More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2320 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2320  electron transport complex RsxE subunit  100 
 
 		 235 aa  461  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2020  electron transport complex RsxE subunit  94.89 
 
 		 235 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2159  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  82.81 
 
 		 230 aa  371  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1900  electron transport complex RsxE subunit  85.19 
 
 		 233 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000164726  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2012  electron transport complex RsxE subunit  85.19 
 
 		 233 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00017811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2248  electron transport complex RsxE subunit  85.19 
 
 		 233 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000887941  normal  0.482499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2235  electron transport complex RsxE subunit  81.02 
 
 		 232 aa  357  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000336445 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1921  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  80.72 
 
 		 231 aa  353  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1564  electron transport complex RsxE subunit  78.63 
 
 		 230 aa  341  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.257712  normal  0.0772811 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1552  electron transport complex RsxE subunit  78.21 
 
 		 230 aa  339  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1720  electron transport complex RsxE subunit  78.21 
 
 		 230 aa  339  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208116  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1624  electron transport complex RsxE subunit  78.21 
 
 		 230 aa  339  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  normal  0.350823 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1888  electron transport complex RsxE subunit  77.78 
 
 		 230 aa  336  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.184564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1816  electron transport complex RsxE subunit  78.83 
 
 		 228 aa  331  6e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0219521  decreased coverage  0.000344211 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1841  electron transport complex RsxE subunit  79.45 
 
 		 231 aa  330  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000217086  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1567  electron transport complex RsxE subunit  79.45 
 
 		 231 aa  330  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.276457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1821  electron transport complex RsxE subunit  79.45 
 
 		 231 aa  330  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8848  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2344  electron transport complex RsxE subunit  79.45 
 
 		 231 aa  330  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00490465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0533  electron transport complex RsxE subunit  72.22 
 
 		 230 aa  322  4e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000076694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01602  NADH-ubiquinone oxidoreductase  80.19 
 
 		 231 aa  322  4e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00455055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2009  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  80.19 
 
 		 231 aa  322  4e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206921  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01592  hypothetical protein  80.19 
 
 		 231 aa  322  4e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00529631  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1997  electron transport complex RsxE subunit  80.19 
 
 		 231 aa  322  4e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0507177  normal  0.141925 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1708  electron transport complex RsxE subunit  80.19 
 
 		 231 aa  322  4e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0245386  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1867  electron transport complex RsxE subunit  70.83 
 
 		 228 aa  317  7.999999999999999e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02969  electron transport complex RsxE subunit  68.98 
 
 		 230 aa  308  5.9999999999999995e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002944  electron transport complex protein RnfE  69.44 
 
 		 230 aa  307  9e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0179212  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2194  electron transport complex RsxE subunit  67.61 
 
 		 263 aa  298  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2278  electron transport complex RsxE subunit  67.58 
 
 		 232 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316323  normal  0.959617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2060  electron transport complex RsxE subunit  67.58 
 
 		 232 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000214893  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2107  electron transport complex RsxE subunit  67.58 
 
 		 232 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4550  electron transport complex RsxE subunit  67.58 
 
 		 232 aa  295  6e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2264  electron transport complex RsxE subunit  67.58 
 
 		 232 aa  295  6e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000442718  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2173  electron transport complex RsxE subunit  66.97 
 
 		 232 aa  293  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.303807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1868  electron transport complex RsxE subunit  65.75 
 
 		 231 aa  292  4e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1845  electron transport complex RsxE subunit  66.51 
 
 		 232 aa  291  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000056167  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2069  electron transport complex RsxE subunit  66.51 
 
 		 232 aa  291  6e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00102029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1906  electron transport complex RsxE subunit  66.51 
 
 		 232 aa  291  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2177  electron transport complex RsxE subunit  65.16 
 
 		 231 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.206237  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2358  electron transport complex RsxE subunit  66.06 
 
 		 231 aa  286  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2071  electron transport complex RsxE subunit  64.09 
 
 		 232 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1835  electron transport complex RsxE subunit  65 
 
 		 232 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.521191  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2513  electron transport complex RsxE subunit  64.22 
 
