More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2229 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 
233 aa  472  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  91.85 
 
 
233 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  77.59 
 
 
233 aa  368  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  74.25 
 
 
233 aa  360  8e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  73.39 
 
 
233 aa  347  7e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  70.69 
 
 
232 aa  338  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  70.69 
 
 
232 aa  338  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  70.69 
 
 
232 aa  338  4e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  67.39 
 
 
231 aa  326  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  69.13 
 
 
231 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  67.39 
 
 
231 aa  326  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  69.13 
 
 
231 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  69.13 
 
 
231 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  67.39 
 
 
231 aa  326  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  67.39 
 
 
231 aa  326  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  67.39 
 
 
231 aa  325  3e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  67.39 
 
 
231 aa  325  3e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  66.96 
 
 
231 aa  325  5e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  69.13 
 
 
231 aa  325  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  69.13 
 
 
231 aa  325  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  67.39 
 
 
231 aa  324  6e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  66.96 
 
 
231 aa  324  9e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  65.5 
 
 
231 aa  310  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  56.65 
 
 
233 aa  268  7e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  55.79 
 
 
233 aa  265  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  55.79 
 
 
233 aa  261  6.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  57.98 
 
 
237 aa  256  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0447  glycoprotease family protein  51.68 
 
 
232 aa  229  3e-59  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  53.28 
 
 
227 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  53.1 
 
 
224 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  48.73 
 
 
239 aa  220  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  52.65 
 
 
224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  52.65 
 
 
224 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  52.4 
 
 
224 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  51.33 
 
 
224 aa  214  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  50 
 
 
224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  50.43 
 
 
236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  50 
 
 
236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  47.62 
 
 
239 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  49.78 
 
 
224 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  48.28 
 
 
236 aa  210  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  50.62 
 
 
238 aa  209  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2808  peptidase M22, glycoprotease  49.79 
 
 
234 aa  209  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  49.78 
 
 
233 aa  209  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  49.14 
 
 
237 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  49.14 
 
 
237 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  49.14 
 
 
237 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  48.32 
 
 
247 aa  208  7e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  49.14 
 
 
237 aa  207  8e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  48.07 
 
 
236 aa  206  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  48.07 
 
 
234 aa  206  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  48.71 
 
 
236 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  48.03 
 
 
238 aa  205  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  46.72 
 
 
239 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16710  hypothetical protein  49.78 
 
 
226 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016316  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1453  hypothetical protein  49.78 
 
 
226 aa  198  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  46.58 
 
 
237 aa  198  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  47.6 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  45.61 
 
 
228 aa  192  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  47.48 
 
 
236 aa  191  7e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1257  peptidase M22 glycoprotease  46.35 
 
 
235 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.924937 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39270  Peptidase M22, glycoprotease  51.77 
 
 
225 aa  188  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2231  peptidase M22, glycoprotease  48.1 
 
 
233 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.391268  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1410  peptidase M22 glycoprotease  47 
 
 
266 aa  174  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  46.02 
 
 
228 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  41.85 
 
 
223 aa  162  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  41.6 
 
 
237 aa  160  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1731  peptidase M22, glycoprotease  42.6 
 
 
220 aa  159  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.978366  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1458  non-proteolytic protein, peptidase family M22  38.01 
 
 
226 aa  158  8e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1527  M22 peptidase homolog yeaZ  37.56 
 
 
226 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306852  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01598  glycoprotease family protein  41.41 
 
 
239 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0784  peptidase M22 glycoprotease  40.71 
 
 
229 aa  149  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318216  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0872  hypothetical protein  40.71 
 
 
229 aa  148  6e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000381298  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1193  peptidase M22, glycoprotease  46.05 
 
 
229 aa  148  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  38.59 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2233  peptidase  37.39 
 
 
235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000143948  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  40.79 
 
 
231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3092  peptidase M22 glycoprotease  40.87 
 
 
237 aa  142  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  40.52 
 
 
223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  42.01 
 
 
222 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  42.01 
 
 
222 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  40.52 
 
 
223 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  39.46 
 
 
229 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1240  peptidase M22 glycoprotease  38.37 
 
 
246 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1582  glycoprotease family protein  37.1 
 
 
256 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2610  glycoprotease family protein  37.1 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0540  peptidase M22, glycoprotease  34.89 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714565  unclonable  0.00000000126844 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1654  peptidase M22, glycoprotease  35.54 
 
 
267 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786528  decreased coverage  0.00849888 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2465  glycoprotease family protein  36.99 
 
 
249 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1268  peptidase M22, glycoprotease  36.4 
 
 
223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2521  glycoprotease family protein  36.99 
 
 
249 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3228  glycoprotease family protein  36.99 
 
 
249 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2084  glycoprotease family protein  36.99 
 
 
249 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113679  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1357  glycoprotease family protein  36.99 
 
 
249 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0779357  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2001  glycoprotease family protein  36.89 
 
 
252 aa  124  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274689  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1232  peptidase M22 glycoprotease  37.45 
 
 
255 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  0.181812 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2483  peptidase M22 glycoprotease  37.66 
 
 
276 aa  121  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.318654  hitchhiker  0.00075041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2257  peptidase M22 glycoprotease  36.89 
 
 
230 aa  122  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0733925  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1367  putative transmembrane protein  38.53 
 
 
243 aa  121  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.742517  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1395  peptidase M22, glycoprotease  35.5 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.834993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>