More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2367 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 268 aa  553  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.28 
 
 		 268 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.28 
 
 		 268 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  67.67 
 
 		 298 aa  374  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  36.88 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  38.49 
 
 		 270 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  36.23 
 
 		 270 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  36.43 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  36.43 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  36.09 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  36.79 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  38.43 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  36.43 
 
 		 291 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  36.43 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  36.25 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  38.85 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 		 272 aa  168  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  34.96 
 
 		 286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  36.07 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 		 291 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.06 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 		 275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  35.61 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  36.05 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  34.29 
 
 		 291 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  35.09 
 
 		 344 aa  159  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 268 aa  158  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  34.7 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  35.85 
 
 		 274 aa  155  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  35.93 
 
 		 284 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  39.37 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  33.21 
 
 		 272 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.89 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5364  short chain dehydrogenase  34.1 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  39.02 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  32.55 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  36.96 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.92 
 
 		 273 aa  143  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.45 
 
 		 271 aa  143  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  38.62 
 
 		 283 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 286 aa  142  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  34.84 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  38.31 
 
 		 278 aa  142  7e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.29 
 
 		 281 aa  141  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3447  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 		 268 aa  141  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.16 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158642  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.664099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3322  short chain dehydrogenase  34.66 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0896668  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0967  short chain dehydrogenase  33.96 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  34.44 
 
 		 276 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0984  short chain dehydrogenase  38.61 
 
 		 283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 273 aa  138  7.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 		 276 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  34.44 
 
 		 275 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  34.56 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  33.76 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  33.76 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  35.15 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  33.76 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  34.73 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  34.03 
 
 		 276 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.2 
 
 		 272 aa  135  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 		 268 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.81 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  34.73 
 
 		 277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 291 aa  135  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  32.23 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 		 267 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  32.91 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  37.75 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  31.02 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  30.6 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  31.14 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  32.91 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6137  short chain dehydrogenase  34.76 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  0.683407 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6530  short chain dehydrogenase  34.76 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.744865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1300  short chain dehydrogenase  34.76 
 
 		 268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 279 aa  132  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  34.82 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 		 267 aa  132  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>