33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2422 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2422  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  263  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0369  hypothetical protein  35.88 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0352181  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0390  hypothetical protein  30.77 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1422  hypothetical protein  32.73 
 
 
123 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.6699 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1354  hypothetical protein  30.28 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1205  hypothetical protein  31.73 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.069384  hitchhiker  0.000375223 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1097  hypothetical protein  33.72 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458042  hitchhiker  0.00682906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0614  hypothetical protein  34.41 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2887  hypothetical protein  31.73 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.884859  hitchhiker  0.00000327359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0987  hypothetical protein  28.85 
 
 
126 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.411283  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0845  hypothetical protein  27.88 
 
 
150 aa  51.6  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3065  hypothetical protein  30.77 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  decreased coverage  0.0000000160498 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1243  hypothetical protein  28.85 
 
 
126 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.442213  normal  0.338722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1210  hypothetical protein  28.85 
 
 
126 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1166  hypothetical protein  28.85 
 
 
126 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.599086  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3147  hypothetical protein  28.85 
 
 
126 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00243141  normal  0.887855 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1019  hypothetical protein  31.73 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00054643  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0293  hypothetical protein  26.79 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000415499  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2969  hypothetical protein  29.81 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  unclonable  0.0000376275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2974  hypothetical protein  31.25 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534779  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01861  hypothetical protein  26.17 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1306  hypothetical protein  29.09 
 
 
113 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2943  hypothetical protein  31.46 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869989  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003821  hypothetical protein  25.93 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0228492  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1125  hypothetical protein  27.88 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0604212  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1291  hypothetical protein  24.07 
 
 
184 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0395  hypothetical protein  26.85 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2813  hypothetical protein  26.92 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.215215  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3246  hypothetical protein  34.02 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00395  hypothetical protein  30.68 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243677  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02428  hypothetical protein  23.08 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1760  hypothetical protein  23.14 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1921  hypothetical protein  29.35 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.743807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>