165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2464 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  42.67 
 
 
1211 aa  914    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  41.36 
 
 
1209 aa  877    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  41.23 
 
 
1205 aa  870    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  37.09 
 
 
1218 aa  706    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  41.44 
 
 
1209 aa  879    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  40.97 
 
 
1208 aa  883    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  41.33 
 
 
1209 aa  897    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  37.41 
 
 
1209 aa  754    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  60.25 
 
 
1212 aa  1509    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  36.44 
 
 
1220 aa  680    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  41.36 
 
 
1209 aa  877    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  41.36 
 
 
1209 aa  877    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  41.44 
 
 
1209 aa  879    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  37.41 
 
 
1199 aa  731    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  41.44 
 
 
1209 aa  879    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  41.36 
 
 
1209 aa  877    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  100 
 
 
1207 aa  2466    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  35.87 
 
 
1176 aa  657    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  35.77 
 
 
1171 aa  630  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  35.71 
 
 
1102 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  33.02 
 
 
1302 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  32.68 
 
 
1302 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  33.18 
 
 
1302 aa  569  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  32.86 
 
 
1302 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  32.52 
 
 
1302 aa  551  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  32.18 
 
 
1302 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  30.03 
 
 
1172 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  30.45 
 
 
1182 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  31.05 
 
 
1365 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  32.19 
 
 
1289 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  30.24 
 
 
1329 aa  504  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  32.19 
 
 
1289 aa  505  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  32.11 
 
 
1289 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  32.03 
 
 
1289 aa  502  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  30.2 
 
 
1268 aa  489  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  29.56 
 
 
1348 aa  476  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  28.95 
 
 
1181 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  29.59 
 
 
1181 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  30.92 
 
 
1175 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  28.64 
 
 
1164 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  31.78 
 
 
1204 aa  436  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  31.08 
 
 
1365 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  29.65 
 
 
1358 aa  436  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  31.19 
 
 
1152 aa  430  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  29.49 
 
 
1358 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  30.59 
 
 
1369 aa  425  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  29.46 
 
 
1176 aa  423  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  29.26 
 
 
1148 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  29.25 
 
 
1173 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  30.19 
 
 
1366 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  27.95 
 
 
1332 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  28.89 
 
 
1317 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  30.95 
 
 
1358 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  28.79 
 
 
1157 aa  393  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  27.81 
 
 
1275 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  27.81 
 
 
1275 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  27.95 
 
 
1150 aa  352  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  25.06 
 
 
1187 aa  326  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  26.56 
 
 
1192 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  26.62 
 
 
1168 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  25.67 
 
 
1182 aa  308  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  26.69 
 
 
1179 aa  301  5e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  25.85 
 
 
1179 aa  300  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  25.44 
 
 
1195 aa  298  6e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  25.78 
 
 
1270 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  26.89 
 
 
1175 aa  289  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  37.21 
 
 
1173 aa  283  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  26.83 
 
 
1175 aa  281  6e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  26.15 
 
 
1230 aa  279  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  26.57 
 
 
1008 aa  272  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  25.91 
 
 
1288 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  23.86 
 
 
1165 aa  271  7e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1885  ImcF-like family protein  24.55 
 
 
1164 aa  271  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0217268  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  24.3 
 
 
1165 aa  268  5e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  24.12 
 
 
1165 aa  268  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  25.39 
 
 
1297 aa  265  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  25.39 
 
 
1297 aa  265  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  33.33 
 
 
1315 aa  265  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  25.39 
 
 
1297 aa  265  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  25.39 
 
 
1297 aa  265  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  25.39 
 
 
1297 aa  265  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  25.39 
 
 
1297 aa  265  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  32.62 
 
 
1314 aa  258  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  32.62 
 
 
1314 aa  257  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  32.62 
 
 
1314 aa  257  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  25.72 
 
 
1297 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  33.17 
 
 
1313 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  32.68 
 
 
1313 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  25.7 
 
 
1301 aa  254  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  32.73 
 
 
1315 aa  254  9.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  26.36 
 
 
1205 aa  254  9.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0928  SciS protein  29.23 
 
 
890 aa  254  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1215  ImcF-like family protein  29.23 
 
 
890 aa  254  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0805  hypothetical protein  23.54 
 
 
1167 aa  253  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00300591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0717  hypothetical protein  23.54 
 
 
1167 aa  253  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.319931  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1026  hypothetical protein  23.54 
 
 
1167 aa  252  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170738  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2000  hypothetical protein  23.54 
 
 
1167 aa  252  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  34.24 
 
 
1313 aa  251  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  23.74 
 
 
1177 aa  251  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  23.74 
 
 
1177 aa  251  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>