More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2625 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  100 
 
 		 957 aa  1962    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  70.37 
 
 		 925 aa  1310    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  38.61 
 
 		 1004 aa  641    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  67.28 
 
 		 926 aa  1262    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  71.12 
 
 		 925 aa  1335    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  53.05 
 
 		 502 aa  485  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  45.36 
 
 		 1005 aa  473  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  42.75 
 
 		 597 aa  426  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  47.18 
 
 		 457 aa  415  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  47.19 
 
 		 464 aa  404  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  40.43 
 
 		 608 aa  397  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  45.54 
 
 		 465 aa  394  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  48.54 
 
 		 598 aa  391  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  45.13 
 
 		 598 aa  382  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  44.07 
 
 		 598 aa  379  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  46.87 
 
 		 593 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  43.97 
 
 		 596 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  45.33 
 
 		 589 aa  368  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  45.14 
 
 		 596 aa  363  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  43.98 
 
 		 596 aa  362  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  44.83 
 
 		 596 aa  361  5e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  44.83 
 
 		 596 aa  361  5e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  44.83 
 
 		 596 aa  361  5e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  44.83 
 
 		 596 aa  361  5e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  44.84 
 
 		 591 aa  360  6e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  41.56 
 
 		 589 aa  360  6e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  45.75 
 
 		 504 aa  360  7e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  42.82 
 
 		 596 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  43.06 
 
 		 596 aa  356  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  43.97 
 
 		 596 aa  356  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  44.18 
 
 		 596 aa  356  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  41.9 
 
 		 583 aa  355  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  43.97 
 
 		 596 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  43.97 
 
 		 596 aa  354  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  43.9 
 
 		 597 aa  353  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  39.95 
 
 		 588 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  38.89 
 
 		 589 aa  313  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0516  NADH:flavin oxidoreductase  38.67 
 
 		 372 aa  306  1.0000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1532  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.48 
 
 		 374 aa  302  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  35.43 
 
 		 582 aa  300  7e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  35.37 
 
 		 584 aa  300  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2008  NADH:flavin oxidoreductase  43.64 
 
 		 396 aa  298  3e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  35.9 
 
 		 609 aa  298  5e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf867  NADH-dependent flavin oxidoreductase  42.67 
 
 		 367 aa  295  2e-78  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  36.66 
 
 		 586 aa  294  6e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  36.43 
 
 		 586 aa  293  9e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  34.49 
 
 		 582 aa  292  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  37.2 
 
 		 599 aa  291  5.0000000000000004e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  35.86 
 
 		 582 aa  280  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0493  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.7 
 
 		 368 aa  276  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00242088  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  34.55 
 
 		 582 aa  275  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  34.55 
 
 		 582 aa  275  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  33.85 
 
 		 637 aa  272  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0837  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.84 
 
 		 377 aa  262  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  35.15 
 
 		 591 aa  261  3e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7286  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.87 
 
 		 384 aa  261  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.423648 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  33.45 
 
 		 616 aa  250  7e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2284  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.3 
 
 		 384 aa  249  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  33.12 
 
 		 668 aa  243  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  34.4 
 
 		 603 aa  240  9e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0325  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  35.68 
 
 		 380 aa  239  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000687106  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  31.28 
 
 		 650 aa  239  2e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0345  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  35.58 
 
 		 380 aa  237  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0352016  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10296  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05070)  33.97 
 
 		 484 aa  232  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  36.84 
 
 		 515 aa  229  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  36.84 
 
 		 515 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0975  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.68 
 
 		 375 aa  228  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0956  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.68 
 
 		 375 aa  228  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  35.92 
 
 		 515 aa  228  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  33.54 
 
 		 511 aa  227  6e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  30.7 
 
 		 631 aa  225  4e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.2 
 
 		 616 aa  224  8e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  30.97 
 
 		 635 aa  223  9.999999999999999e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  31.24 
 
 		 627 aa  222  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1866  NADH:flavin oxidoreductase  35.47 
 
 		 389 aa  222  3e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.151913  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0542  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  35.95 
 
 		 375 aa  221  5e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45689  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.99 
 
 		 478 aa  219  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  32.54 
 
 		 519 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  31.73 
 
 		 519 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  32.03 
 
 		 517 aa  213  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  31.14 
 
 		 587 aa  212  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  31.14 
 
 		 587 aa  212  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  29.65 
 
 		 519 aa  210  8e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  33.97 
 
 		 605 aa  211  8e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  32.77 
 
 		 561 aa  209  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  33.27 
 
 		 606 aa  208  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  30.47 
 
 		 510 aa  206  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  31.59 
 
 		 483 aa  206  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  30.04 
 
 		 659 aa  205  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  31.82 
 
 		 517 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  32.4 
 
 		 515 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  30.95 
 
 		 517 aa  201  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  30.21 
 
 		 517 aa  200  9e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  31.62 
 
 		 500 aa  197  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  30.2 
 
 		 517 aa  196  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  31.34 
 
 		 499 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  29.66 
 
 		 521 aa  189  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  30.82 
 
 		 505 aa  182  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 		 511 aa  181  4.999999999999999e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  29.69 
 
 		 507 aa  181  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>