux protein  59.54 
 
 		 1039 aa  1265    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245764  normal  0.515313 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1530  heavy metal efflux pump  54.67 
 
 		 1067 aa  1148    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1535  heavy metal efflux pump  47.93 
 
 		 1074 aa  1015    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2396  heavy metal efflux pump CzcA  67.05 
 
 		 1056 aa  1436    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592906  normal  0.0141595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  35.44 
 
 		 1050 aa  642    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1714  putative inner membrane component for iron transport  53.1 
 
 		 1074 aa  1145    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0452812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  35.48 
 
 		 1070 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  46.15 
 
 		 1045 aa  981    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1232  CzcA family heavy metal efflux protein  66.73 
 
 		 1039 aa  1447    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.99301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3385  CzcA family heavy metal efflux protein  53.24 
 
 		 1061 aa  1104    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0266  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  59.15 
 
 		 1047 aa  1296    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.792977  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1778  heavy metal efflux pump CzcA  57.14 
 
 		 1054 aa  1210    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3650  CzcA family heavy metal efflux protein  46.53 
 
 		 1045 aa  965    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0883  heavy metal efflux pump CzcA  43.18 
 
 		 1015 aa  855    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3534  CzcA family heavy metal efflux protein  58.86 
 
 		 1047 aa  1281    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  51.1 
 
 		 1059 aa  1095    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0162  CzcA family heavy metal efflux protein  58.96 
 
 		 1049 aa  1296    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0319  CzcA family heavy metal RND efflux protein  66.96 
 
 		 1070 aa  1437    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  35.82 
 
 		 1077 aa  656    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4104  heavy metal efflux pump CzcA  47.38 
 
 		 1094 aa  984    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  56.48 
 
 		 1051 aa  1144    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  55.22 
 
 		 1043 aa  1169    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1931  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  59.79 
 
 		 1039 aa  1278    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0262  CzcA family heavy metal efflux protein  63.49 
 
 		 1048 aa  1397    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2246  CzcA family heavy metal efflux protein  47.45 
 
 		 1100 aa  954    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3935  ATP synthase F1, alpha subunit  58.73 
 
 		 1042 aa  1226    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  56.21 
 
 		 1052 aa  1170    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0282  CzcA family heavy metal efflux protein  59.83 
 
 		 1049 aa  1301    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  35.48 
 
 		 1040 aa  649    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  35.16 
 
 		 1077 aa  651    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3491  heavy metal efflux pump CzcA  70.33 
 
 		 1056 aa  1508    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  35.91 
 
 		 1083 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3509  heavy metal efflux pump CzcA  58.48 
 
 		 1042 aa  1265    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1627  putative cation efflux system transmembrane protein  68.63 
 
 		 1063 aa  1492    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  56 
 
 		 1043 aa  1154    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3475  CzcA family heavy metal efflux protein  60.83 
 
 		 1048 aa  1315    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3426  cation efflux system protein cusA  55.43 
 
 		 1057 aa  1170    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  56.15 
 
 		 1060 aa  1157    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  55.04 
 
 		 1065 aa  1150    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  35.07 
 
 		 1077 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1370  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  59.77 
 
 		 1042 aa  1305    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.775676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  56.1 
 
 		 1060 aa  1147    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3402  CzcA family heavy metal efflux protein  67.31 
 
 		 1068 aa  1441    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  35.07 
 
 		 1077 aa  647    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6136  proton antiporter cation efflux protein SilA  69.8 
 
 		 1056 aa  1509    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0754089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  67.05 
 
 		 1070 aa  1439    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.594297  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  35.39 
 
 		 1043 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5033  copper and silver tricomponent efflux pump cusA  68.4 
 
 		 1055 aa  1495    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2393  heavy metal efflux pump CzcA  64.16 
 
 		 1044 aa  1357    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.73106  normal  0.0219915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2441  heavy metal efflux pump CzcA  65.13 
 
 		 1044 aa  1368    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2550  heavy metal efflux pump CzcA  65.61 
 
 		 1047 aa  1420    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  35.57 
 
 		 1070 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4765  heavy metal efflux pump CzcA  67.31 
 
 		 1068 aa  1441    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2392  CzcA family heavy metal efflux protein  59.39 
 
 		 1045 aa  1250    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4386  CzcA family heavy metal efflux protein  55.81 
 
 		 1058 aa  1154    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4300  CzcA family heavy metal efflux protein  63.49 
 
 		 1048 aa  1396    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008255  CHU_1504  heavy metal efflux pump protein  43.11 
 
 		 1049 aa  902    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0325139  normal  0.186965 
 
 
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