51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2068 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  100 
 
 		 188 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  90.96 
 
 		 188 aa  349  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  64.71 
 
 		 185 aa  244  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  62.23 
 
 		 192 aa  235  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  62.9 
 
 		 182 aa  233  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  62.9 
 
 		 182 aa  233  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  61.7 
 
 		 192 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  61.7 
 
 		 192 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  58.51 
 
 		 188 aa  222  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000157242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  55.08 
 
 		 187 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  55.08 
 
 		 187 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  55.08 
 
 		 187 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  55.08 
 
 		 187 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  54.55 
 
 		 187 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  56.38 
 
 		 187 aa  207  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000482452  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  56.38 
 
 		 187 aa  206  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000251515  hitchhiker  0.00000297897 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  56.38 
 
 		 187 aa  206  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000042581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  56.38 
 
 		 187 aa  206  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000185697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  56.38 
 
 		 187 aa  206  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000240203  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  56.38 
 
 		 187 aa  206  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000327636  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  56.38 
 
 		 187 aa  206  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  57.87 
 
 		 182 aa  204  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000276204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  57.87 
 
 		 182 aa  204  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  52.72 
 
 		 186 aa  185  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1653  protein of unknown function DUF330  51.6 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  32.46 
 
 		 192 aa  101  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  32.45 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  34.03 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  92  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  32.39 
 
 		 221 aa  91.3  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1866  hypothetical protein  33.16 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  32.97 
 
 		 211 aa  87  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  28.96 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  30.39 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  34.27 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2075  hypothetical protein  27.98 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00929812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2931  hypothetical protein  26.55 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3500  hypothetical protein  29.44 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  22.87 
 
 		 241 aa  48.5  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  26.6 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  29.05 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  24.48 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  27.66 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  32.98 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  27.21 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1703  hypothetical protein  26.13 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  22.96 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  31.91 
 
 		 222 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  23.91 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  28.33 
 
 		 207 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  31.86 
 
 		 211 aa  41.2  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>