44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2636 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2636  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  100 
 
 		 410 aa  825    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232716  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0632  galactoside permease  45.14 
 
 		 420 aa  352  8.999999999999999e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0846  galactoside permease  45.14 
 
 		 420 aa  351  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3381  galactoside permease  44.22 
 
 		 430 aa  347  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3115  galactoside permease  44.22 
 
 		 425 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0255021 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2657  galactoside permease  45.25 
 
 		 426 aa  336  5e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1330  galactoside permease  44.53 
 
 		 426 aa  330  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.800996  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1361  galactoside permease  46.03 
 
 		 420 aa  330  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.32292  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1767  galactoside permease  46.03 
 
 		 418 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0531388  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1680  galactoside permease  45.07 
 
 		 435 aa  323  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000567267  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2492  galactoside permease  45.07 
 
 		 435 aa  323  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2394  galactoside permease  44.8 
 
 		 435 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000789855  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0416  galactoside permease  43.65 
 
 		 417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0407  galactoside permease  43.65 
 
 		 417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00583816  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3282  galactoside permease  43.65 
 
 		 417 aa  320  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00177774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0374  galactoside permease  43.65 
 
 		 417 aa  320  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131183  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3263  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.65 
 
 		 417 aa  320  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0568399  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0367  galactoside permease  43.65 
 
 		 417 aa  320  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00932691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00297  galactoside permease  43.65 
 
 		 417 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0372048  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4076  galactoside permease  42.2 
 
 		 421 aa  320  3.9999999999999996e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3102  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  43.52 
 
 		 418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.186561 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2083  galactoside permease  40.69 
 
 		 419 aa  293  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51430  Proton/sugar symporter  38.32 
 
 		 437 aa  283  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51800  galactoside permease  38.31 
 
 		 427 aa  266  7e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2646  galactoside permease  33.25 
 
 		 415 aa  248  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3434  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  32.15 
 
 		 422 aa  243  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28670  galactoside permease  33.59 
 
 		 448 aa  229  6e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0124  galactoside permease  30.16 
 
 		 445 aa  200  5e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000688669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 391 aa  53.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  23.2 
 
 		 413 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  21.02 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  23.2 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  23.88 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2830  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.28 
 
 		 393 aa  47  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  22.4 
 
 		 412 aa  47  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  22.55 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  27.42 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4111  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  24.47 
 
 		 406 aa  43.9  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.14 
 
 		 379 aa  43.1  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>