86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3040 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  100 
 
 		 611 aa  1226    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  91.49 
 
 		 611 aa  1132    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  56.38 
 
 		 604 aa  674    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  54.24 
 
 		 599 aa  679    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  51.7 
 
 		 618 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  51.7 
 
 		 618 aa  634  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  51.7 
 
 		 618 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  50.9 
 
 		 611 aa  611  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  48.8 
 
 		 618 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  48.64 
 
 		 618 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  48.64 
 
 		 618 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  48.64 
 
 		 618 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  48.64 
 
 		 618 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  47.82 
 
 		 617 aa  579  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  47.82 
 
 		 617 aa  579  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  47.98 
 
 		 617 aa  582  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  47.82 
 
 		 617 aa  579  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  47.82 
 
 		 617 aa  578  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  47.98 
 
 		 617 aa  580  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.352254 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  47.98 
 
 		 617 aa  582  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  47.66 
 
 		 617 aa  580  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  47.66 
 
 		 617 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  47.67 
 
 		 615 aa  567  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  22.59 
 
 		 695 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  24.27 
 
 		 607 aa  137  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  24.23 
 
 		 606 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  23.64 
 
 		 614 aa  134  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  24.21 
 
 		 604 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  23.82 
 
 		 607 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  23.62 
 
 		 606 aa  127  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  23.66 
 
 		 607 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  23.53 
 
 		 606 aa  126  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  24.11 
 
 		 607 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  23.45 
 
 		 606 aa  124  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  23.79 
 
 		 606 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  21.69 
 
 		 703 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  24.5 
 
 		 608 aa  122  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  24.06 
 
 		 649 aa  103  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  23.49 
 
 		 640 aa  103  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  22.78 
 
 		 612 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  21.17 
 
 		 611 aa  100  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  22.33 
 
 		 614 aa  98.2  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  19.77 
 
 		 606 aa  95.1  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  23.08 
 
 		 696 aa  94  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  22.87 
 
 		 695 aa  83.6  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  21.72 
 
 		 719 aa  82  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  23.25 
 
 		 699 aa  73.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  23.77 
 
 		 742 aa  72.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  20.68 
 
 		 812 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  22.67 
 
 		 506 aa  72  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  23.35 
 
 		 732 aa  70.1  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  26.61 
 
 		 893 aa  67.4  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  23.86 
 
 		 797 aa  66.6  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  22.93 
 
 		 655 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  25.25 
 
 		 748 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  20.68 
 
 		 789 aa  65.1  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  23.2 
 
 		 826 aa  63.9  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  24.94 
 
 		 748 aa  63.9  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  24.01 
 
 		 748 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  23.96 
 
 		 747 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  29.29 
 
 		 725 aa  60.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  23.62 
 
 		 748 aa  60.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  21.42 
 
 		 649 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  21.03 
 
 		 602 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  20 
 
 		 640 aa  58.9  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  24.65 
 
 		 745 aa  58.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  20.83 
 
 		 502 aa  57  0.0000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  22.16 
 
 		 705 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  22.03 
 
 		 508 aa  56.2  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  21.74 
 
 		 701 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  23.1 
 
 		 740 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  27.87 
 
 		 1077 aa  52.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  25 
 
 		 741 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  25 
 
 		 660 aa  51.6  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  25 
 
 		 660 aa  50.4  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  28.7 
 
 		 711 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  27.5 
 
 		 675 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  24.08 
 
 		 741 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0065  hypothetical protein  26.83 
 
 		 461 aa  47  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  21.7 
 
 		 762 aa  45.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  22.95 
 
 		 750 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  25.81 
 
 		 741 aa  44.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2055  hypothetical protein  24.07 
 
 		 587 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.429866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  22.35 
 
 		 609 aa  44.3  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  22.95 
 
 		 709 aa  43.9  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  24.19 
 
 		 656 aa  43.5  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>