 		 232 aa  285  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1064  electron transport complex RsxE subunit  67 
 
 		 218 aa  282  2.0000000000000002e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0737938  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2970  electron transport complex RsxE subunit  60.68 
 
 		 232 aa  278  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2039  electron transport complex RsxE subunit  64.32 
 
 		 236 aa  278  7e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2561  electron transport complex RsxE subunit  65.26 
 
 		 232 aa  275  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.428281  normal  0.0236645 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0733  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  60.19 
 
 		 230 aa  258  7e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02734  NADH-ubiquinone oxidoreductase  57.83 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1540  electron transport complex RsxE subunit  57.92 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1795  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  59 
 
 		 230 aa  241  5e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.680327  hitchhiker  0.000244527 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2898  electron transport complex RsxE subunit  54.79 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.594329  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2631  electron transport complex RsxE subunit  57.14 
 
 		 228 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.854749  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1170  electron transport complex RsxE subunit  59.15 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0933  electron transport complex RsxE subunit  54.09 
 
 		 238 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1031  electron transport complex RsxE subunit  53.92 
 
 		 243 aa  227  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000559383  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2020  electron transport complex RsxE subunit  54.93 
 
 		 225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3197  electron transport complex RsxE subunit  51.5 
 
 		 244 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.113387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0723  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  53.49 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12428  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50930  Electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  54.07 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3197  electron transport complex RsxE subunit  48.07 
 
 		 244 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.0099576  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19220  electron transport complex RsxE subunit  53.59 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18890  electron transport complex RsxE subunit  57.14 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0559311  normal  0.0454317 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3936  electron transport complex RsxE subunit  48.07 
 
 		 244 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000255424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2819  electron transport complex RsxE subunit  51.33 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1399  electron transport complex RsxE subunit  52.88 
 
 		 235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2405  electron transport complex RsxE subunit  55.83 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.561649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3237  electron transport complex RsxE subunit  49.77 
 
 		 239 aa  205  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.205198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0260  electron transport complex RsxE subunit  54 
 
 		 202 aa  203  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0288  electron transport complex RsxE subunit  52.17 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1635  electron transport complex RsxE subunit  54.95 
 
 		 239 aa  198  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0677  electron transport complex RsxE subunit  48.36 
 
 		 200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1158  electron transport complex RsxE subunit  46.26 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1782  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  50.23 
 
 		 231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0701  electron transport complex RsxE subunit  48.36 
 
 		 200 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.647588  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0685  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  47.73 
 
 		 222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.360116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0082  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  46.51 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0420224  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1490  electron transport complex RsxE subunit  45.63 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0811  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  54 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.586167  normal  0.660499 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0390  electron transport complex RsxE subunit  44.44 
 
 		 217 aa  189  4e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2994  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  46.4 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1319  electron transport complex RsxE subunit  45.45 
 
 		 222 aa  185  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.175799  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1574  electron transport complex RsxE subunit  49.06 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0333623  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0345  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  50.26 
 
 		 239 aa  181  7e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0307  electron transport complex RsxE subunit  46.95 
 
 		 196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1532  electron transport complex RsxE subunit  45.12 
 
 		 201 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0221423  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1241  electron transport complex RsxE subunit  49.48 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0613  electron transport complex RsxE subunit  52.31 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0519  electron transport complex RsxE subunit  45.79 
 
 		 223 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1158  electron transport complex RsxE subunit  45.93 
 
 		 200 aa  174  8e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.252127 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0696  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  44.23 
 
 		 235 aa  174  9e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.682533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0214  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  43.11 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000178696  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1084  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  46.48 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0652551 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1957  electron transport complex RsxE subunit  44.04 
 
 		 239 aa  172  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.875572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2433  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  42.22 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109684  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1313  electron transport complex RsxE subunit  43.93 
 
 		 200 aa  169  4e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.860019  normal  0.240269 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0062  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  43.75 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0584  electron transport complex RsxE subunit  43.27 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2827  electron transport complex RsxE subunit  45.27 
 
 		 200 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0497  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  45.15 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000269706  hitchhiker  0.000180019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>