More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2939 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  100 
 
 
329 aa  629  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  93.01 
 
 
329 aa  579  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  58.26 
 
 
336 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  60.31 
 
 
340 aa  348  8e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2591  transport system permease protein  59.38 
 
 
329 aa  325  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35861  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  52.94 
 
 
333 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  50.15 
 
 
333 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  47.78 
 
 
340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  47.78 
 
 
334 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  47.78 
 
 
334 aa  289  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  47.47 
 
 
340 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  47.78 
 
 
340 aa  287  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  47.47 
 
 
334 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  48.25 
 
 
322 aa  279  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  46.95 
 
 
347 aa  277  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  47.94 
 
 
322 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  48.73 
 
 
334 aa  276  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  48.73 
 
 
334 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  48.42 
 
 
334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  47.94 
 
 
334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1042  transport system permease protein  55.34 
 
 
335 aa  265  7e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0105  transport system permease protein  44.48 
 
 
331 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0101  transport system permease protein  44.48 
 
 
331 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000423595  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  40.36 
 
 
343 aa  246  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  45.45 
 
 
340 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2013  transport system permease protein  49.03 
 
 
343 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0139655  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  46.93 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  44.37 
 
 
342 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.42 
 
 
351 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0414  transport system permease protein  49.67 
 
 
335 aa  232  8.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  45.07 
 
 
334 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  43.65 
 
 
344 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  38.89 
 
 
334 aa  225  8e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  38.15 
 
 
351 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1968  transport system permease protein  41.74 
 
 
349 aa  222  6e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000115433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  38.15 
 
 
351 aa  222  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  38.15 
 
 
351 aa  221  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  38.15 
 
 
351 aa  221  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  38.15 
 
 
351 aa  221  9e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  38.15 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  37.74 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  37.85 
 
 
351 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  38.46 
 
 
350 aa  219  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  37.11 
 
 
335 aa  219  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  37.11 
 
 
335 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  36.79 
 
 
335 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  37.85 
 
 
351 aa  219  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  43.46 
 
 
358 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  36.79 
 
 
335 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  36.48 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  36.48 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  44.28 
 
 
347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  38.56 
 
 
334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  38.56 
 
 
334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  41.33 
 
 
353 aa  212  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  39.87 
 
 
341 aa  212  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2492  transport system permease protein  41.72 
 
 
340 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.3582 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3934  transport system permease protein  41.85 
 
 
352 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  37.42 
 
 
335 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2826  transport system permease protein  47.04 
 
 
347 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  37.11 
 
 
335 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  40.13 
 
 
347 aa  209  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  37.11 
 
 
335 aa  208  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2438  transport system permease protein  42.9 
 
 
363 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3734  transport system permease protein  42.72 
 
 
363 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  40 
 
 
350 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  40.91 
 
 
338 aa  205  9e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  34.59 
 
 
335 aa  205  9e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0692  transport system permease protein  40.74 
 
 
333 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0644  transport system permease protein  40 
 
 
342 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  42.86 
 
 
340 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19090  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  46.04 
 
 
355 aa  203  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0971068 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  40.38 
 
 
333 aa  202  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001070  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuC  46.5 
 
 
307 aa  202  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3730  transport system permease protein  39.51 
 
 
350 aa  202  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  41.33 
 
 
374 aa  202  8e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2581  transport system permease protein  43.42 
 
 
351 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  38.53 
 
 
332 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0356  transport system permease protein  42.53 
 
 
353 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  41.74 
 
 
347 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0851  transport system permease protein  37.62 
 
 
351 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0330  transport system permease protein  39.69 
 
 
338 aa  198  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0425  transport system permease protein  40 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.639871 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  40.06 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0338  ABC-type Fe3+-siderophore transport system inner membrane subunit  39.33 
 
 
366 aa  196  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552236  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1623  transport system permease protein  42.9 
 
 
354 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  37.87 
 
 
326 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2245  transport system permease protein  37.27 
 
 
343 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.148994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0446  iron compound ABC transporter, permease protein  39.08 
 
 
346 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2207  transport system permease protein  37.27 
 
 
343 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.748712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0319  ferrichrome transport system permease  39.38 
 
 
338 aa  193  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793105  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0329  transport system permease protein  36.25 
 
 
336 aa  192  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00182989  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  37.42 
 
 
335 aa  192  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3523  transport system permease protein  44.81 
 
 
341 aa  192  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0335  iron compound ABC transporter permease  39.08 
 
 
338 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000196235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0382  iron compound ABC transporter, permease protein  39.08 
 
 
346 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0322  ferrichrome transport system permease  39.08 
 
 
338 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000409712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0350  iron compound ABC transporter permease protein  39.08 
 
 
338 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36340  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  42.81 
 
 
368 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2318  transport system permease protein  43.06 
 
 
347 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>