279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2337 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2036  adenosine deaminase  93.77 
 
 
337 aa  657    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.96683  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2337  adenosine deaminase  100 
 
 
337 aa  693    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1904  adenosine deaminase  77.38 
 
 
337 aa  545  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2142  adenosine deaminase  75.07 
 
 
337 aa  529  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.757317  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2251  adenosine deaminase  77.88 
 
 
332 aa  523  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1993  adenosine deaminase  77.34 
 
 
334 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1878  adenosine deaminase  77.34 
 
 
334 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00582  adenosine deaminase  72.42 
 
 
334 aa  501  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001910  adenosine deaminase  71.82 
 
 
334 aa  498  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1711  adenosine deaminase  73.03 
 
 
333 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.804091  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1633  adenosine deaminase  73.03 
 
 
333 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201891  normal  0.583171 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1561  adenosine deaminase  73.03 
 
 
333 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000047707  normal  0.785767 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01592  adenosine deaminase  71.77 
 
 
333 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0859025  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2019  adenosine deaminase  71.77 
 
 
333 aa  490  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00584459  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2007  adenosine deaminase  71.77 
 
 
333 aa  490  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00173018  normal  0.960599 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1573  adenosine deaminase  72.73 
 
 
333 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  normal  0.320596 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1811  adenosine deaminase  72.07 
 
 
333 aa  490  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2335  adenosine deaminase  71.47 
 
 
333 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01582  hypothetical protein  71.77 
 
 
333 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0779462  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1698  adenosine deaminase  71.77 
 
 
333 aa  490  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1831  adenosine deaminase  71.77 
 
 
333 aa  490  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1879  adenosine deaminase  73.03 
 
 
333 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.402444  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1825  adenosine deaminase  71.52 
 
 
332 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0192108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1576  adenosine deaminase  71.17 
 
 
333 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859905  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2323  adenosine deaminase  70.81 
 
 
334 aa  478  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1455  adenosine deaminase  64.56 
 
 
333 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  60.74 
 
 
331 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  60.74 
 
 
331 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  60.43 
 
 
331 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3914  adenosine deaminase  60.43 
 
 
331 aa  413  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  60.43 
 
 
331 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0085  adenosine deaminase  61.47 
 
 
332 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.18641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4352  adenosine deaminase  59.51 
 
 
331 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4297  adenosine deaminase  58.9 
 
 
331 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3721  adenosine deaminase  61.96 
 
 
331 aa  403  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3627  adenosine deaminase  59.82 
 
 
331 aa  401  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4494  adenosine deaminase  59.2 
 
 
331 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.290189 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0046  adenosine deaminase  59.2 
 
 
331 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105714  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1979  adenosine deaminase  57.36 
 
 
331 aa  396  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0041  adenosine deaminase  59.88 
 
 
332 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2501  adenosine deaminase  35.47 
 
 
359 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0048  adenosine deaminase  34.97 
 
 
393 aa  186  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  34.86 
 
 
374 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0105  adenosine deaminase  33.94 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  34.04 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  33.64 
 
 
376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0116  adenosine deaminase  33.64 
 
 
376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  31.85 
 
 
366 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  30.75 
 
 
354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  32.83 
 
 
337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3524  adenosine deaminase  29.82 
 
 
331 aa  159  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4185  adenosine deaminase  33.72 
 
 
364 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  35.55 
 
 
348 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  31.31 
 
 
340 aa  153  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05460  adenosine deaminase  29.82 
 
 
363 aa  153  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0684  adenosine deaminase  31.96 
 
 
362 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.467946 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  31.31 
 
 
340 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3392  adenosine deaminase  29.14 
 
 
331 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2829  adenosine deaminase  28.79 
 
 
332 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  29.75 
 
 
353 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1121  adenosine deaminase  28.79 
 
 
331 aa  149  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  28.7 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0815  adenosine deaminase  33.04 
 
 
364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.407539 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0686  adenosine deaminase  30.41 
 
 
366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2515  adenosine deaminase  28.48 
 
 
332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0759  adenosine deaminase  31.58 
 
 
364 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  32.63 
 
 
346 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1279  Adenosine deaminase  31.96 
 
 
359 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5933  adenosine deaminase  29.5 
 
 
364 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  decreased coverage  0.0016274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  31.29 
 
 
366 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0321  adenosine deaminase  30.47 
 
 
344 aa  145  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.949208  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  29.5 
 
 
378 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1592  adenosine deaminase  30.52 
 
 
362 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0478787  normal  0.265955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4841  adenosine deaminase  31.1 
 
 
362 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.486752  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  31.15 
 
 
368 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  28.66 
 
 
345 aa  143  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  28.92 
 
 
354 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  30.7 
 
 
346 aa  143  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1770  adenosine deaminase  36.43 
 
 
332 aa  142  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  29.63 
 
 
338 aa  142  6e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  30.5 
 
 
316 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2563  adenosine deaminase  33.33 
 
 
367 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  28.75 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  26.46 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  29.88 
 
 
343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0629  adenosine deaminase  34.01 
 
 
328 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1362  adenosine deaminase  28.74 
 
 
360 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1027  adenosine deaminase  30.7 
 
 
371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.85452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  28.97 
 
 
316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  29.39 
 
 
375 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  31.58 
 
 
343 aa  139  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  30.15 
 
 
329 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0385  adenosine deaminase  30.06 
 
 
336 aa  139  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.0257625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1233  adenosine deaminase  29.94 
 
 
362 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1250  adenosine deaminase  29.94 
 
 
362 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0831  adenosine deaminase  31.96 
 
 
360 aa  138  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.557389  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  30.21 
 
 
350 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2485  adenosine deaminase  29.65 
 
 
339 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1259  adenosine deaminase  29.94 
 
 
362 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  38.94 
 
 
360 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.482782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>