More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2942 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  698    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  91.23 
 
 		 342 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  66.15 
 
 		 328 aa  448  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  66.15 
 
 		 328 aa  448  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  67.08 
 
 		 328 aa  442  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  72.79 
 
 		 334 aa  425  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  69.97 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  63.49 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  65.46 
 
 		 331 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  65.46 
 
 		 331 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  65.13 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  65.13 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  65.13 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  63.37 
 
 		 332 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  63.37 
 
 		 332 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  63.37 
 
 		 331 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  63.37 
 
 		 331 aa  361  8e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  63.37 
 
 		 331 aa  361  9e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  63.37 
 
 		 331 aa  361  9e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  63.37 
 
 		 331 aa  361  9e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  63.37 
 
 		 331 aa  361  9e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  62.71 
 
 		 331 aa  358  8e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  51.13 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  51.52 
 
 		 347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  51.37 
 
 		 337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  51.71 
 
 		 337 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  47.96 
 
 		 332 aa  255  8e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  45.03 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  47.83 
 
 		 354 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  46.55 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1020  hypothetical protein  48.47 
 
 		 345 aa  242  7.999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  50.83 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  44.51 
 
 		 343 aa  236  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  40.24 
 
 		 281 aa  235  7e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  39.94 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  43.5 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  42.45 
 
 		 359 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  41.64 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  38.83 
 
 		 344 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  41.49 
 
 		 345 aa  209  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  41.49 
 
 		 345 aa  209  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  42.47 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  38.28 
 
 		 348 aa  199  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  41.29 
 
 		 336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  33.72 
 
 		 349 aa  193  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  35.85 
 
 		 329 aa  193  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  41.3 
 
 		 350 aa  192  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  35.71 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  32.92 
 
 		 327 aa  186  5e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  36.66 
 
 		 354 aa  179  7e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  32.6 
 
 		 335 aa  173  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  35.09 
 
 		 329 aa  172  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2157  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 357 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  36.24 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  34 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  34.88 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2839  secretion protein HlyD family protein  35.19 
 
 		 377 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  35.05 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  30.42 
 
 		 328 aa  155  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  36.86 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  31.27 
 
 		 335 aa  149  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  35.42 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  29.03 
 
 		 331 aa  139  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  29.38 
 
 		 395 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1914  multidrug ABC transporter membrane-binding protein  36.33 
 
 		 337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  31.27 
 
 		 427 aa  126  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  32.62 
 
 		 331 aa  125  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  33.56 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.7 
 
 		 500 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  30.87 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  27.03 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  32.04 
 
 		 344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1291  HlyD family secretion protein  34.01 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.888104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.21 
 
 		 505 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  29.65 
 
 		 357 aa  113  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  28.88 
 
 		 323 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  26.8 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  29.62 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  27.13 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  31.06 
 
 		 358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  31.36 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  30.64 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  32.98 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  29.48 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1309  HlyD family secretion protein  32.26 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1026  secretion protein HlyD family protein  27.47 
 
 		 326 aa  107  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  31.32 
 
 		 461 aa  106  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  31.14 
 
 		 321 aa  105  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1351  HlyD family secretion protein  31.94 
 
 		 355 aa  105  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  30.49 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  30.2 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  27.35 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1498  secretion protein HlyD family protein  30.98 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  28.99 
 
 		 365 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2360  secretion protein HlyD family protein  30.98 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.451322  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  29.37 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  27.38 
 
 		 346 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  31.13 
 
 		 308 aa  102  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  27.69 
 
 		 332 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1685  secretion protein HlyD  34.29 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00216281  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>