112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2504 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  100 
 
 		 558 aa  1172    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  39.68 
 
 		 532 aa  391  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  38.45 
 
 		 523 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  38.7 
 
 		 514 aa  379  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.26 
 
 		 547 aa  372  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  37.37 
 
 		 553 aa  349  9e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  36.91 
 
 		 552 aa  343  5.999999999999999e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  36.62 
 
 		 537 aa  342  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.56 
 
 		 537 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.98 
 
 		 541 aa  332  8e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  35.02 
 
 		 541 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.57 
 
 		 539 aa  328  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.45 
 
 		 546 aa  329  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  35.12 
 
 		 550 aa  327  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.51 
 
 		 536 aa  326  6e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  37.04 
 
 		 540 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.22 
 
 		 559 aa  290  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  31.28 
 
 		 539 aa  278  2e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  28.44 
 
 		 512 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  29.2 
 
 		 581 aa  212  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  30.63 
 
 		 516 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  30.15 
 
 		 563 aa  207  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  29.03 
 
 		 519 aa  206  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  28.73 
 
 		 566 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  30.65 
 
 		 512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  29.39 
 
 		 497 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  27.94 
 
 		 636 aa  194  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.01 
 
 		 538 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  35.19 
 
 		 497 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.01 
 
 		 546 aa  182  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.46 
 
 		 515 aa  176  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  27.88 
 
 		 542 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.3 
 
 		 558 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  31.78 
 
 		 517 aa  171  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  28.35 
 
 		 498 aa  170  8e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  27.91 
 
 		 484 aa  167  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  26.84 
 
 		 492 aa  163  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.35 
 
 		 577 aa  159  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  27.24 
 
 		 571 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  26.96 
 
 		 496 aa  152  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  29.67 
 
 		 586 aa  151  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  26.4 
 
 		 556 aa  151  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.09 
 
 		 488 aa  150  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  32.93 
 
 		 451 aa  148  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  24.29 
 
 		 532 aa  143  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  24.2 
 
 		 536 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.56 
 
 		 562 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  27.88 
 
 		 537 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  28.71 
 
 		 591 aa  137  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  26.65 
 
 		 546 aa  133  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  25.39 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  23.21 
 
 		 551 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  29.32 
 
 		 526 aa  127  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  26.41 
 
 		 537 aa  127  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  27.03 
 
 		 534 aa  120  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  22.1 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  29.94 
 
 		 511 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  25.33 
 
 		 543 aa  114  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.71 
 
 		 540 aa  114  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  25.99 
 
 		 545 aa  113  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  25.16 
 
 		 522 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  25.27 
 
 		 535 aa  111  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  23.4 
 
 		 522 aa  110  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  23.67 
 
 		 547 aa  109  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  26.17 
 
 		 572 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  31.6 
 
 		 1338 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  24.24 
 
 		 525 aa  104  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  26.07 
 
 		 527 aa  100  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  22.58 
 
 		 650 aa  98.2  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  26.88 
 
 		 590 aa  94  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  30 
 
 		 1474 aa  82.8  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  23.54 
 
 		 665 aa  83.2  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  29.87 
 
 		 746 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 		 1195 aa  79.7  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  23.73 
 
 		 1585 aa  77.8  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  22.88 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  31.14 
 
 		 521 aa  76.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  23.53 
 
 		 797 aa  76.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  23.92 
 
 		 504 aa  75.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  28.15 
 
 		 530 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  24.27 
 
 		 501 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  31.22 
 
 		 365 aa  72.8  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  27.04 
 
 		 518 aa  72  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  29.34 
 
 		 518 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  28.1 
 
 		 522 aa  70.9  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  21.25 
 
 		 532 aa  70.5  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  21.47 
 
 		 691 aa  68.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  22.64 
 
 		 524 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  23.32 
 
 		 503 aa  65.5  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  21.18 
 
 		 495 aa  63.9  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  29.93 
 
 		 508 aa  62  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  26.76 
 
 		 901 aa  61.6  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  31.65 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02633  conserved hypothetical protein  35.05 
 
 		 110 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.947242 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  21.02 
 
 		 500 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  24.11 
 
 		 472 aa  54.7  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  24.77 
 
 		 789 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  23.62 
 
 		 357 aa  51.2  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  24.9 
 
 		 330 aa  50.4  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  21.3 
 
 		 580 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>