36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2438 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2438  Protein of unknown function DUF2169  100 
 
 		 383 aa  796    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1192  hypothetical protein  31.76 
 
 		 447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3869  hypothetical protein  31.14 
 
 		 438 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0106797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01180  hypothetical protein  29.58 
 
 		 399 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.176675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0171  hypothetical protein  28.68 
 
 		 370 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2759  hypothetical protein  34.73 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2439  hypothetical protein  31.55 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.310656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2334  hypothetical protein  30.95 
 
 		 370 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00524729  normal  0.0110062 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2128  hypothetical protein  29.12 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0538  hypothetical protein  30.72 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4428  hypothetical protein  26.12 
 
 		 445 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3112  hypothetical protein  34.07 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192331  normal  0.139244 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7560  hypothetical protein  30.53 
 
 		 348 aa  116  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3467  hypothetical protein  33.7 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7055  hypothetical protein  28.1 
 
 		 356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0582367  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3186  hypothetical protein  24.93 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3484  hypothetical protein  28.1 
 
 		 330 aa  102  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4073  hypothetical protein  30.22 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125532 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3387  hypothetical protein  31.31 
 
 		 338 aa  94  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0291  hypothetical protein  26.3 
 
 		 337 aa  94  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1160  hypothetical protein  26.43 
 
 		 356 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.860855 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6142  hypothetical protein  34.06 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  28.26 
 
 		 976 aa  66.2  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05867  hypothetical protein  25.74 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3786  hypothetical protein  25.54 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2738  hypothetical protein  25.17 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000445  pentapeptide repeat family protein  24.51 
 
 		 330 aa  57  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  25.21 
 
 		 949 aa  52.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  24.29 
 
 		 862 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  24.29 
 
 		 825 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  24.29 
 
 		 825 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  24.29 
 
 		 825 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  24.29 
 
 		 825 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2827  hypothetical protein  24.66 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  24.29 
 
 		 825 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  24.29 
 
 		 825 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>