282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2318 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  76.73 
 
 		 502 aa  787    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  76.48 
 
 		 500 aa  780    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  76.89 
 
 		 500 aa  782    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  76.69 
 
 		 500 aa  781    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  76.69 
 
 		 500 aa  781    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  77.55 
 
 		 501 aa  795    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2233  putative tripeptide transporter permease  79.52 
 
 		 506 aa  795    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  76.48 
 
 		 500 aa  781    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  77.55 
 
 		 501 aa  795    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  76.69 
 
 		 500 aa  781    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  77.76 
 
 		 501 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  77.55 
 
 		 501 aa  795    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1778  putative tripeptide transporter permease  80.37 
 
 		 501 aa  793    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  80.33 
 
 		 511 aa  791    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  76.69 
 
 		 500 aa  781    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  100 
 
 		 506 aa  1023    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2548  putative tripeptide transporter permease  80.59 
 
 		 488 aa  776    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  95.97 
 
 		 506 aa  967    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  76.89 
 
 		 500 aa  782    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  77.76 
 
 		 501 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  76.69 
 
 		 500 aa  781    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  57.61 
 
 		 514 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  56.34 
 
 		 495 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03345  predicted transporter  51.33 
 
 		 489 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0219  amino acid/peptide transporter  51.33 
 
 		 489 aa  503  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3826  inner membrane transporter YhiP  51.33 
 
 		 489 aa  503  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3785  inner membrane transporter YhiP  51.33 
 
 		 489 aa  502  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3978  inner membrane transporter YhiP  51.33 
 
 		 489 aa  503  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3696  inner membrane transporter YhiP  51.33 
 
 		 489 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4843  inner membrane transporter YhiP  51.13 
 
 		 489 aa  502  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03298  hypothetical protein  51.33 
 
 		 489 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.240113  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0220  inner membrane transporter YhiP  51.33 
 
 		 489 aa  503  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3785  inner membrane transporter YhiP  51.25 
 
 		 490 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0323752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3862  inner membrane transporter YhiP  51.46 
 
 		 490 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3966  inner membrane transporter YhiP  51.46 
 
 		 490 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.826151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3795  inner membrane transporter YhiP  51.46 
 
 		 490 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3905  inner membrane transporter YhiP  51.46 
 
 		 490 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2720  hypothetical protein  46.32 
 
 		 500 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2851  hypothetical protein  46.11 
 
 		 500 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1525  di-/tripeptide transporter  47.05 
 
 		 528 aa  423  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0251804  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0652  tripeptide permease TppB  46.84 
 
 		 504 aa  419  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.068993  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  39.75 
 
 		 507 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3089  amino acid/peptide transporter  39.35 
 
 		 516 aa  353  5e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000368989  normal  0.0911268 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2910  amino acid/peptide transporter  39.35 
 
 		 516 aa  352  7e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.380758  normal  0.476442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2992  amino acid/peptide transporter  39.35 
 
 		 516 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0360187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3261  amino acid/peptide transporter  40.08 
 
 		 506 aa  352  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0234728 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1102  amino acid/peptide transporter  38.25 
 
 		 546 aa  348  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1117  amino acid/peptide transporter  39.11 
 
 		 523 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3183  amino acid/peptide transporter  39.84 
 
 		 517 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0376329 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1277  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  38.09 
 
 		 516 aa  343  4e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1177  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  39.26 
 
 		 506 aa  343  4e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.980946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1174  amino acid/peptide transporter  38.74 
 
 		 521 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1207  amino acid/peptide transporter  39.71 
 
 		 517 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0390922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0759  major facilitator superfamily peptide/H(+)symporter  37.78 
 
 		 513 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4728  amino acid/peptide transporter  40.31 
 
 		 506 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0113  amino acid/peptide transporter  39.63 
 
 		 506 aa  340  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2221  amino acid/peptide transporter  39.35 
 
 		 551 aa  339  5e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5415  amino acid/peptide transporter  38.32 
 
 		 506 aa  338  9e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4868  amino acid/peptide transporter  38.32 
 
 		 507 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1255  amino acid/peptide transporter  38.63 
 
 		 551 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3023  amino acid/peptide transporter  38.88 
 
 		 500 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2907  amino acid/peptide transporter  38.88 
 
 		 500 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0348  amino acid/peptide transporter  38.68 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.781642  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0382  amino acid/peptide transporter  38.68 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1531  amino acid/peptide transporter  38.68 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1721  amino acid/peptide transporter  38.68 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97984  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4440  amino acid/peptide transporter  37.78 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5316  amino acid/peptide transporter  40.09 
 
 		 506 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179594  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5544  amino acid/peptide transporter  40.09 
 
 		 506 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1189  amino acid/peptide transporter  35.59 
 
 		 501 aa  242  9e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.500547 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  29.88 
 
 		 492 aa  234  3e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  30.16 
 
 		 516 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  29.46 
 
 		 492 aa  232  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  30 
 
 		 527 aa  231  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  29.8 
 
 		 499 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  27.68 
 
 		 494 aa  226  9e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  29.56 
 
 		 544 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  30.83 
 
 		 516 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  27.43 
 
 		 534 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  31.16 
 
 		 510 aa  213  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  29.18 
 
 		 509 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  29.01 
 
 		 497 aa  212  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  29.76 
 
 		 497 aa  209  8e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  30.02 
 
 		 490 aa  209  9e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  27.47 
 
 		 479 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  29.58 
 
 		 490 aa  207  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  31.16 
 
 		 510 aa  207  5e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  28.87 
 
 		 501 aa  205  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  31.14 
 
 		 462 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0783  di/tripeptide transporter homolog IraB  30.82 
 
 		 502 aa  205  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  30.43 
 
 		 462 aa  203  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0812  di/tripeptide transporter homolog IraB  30.55 
 
 		 502 aa  203  6e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  29.57 
 
 		 491 aa  203  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  28.66 
 
 		 489 aa  201  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  28.38 
 
 		 489 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  28.38 
 
 		 489 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  28.57 
 
 		 489 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  28.1 
 
 		 496 aa  200  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  27.36 
 
 		 497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2936  inner membrane transporter YbgH  31.49 
 
 		 486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>