167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2844 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2844  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
66 aa  137  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000226837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2691  protein of unknown function DUF1528  91.84 
 
 
282 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1374  transposase IS3/IS911 family protein  93.62 
 
 
96 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0140  transposase IS3/IS911 family protein  93.62 
 
 
96 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1583  transposase IS3/IS911 family protein  93.62 
 
 
96 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1704  transposase IS3/IS911 family protein  93.62 
 
 
96 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2162  transposase IS3/IS911 family protein  78.18 
 
 
96 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102712  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2538  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0719  transposase orfA, IS3 family  45.65 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.854293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3088  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18504  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1916  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
108 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407411  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0377  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2571  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00789723  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6484  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  47.92 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6111  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0567792  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6051  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  47.92 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  47.92 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  47.92 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4146  ISxac3 transposase  41.07 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4083  ISxac3 transposase  41.07 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151161  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C60  transposase  45.24 
 
 
357 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0664  transposase  45.24 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0849  transposase  45.24 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00575778  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0855  transposase  45.24 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0883  transposase  45.24 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.453287  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1037  transposase  45.24 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1086  transposase  45.24 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1672  transposase  45.24 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1412  transposase  45.24 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000502951  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  46.94 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1383  transposase IS3/IS911 family protein  41.3 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2752  transposase IS3/IS911 family protein  41.3 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.446829  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2757  transposase IS3/IS911 family protein  41.3 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3069  transposase IS3/IS911 family protein  41.3 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.480531  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4469  transposase IS3/IS911 family protein  41.3 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 
135 aa  43.9  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 
135 aa  43.9  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 
135 aa  43.9  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  41.94 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  41.94 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  44.68 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  32.31 
 
 
93 aa  42.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  32.31 
 
 
93 aa  42.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  41.3 
 
 
139 aa  42.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  48.78 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2278  transposase IS3/IS911  43.48 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  62.5 
 
 
280 aa  42.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  43.75 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  43.75 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5315  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.323663 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5574  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  32.31 
 
 
93 aa  42.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  32.31 
 
 
93 aa  42.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0419  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 
78 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  62.5 
 
 
280 aa  42.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3665  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0598755  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  62.5 
 
 
280 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2465  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  42.22 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7044  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2521  transposase IS3/IS911 family protein  42.5 
 
 
96 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 
98 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  40 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  38.98 
 
 
102 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  40 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  40.32 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  38.98 
 
 
102 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  40 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  40.32 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  40.32 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  40.32 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  40.32 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  40.32 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  40.32 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  40.32 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  40.32 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  40.32 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2121  IS66 family orf1  37.78 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  40 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  40 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  40 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  40 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  40 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  40 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>